Illumina公司BeadChip型发展

Illumina公司公司已经宣布,它正在与合作维尔康姆基金会桑格研究所(WTSI)和威康信托基金会病例对照联盟(WT-CCC)的设计定制Sentrix®BeadChip将使研究人员研究那些引起氨基酸变化的单核苷酸多态性的影响(非同义),范围广泛而深入的疾病样本。

WTSI将使用BeadChip学习四种常见疾病表型与普通控制作为WT-CCC的一部分。

BeadChip配置将使六个样品的分析同时在一个微阵列,研究15000个snp,使用Illumina公司的英飞纳姆™试验。

英飞纳姆试验允许调查人员与话费查询整个基因组,重现性和相关性能指标与Illumina公司的GoldenGate®试验协议。

英飞纳姆试验使几乎不受约束的,聪明的SNP BeadChip数组内容的选择。

内容Sentrix cSNP-6 BeadChip将主要由非同义,编码snp从人类基因组单体型图计划中选择。

非同义snp位于基因的编码区域,导致氨基酸的变化相应的蛋白质。

因此,这些候选人功能SNPs——作为一个类别——更有可能影响比其他常见疾病易感性基因(除了基因表达调控序列仍有待定义),因此,有较高的实验值。

鉴于雄心勃勃的非同义单核苷酸多态性研究的规模和进度,WTSI购买额外的扫描仪,自动化和LIMS(实验室信息管理系统)的能力进一步提高研究所的BeadLab样品处理量,一个大规模的、端到端基因分析实验室,利用Illumina公司BeadArray™技术。

根据帕诺斯博士Deloukas, WTSI的资深研究员,“我们计划与非同义单核苷酸多态性基因型5000多个样本BeadChip在病例对照研究设计。”

“我们的计划是在今年年底,完成数据生产目标通过Illumina公司多试样的芯片。”

“非同义snp可能是早期生产的目标在我们寻求理解这些常见疾病的遗传因素。”

WTSI完成项目后使用BeadChip pcr, Illumina公司打算把自定义SNP产品变成标准的微阵列提供,届时该公司将提供细节轨迹选择和序列信息。

“我们非常高兴地与WTSI扩展我们的长期关系,”杰弗,Illumina公司总裁兼首席执行官。

“我们联合开发SNP阵列不仅提供了实验值高,它还凸显了我们的BeadArray技术的灵活性,特别是BeadChip格式。”

“非同义SNP-6 BeadChip pcr将成为第一个多试样微阵列产品利用我们的英飞纳姆化验。”