LincRNA描绘目标对准病变组织

我们的遗传密码包括超过15000可以制成的特定部分被称为lincRNAs分子。其中的一些部分可以发生在我们的基因称为TADs盘绕起来的部分。LincRNAs源自TADs似乎作为标记指示特定的组织内。在这些组织中有错误时,标记可以帮助有针对性的医疗干预。发现这本小说功能的团队有这个想法提出一种适用于不同疾病,证明心脏病称为肥厚性心肌病。

疾病可以影响我们的身体的非常具体的组织,但目前的治疗往往不加区别的地区的影响。由于这个原因,有很多研究领域的医学走向更具体有针对性的治疗。大道之一的研究在于探索相对最近发现部分称为长基因间的遗传编码的非编码rna,或lincRNAs。lincRNAs复制的地区在我们的基因组,或转录,曾经被称为垃圾DNA,但越来越多的研究表明,这些都是垃圾。

“最近,我感觉驱动发现是什么让lincRNA不同于信使RNA越熟悉,这是用来制造,或表达,蛋白质,”Yu说Hamba Tsunoda实验室东京大学的生物科学部门。“我想全面描述机制,解释了特异性的差异之间的表达式类型的RNA。而必然信使rna合成蛋白质,lincRNAs似乎可以不使蛋白质和它们表达的更具体些。通过不同的分子的表达,lincRNAs控制许多不同的生物过程,如某些基因活动,表达出错时,它可以显示疾病的存在。”

Hamba和她的团队探索一些15000种已知lincRNAs的方式表达。观察早些时候,他们的研究结果证实lincRNA表情更依赖于组织中含有比信使RNA表达。但更有趣的是,研究人员还发现,这种特异性进一步加强了在lincRNA来自基因组的特定部分。我们的基因组是一长串遗传信息,但这通常是盘绕成复杂三维形状称为染色体拓扑关联域,或者TADs。LincRNAs转录从这些盘绕TADs更可能产生这些区域以外的组织比LincRNAs表达式。

“武装的知识去哪里寻找这些高度组织lincRNA标记,我们提出一个分析框架解释lincRNA指标不同组织的性质,“Hamba说。“作为一个实验,我们已经我们的框架应用于心脏病肥厚性心肌病(心肌增厚的),发现是什么原因导致的异常表达角蛋白的蛋白质导致疾病。我希望我们现在可以进一步探索这个领域,找到一些潜在的异常表达的产品可能导致诸如肿瘤。”

参考:Hamba Y, Kamatani T,米亚F, Boroevich KA, Tsunoda T .拓扑关联域构成组织长基因间非编码rna的具体表达式。iScience。2023;0 (0)。doi:10.1016 / j.isci.2023.106640

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