为提高分子间相互作用数据访问机制

五个主要的分子相互作用数据库的执行团队已经宣布签署一项协议,共享管理努力和交换完成记录通过一种机制被称为国际分子交换(IMEx)财团。

IMEx旨在提供一个稳定的网络,同步和自由访问的数据库,并将作为共同捕捉所有分子间相互作用数据发表在类似全球协作的方式对蛋白质和DNA序列和大分子结构。

”在决定映射定义生命本身的双分子的相互作用,一个迅速意识到如何艰巨的任务我们为自己设置,“Henning Hermjakob说,首席研究员的完整的分子相互作用数据库EMBL的欧洲生物信息学研究所。

然而,他补充说,“一直以来,我们认为这个项目是我们自己的组织之间的协作任务和全球科学界。因此,它完美的意义结合我们的努力与我们的同事在其他中心工作。”

“每个IMEx伙伴带来特定的技能表,”克里斯•霍格表示绑定的首席研究员。他补充说,“和累积的努力应该导致一个包罗万象的数据库,这是更广泛的比任何个人的努力在范围和更深层次的信息,科学家们可以用它来更好地理解健康和疾病问题或开发新的药物和治疗。”

加入IMEx,每个数据库将提供和交换数据根据一系列规则,描述格式,可用性和适用性的标准数据,以及地址数据提交过程,数据交换和所有权问题,IMEx实现和组织。

根据协议,IMEx合作伙伴将提供数据,满足人类蛋白质组组织的倡议(PSI)分子间相互作用蛋白质组学标准格式,这些数据将会免费提供给所有用户,是否为直接使用或再分配。

同样,很少有例外,所有数据将被发表在同行评审的媒介支持,来自实验室的实验。IMEx财团还将进一步发展共同管理标准》,将允许每个中心生产数据相同的高标准。

“这些规则对这种合作的成功至关重要,”詹尼·Cesareni解释说,薄荷的首席研究员。他补充说,“在过去,科学家们一直在人质到不同的术语和报告格式在不同的数据库中。”他进一步说,“通过简单的指导方针,IMEx伙伴为科学家们提供了机会,他们可以为他们的研究成果得到最好的价值。”