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基于抗体阵列的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)材料提取蛋白混合物表达水平的ULS标记分析
从7岁的b细胞淋巴瘤和乳腺癌FFPE样本中提取蛋白,然后进行ULS标记。样品使用定制抗体阵列进行单色或双色分析。我们观察了几种捕获的分析物的差异表达水平。在b细胞淋巴瘤中,检测到预期高水平的IgM,而在乳腺癌组织中发现了高水平的CA19-9,这是一种假定的标记。
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基于抗体阵列的福尔马林- ffxed石蜡包埋(FFPE)材料蛋白混合物表达水平的ULS标记分析
从7岁的b细胞淋巴瘤和乳腺癌FFPE样本中提取蛋白,然后进行ULS标记。样品使用定制抗体阵列进行单色或双色分析。我们观察了几种捕获的分析物的差异表达水平。在b细胞淋巴瘤中,检测到预期高水平的IgM,而在乳腺癌组织中发现了高水平的CA19-9,这是一种假定的标记。
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具有不同转移器官特异性潜能的乳腺癌细胞系MDA-1833和MDA-4175的2-DE分析及与亲本细胞系MDA-MB-231的比较
乳腺癌有不同的转移行为。J. Massague的研究小组通过在体内选择MDA-MB-231细胞,分离出向骨(1833)或肺(4175)转移能力增强的细胞亚群。我们对细胞系进行了2-DE分析。我们发现并鉴定了11个差异表达蛋白点。
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辅抑制因子异体蛋白-蛋白相互作用的检测
该对应物Alien被证明与几种参与转录调节、DNA修复和细胞周期的蛋白质相互作用。此外,我们还发现Alien过表达下调了E2F1的转录。
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失代偿性肝病患者全身内源性一氧化氮的产生
一氧化氮(NO)生成的增加与晚期肝病患者高动力循环的发病机制有关。肝脏疾病患者与对照组在全身no生成方面无差异。我们的结果,在一组具有良好特征的患者中,反对失代偿性肝病患者更大的基础nos依赖性全身NO生成。
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MS- xelerator™:用于生物标志物发现、差异分析和定量蛋白质组学的LC/MS数据处理的高级算法
基于LC-MS的蛋白质组学实验用于在多种条件下比较复杂的生物样品。需要快速,强大的计算工具来探索和检测表达蛋白质组学和生物标记物发现领域的差异。一般来说,需要专门的步骤来解决这些难题(分箱、对齐和归一化、峰值选取、相对定量等)。MS-Xelerator是一个专门用于上述所有任务的软件工具集合。
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新型酰胺合成PNA
苯并噻唑-2-磺酰基(Bts)是氨基酸的一种保护基团,磺胺的稳定性和温和的去保护条件是一种很有吸引力的保护基团。由于磺酰基的强吸电子作用,酰基磺酰胺烷基化后的酰基容易被亲核试剂攻击,这被应用于安全捕获策略或合成肽硫酯对肽进行天然化学连接。
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小穴蛋白-1表达在胰腺癌诊断中的可能生物标志物
Caveolin1 (Cav-1)既可以作为肿瘤抑制因子,也可以作为肿瘤转移的促进因子。cav-1过表达与肿瘤分级、增殖标志物(Ki67、p53)、血清肿瘤标志物(CEA、CA19.9)和血管生成标志物(VEGF、bFGF)相关。
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拟南芥叶绿体Tryptic digest的高分辨率分离
在拟南芥叶绿体蛋白质组测定的背景下,我们将介绍已识别肽的数量及其与基于填充柱或整体柱的色谱系统峰容量的关系。
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UniProtKB/Swiss-Prot中的Worm注释
UniProt (Universal Protein Resource)提供了一个关于蛋白质序列和功能注释的中心资源。UniProt联盟由欧洲生物信息学研究所(EBI)、瑞士生物信息学研究所(SIB)和蛋白质信息资源(PIR)组成。UniProt知识库(UniProtKB)包含手动注释的UniProtKB/Swiss-Prot部分和自动注释的UniProtKB/TrEMBL部分。
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