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对理解Ryegrass-Endophyte共生通过转录组和代谢组的数据集成
结合广泛的生物信息学分析,我们的共同分析转录组和代谢组学数据产生了有趣的发现导致了进一步的实验验证,如潜在的基因与生物碱生产有关。
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利用高速摄影技术来优化低容量分配条件
在本研究中我们使用高速摄影作为一个反馈机制来调整Nanodrop仪器分配设置提高位置分配的准确性低容量(只)下降。这些参数可以调查,与各种液体类,减少有害影响分配性能如流偏转时,卫星的形成、二次脉冲和减少变形。
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Ethnopharmacological评价Radal(叶子Lomatia物种通过代谢物分析和隔离2-Methoxyjuglone。
评估使用的传统草药的疗效Radal代谢物概要文件的原始植物材料。叶子和发现的层提取活性对致病性真菌白色念珠菌(麦克风= 8µg /毫升)。肉桂酸(2)、香草酸(5)被确定为主要成分,并用gc - ms在茶连同其他酚类衍生品。
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Lipidomic脂质提取方法的比较分析,人类血浆
尽管代谢组学和本身应该是一个集成的方法,其复杂性需要类似的方法集中在它的组件,如lipidomics。脂质由NMR分析没有样品提取,应被视为只在lipidomic第一阶段分析。随后的分析应该包括提取的脂质biofluid之前或组织进一步分析使用multi-technique涉及NMR和MS的代谢组学方法。
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方法自动结构测定配体在Protein-Ligand复杂
Afitt是自动配体构象生成的软件包和放置在算法识别空缺电子密度。真实空间细化后,配体解决方案发送后续细化Refmac或CNX,通过协调和字典文件。我们验证Afitt四十公开数据集,选择因为它包含高度紧张的配位体构象的例子。
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预测Protein-to-Protein交互
我们使用局部极值discretisation微阵列时间序列数据为依据。通过比较discretised基因表达式使用相似性函数,我们发现公认的protein-to-protein交互。我们验证结果利用公众对protein-to-protein真阳性和真正的负数据库交互和演示这些地方的高predictiveness极值作为时间序列特性。
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丰富的血清蛋白质的定量评价损耗
丰富的蛋白质需要相对低浓缩的识别。我们已经测试了系统具体的丰富的蛋白质。白蛋白和免疫球蛋白去除效率评估ELISA和2 de。估计不具体的绑定,六个血清细胞因子被上升到。回收率测定仪珠化验。
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尿代谢物的分析
健康的个人和肾癌患者尿液样本用于代谢分析方法开发和尿液代谢物的分析。
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生物标志物识别结合多变量分析的核磁共振光谱和一个创新的光谱数据分析方法在一个集成的工作环境
最近开发的代谢组学信息解决方案从原始数据处理代谢物数据库搜索,兼容多种工具,已成功应用于1 h NMR分析人类糖尿病和非糖尿病受试者的血清光谱。本研究也强调了重叠密度的热图,一种新颖的技术,补充了化学计量学在生物标志物识别的使用。
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从微阵列数据构建直接代谢网络
虽然已经几年以来代谢网络成为一个常用的分析技术在生物信息学中,如何构建的问题从实验数据还没有令人满意地解决了。在这里,我们提出一个方法直接代谢网络的建设从微阵列数据集使用的一个增强版本KEGG数据库配体。
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