突破MALDI-2源timsTOF fleX和创新CCS-Enabled 4 d timsTOF蛋白质组学

在虚拟asm 2020启动会议上,力量公司宣布了一个重大进步matrix-assisted激光解吸电离(MALDI),与此同时,博姿公司推出了世界上第一个商业MALDI-2 post-ionization (PI)源,现在可以作为一个选项在timsTOF fleXTM ESI / MALDI质谱仪。这部小说MALDI-2技术可以提供一个或两个数量级高灵敏度对许多小分子和脂质。MALDI-2增加谱质谱分析的应用范围,进一步成像。

此外,力量启动额外的独特蒂姆斯/ PASEF-enabled 4 d利用大规模蛋白质组学方法,实时准确的碰撞截面的可用性(CCS)数以万计的测量每4 d nanoLC-CCS-MS肽/ MS运行。这些新方法和软件包括prm-PASEF、short-gradient dia-PASEF,现代艺术博物馆,“运行并完成”蛋白质组学使用一种新颖的基于gpu的实时搜索引擎。除了进一步提高多肽、蛋白质和天车识别,这些CCS-enabled创新允许持续、超高灵敏度LFQ性能,和真正的高通量方法4 d蛋白质组学,4 d lipidomics和4 d代谢组学异常强劲timsTOF职业平台。

SpatialOMx®timsTOF fleX和转化质谱影像

创新MALDI-2π源增加灵敏度和范围的应用MALDI非常显著。MALDI-2需要第二束激光(266海里)向扩大MALDI发射正交柱所产生的力量的专利主要SmartBeamTM 3 d激光(355海里)。一个优化flexMatrixTM MALDI-2制定建议。新MALDI-2源现在可以作为一个选项在timsTOF flex ESI /谱仪。

领袖教授克劳斯Dreisewerd部分生物医学大学的质谱在德国,构建和MALDI-2的先驱,说:“在过去的35年,谱技术已成为一个独特的和快速分析工具用于各种各样的应用程序。我们开发了MALDI-2显著扩展技术通过提供更高的灵敏度为小分子,化学类的包容,没有与谱离子化效率。MALDI-2动力timsTOF fleX将MALDI新的科学和分析边疆。”

迈克尔·伊斯特林博士,全球力量成像女士主管Daltonics,补充道:“日益增长的MALDI成像和SpatialOMx价值的组织模型药物开发驱动更高灵敏度和多功能性的需求。大幅度增加的敏感性和可访问范围的化学类,小说MALDI-2源选项现在可以进一步加强质量spectrometry-based,一道组织分析。”

现在力量还提供一个MALDI-2复合参考图书馆为其MetaboScape®代谢组学软件,这是中创建各种学术和医药合作。MetaboScape提供自动分析物中的注释SCiLS™实验室MALDI成像软件,包括改善的信心CCS-algorithms注释对于许多代谢物,直接聚糖和脂质组织图像。

CCS-enabled 4 d蛋白质组学™timsTOF平台上的创新——prm-PASEF转化定量4 d蛋白质组学

力量的革命timsTOF™职业为进一步增强结合PASEF®与平行反应监测(人口、难民和移民事务局)label-free定量蛋白质组学。这种独特的方式prm-PASEF利用第四维度的分离使用商旅提高选择性和敏感性,结合PASEF前体的数量增加的速度的目标。与天际线团队密切合作使prm-PASEF方法、天空软件现在可以分析prm-PASEF数据和生成定量报告。

集团贡纳·迪特玛从卢森堡健康研究所的教授和教授Antoin Lesur,从事prm-PASEF工作流开发,评论道:“我们一直非常印象深刻的早期结果从prm-PASEF timsTOF职业在我们的实验室。prm-PASEF已经竞争对手的灵敏度和速度的人口、难民和移民事务局的方法已经发展多年来在其他平台上。”

杰罗德·博士,dana - farber癌症研究所副教授,哈佛医学院和布莱根妇女医院的补充道:“我们启动以来取得了巨大的进展与力量prm-PASEF团队的共同发展。收购的独特组合上整合速度和离子迁移timsTOF强劲专业使我们能够量化潜在的候选生物标志物在临床人群。此外,实时采集参数的调整与prm-PASEF生活将推动进一步的可用性和吞吐量。”

大规模、高精度肽CCS测量深度学习

肽碰撞截面(CCS)以大规模和添加了独特的商旅技术提供高精度的维数增加4 d蛋白质组学鉴定的信心。一个新的预印本Florian迈耶等人的研究,使用570000 CCS的深度学习训练集值以360 LC / MS运行五分次消化生物,timsTOF Pro系统上运行。

马蒂亚斯•曼教授,主任马克斯普朗克研究所的生物化学、德国,评论道:“肽离子的大小和形状在气相是一个有待进一步研究维度的大规模spectrometry-based蛋白质组学。CCS值现在可以预测多肽和生物,形成先进的蛋白质组学工作流的基础,充分利用额外的信息。”

Short-gradient dia-PASEF和机动性抵消质量一致(MOMA) 4 d蛋白质组学

新的short-gradient方法已经开发使用dia-PASEF工作流,这是发现越来越多地使用在许多timsTOF专业实验室。Dia-PASEF可以提供一个有意义的进步在数据完整性、和Dia-PASEF工作流现在支持生物信息学Solutions Inc .高峰和Biognosys Spectronaut软件。

卢卡斯Reiter博士,首席技术官Biognosys评论道:“Spectronaut 14日发射,我们完全支持timsTOF Pro:快速库代PASEF和离子迁移率校准Spectronaut更具体的有针对性的提取。此外,我们还增加了directDIA timsTOF Pro的支持。我们也兴奋timsTOF Pro在我们实验室进一步加快软件开发这个新的和令人兴奋的平台。”

蛋白质组学副总裁Gary Kruppa博士力量Daltonics,补充道:“prm-PASEF推出,dia-PASEF越来越成功,和短渐变的趋势,利用鲁棒性、灵敏度和无与伦比的频宽比PASEF, timsTOF Pro提供了功能使4 d-proteomics转化现实。此外,蒂姆的独特的现代艺术博物馆特性允许在类似的保留时间为目标等压前兆MS / MS收购。在现代艺术博物馆功能有助于提高使用短渐变的深度报道,这是我们重要的转化研究蛋白质组学用户运行>每天50个样本/ timsTOF职业。”

“运行和完成”:实时搜索由耶茨为高通量4 d蛋白质组学实验室

力量宣布蛋白质组的可用性管道(IP2),基于gpu的搜索引擎将ProLuCID数据库搜索工具实验室的斯克里普斯研究所的约翰•耶茨教授位于LaJolla CA。这种独特的基于gpu的IP2软件开发了罗宾博士公园和允许timsTOF Pro 4 d数据实时搜索在收购期间,可以使用搜索结果结束的时候运行。

教授约翰·耶茨三世和罗宾公园博士说:“先进的共同进化计算与质谱灵敏度和扫描速度使得更准确,大规模数据分析方法,帮助回答许多生物学问题。设计了基于gpu的搜索引擎同时执行许多并行指令线程可以减少搜索时间,搜索结果可以被转换成实时输入驱动串联收购女士。这就变成了一个令人兴奋的部分在我们的伙伴关系与力量,因为它会利用timsTOF Pro更加聪明。”

Rohan Thakur博士,生命科学的执行副总裁质谱在力量Daltonics,补充道:“IP2 / GPU的解决方案提供了适合的软件基础设施支持的插件应用程序的第三方软件合作伙伴,利用高性能集群或云功能。我们致力于我们的战略的开放数据文件格式,以促进社区驱动的软件开发,包括我们的第三方合作伙伴通过API访问timsTOF用户社区的利益。”