力量宣布新的血浆蛋白质组学软件和交联耗材
在虚拟17日美国国际会议(合2021国际),力量公司(纳斯达克:电流断路器)宣布与几个合作进展深,公正的血浆蛋白质组学,利用速度、灵敏度和动态范围的4 d蛋白质组学timsTOF Pro系统。
新结果从一个关键的合作者,科罗拉多大学教授柯克汉森安舒茨医学中心将于周二在美国国际力量的虚拟研讨会,3月9日美国东部时间下午两点。登记为美国国际会议需要参加了现场直播。汉森博士将COVID-19感染病人的血浆蛋白质组的研究,以及一大群人比较创伤患者的血浆蛋白质组的变化。
汉森博士的研究揭示了蛋白质动力学在急性损伤和疾病状态与数以万计的测量每个样品。运行更大的临床队列是照亮分子关系和机械的理解有可能远远超出目前的诊断。
汉森教授评论说:“我们最近才重新进入等离子体空间蛋白质组学,主要是由于速度、灵敏度和timsTOF Pro的吞吐量。加上Evosep,这个系统提供的可靠性和吞吐量,我们不能实现仅仅几年前。”
2021年初,力量宣布了一项突破性的论文表明无偏的Mann-group,定量真正单细胞蛋白质组学解决重要的问题在单细胞生物学和病理学(www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.22.423933v1)。力量打算启动一个高端专用的单细胞timsTOF系统在2022年初无偏、定量单细胞蛋白质组学。
最近宣布了一项新的自然通讯刊物的力量曼书&组织大规模的肽碰撞截面的好处(CCS)测量4 d蛋白质组学和机器学习。利用深度学习,CCS值现在可以预测任何从任何生物肽,形成先进的4 d蛋白质组学工作流的基础,充分利用额外的肽CCS第四维度。
一个。不是1.1实时搜索蛋白质组学
力量释放它的不是软件v.1.1,克里斯·亚当斯博士蛋白质组学业务发展总监力量Daltonics,将在3月9日美国国际研讨会。不是基于gpu的,使蛋白质组学数据库实时搜索,建立在力量的收购IP2软件。“不是”代表并行实时搜索引擎,与并行多线程搜索gpu来获取结果通常比数据采集。这允许的运行&做高通量4 d蛋白质组学鉴定肽和蛋白质组尽快可用实验完成。
除了性能增强,不是1.1包括4 d数据的可视化,包括现代艺术博物馆的特性和搜索结果。4 d蛋白质组学的一个强大特性是Mobility-Offset Mass-Aligned (MOMA)分析,在co-eluting异构或离子等压,不能区分在典型的3 d蛋白质组学,解决了流动分离与精确的碰撞截面大规模(CCS)。
B。交联结构蛋白质组学与蛋白质的相互作用(质子泵抑制剂)
力量宣布新的耗材和软件的释放的化学交联蛋白(XL-MS)研究蛋白质结构和交互。PhoX的交联,授权后乌得勒支大学的组织发展的阿尔伯特·赫克和理查德•Scheltema今年春天将从力量商用。PhoX是enrichable交联与膦酸酯组,允许从复杂的混合物产生的净化XL-MS反应,使用金属压条亲和纯化。这种浓缩大大提高检测交联肽的能力,和组织之间的合作阿尔伯特见鬼,理查德·Scheltema和力量表明,交联检测可以使用caps-PASEF增强蒂姆分离(MCP, 20 2020年7月,19 (10):1677 - 1687)。力量还将推出3可分裂的cross-linkers春天,由一些研究小组,首选的乳沟cross-linkers MS / MS实验结果在特征差异,很容易发现。
化学交联数据非常复杂和自动分析软件是必需的。一个新版本的受欢迎的MaxQuant软件集团的于尔根·考克斯教授Martinsried马克斯普朗克研究所,德国,也支持从timsTOF Pro系统XL-MS数据分析。在试验,将在2021年4月发布的4 d蛋白质组学利用XL-MS工作。
C。进展,无偏血浆蛋白质组学
几个研究小组最近提出了令人兴奋的结果血浆蛋白质组学利用各种各样的方法。
2021年2月,罗马费舍尔教授目标发现研究所的牛津大学纳菲尔德医学系的提出了“大流行期间高通量蛋白质组学”在基因工程和生物技术新闻(genengnews.com)。菲舍尔博士讨论了几百名未用尽的等离子体的高通量4 d蛋白质组学样本COVID-19不同疾病严重程度、患者健康对照组和患者患有其他疾病,如败血症。
还在2021年2月,研究人员来自Planegg OmicEra诊断GmbH是一家现代化的、可靠的德国,发布了一份手稿MedRxiv“高分辨率纵向血清蛋白质组轨迹COVID-19揭示patients-specific血清转化”,其中31个病人随访纵向平均31天,使用高通量4 d蛋白质组学。本研究采用OmicEra´s自动化的蛋白质组学管道加上Evosep色谱系统运行21分钟梯度实现吞吐量每天60个样本。
使用这种方法,720年未用尽的血清样本由OmicEra超过12天在单一timsTOF Pro,共有502蛋白质量化。116年一些蛋白质定量表达水平的变化。在美国国际力量释放应用程序注意与OmicEra血清蛋白质组学在我们的合作。
在2021年美国国际,Seer (www.seer.bio)将提供一个协作海报与力量,显示了独特的功能Seer工程纳米颗粒的结合蒂姆斯/ PASEF方法。在一起,这种策略实现无偏、深和快速血浆蛋白质组分析> 1700蛋白质组与90分钟的银两nanoLC-TIMS-MS / MS方法。先见的组合与蒂姆的Proteograph产品套件/ PASEF方法为无偏和深度蛋白质组学提供一种可伸缩的解决方案,可以访问几乎任何实验室,第一次。
蛋白质组学业务发展总监克里斯·亚当斯博士力量Daltonics,说:“它已经奖励看到最近的血浆蛋白质组学领域的飞速发展,一个区域我们希望快速增长在液体活检multiomics转化研究和生物标志物验证。这些进步在深,公正的血浆蛋白质组学被启用的吞吐量,健壮性和独特的4 d蛋白质组学蒂姆斯/ PASEF方法的选择性和灵敏度优势。”
