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IBM eX5为桑格研究所改进下一代测序

生命科学和高性能计算(HPC)有一种共生关系——生命科学
今天的研究严重依赖于高性能计算基础设施,即使高性能计算本身也在迅速发展以满足需求
更新,更苛刻的数据分析需求,如下一代
测序(门店)。

本文介绍了NGS的概述,随后介绍了与生命科学研究相关的关键技术和计算问题,具体参考了桑格研究所,这些问题通过IBM基于英特尔的eX5系统解决。基于来自IBM和Sanger Institute的真实科学实验数据,我们将重点介绍IBM eX5服务器如何扩展,以及如何最适合计算和内存密集型应用程序(如Velvet、ABySS和SOAP)。生命科学应用不仅受益于eX5企业系统专为天鹅绒应用设计的灵活性、密集计算能力、512GB-1TB内存,还受益于优越的I/O、内存性能和高速互连,再加上IBM简化集群管理的智慧,以及无与伦比的电力和能源效率的工程创新。

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