处理大量的数据并不容易。不同的格式和兼容性可以跟踪您的组织的所有信息生成一个庞大的任务。幸运的是,有大量的信息系统可以帮助您完成这个任务。不巧的是,这些系统通常似乎提供尽可能多的不同的特性和功能类型的数据,和工作在一个数据系统的开始和结束另一个可以证明一样挑战他们所解决的问题。
CSols inc .)是一个独立的信息咨询公司来帮助消除存在的众多问题研究和行业实现数据解决方案。在这篇文章中,我们观察的关键区别四种常见类型的信息系统——电子实验室笔记本(ELN),实验室信息管理系统(LIMS)、色谱数据系统(CDS),和实验室执行系统(LES)。CSols“交付经理杰夫•特恩布尔帮助我们回答一些重要的问题在这些系统都应该扮演的角色,他们互相重叠,以及为什么我们不只有一个包罗万象的系统规则。
Ruairi Mackenzie (RM):你能给我们什么是民族解放军的概述?
杰夫•特恩布尔(GT):在其最简单的形式,电子实验室笔记本(ELN)是一个真正的数字替代传统纸质实验室笔记本,一个科学家或分析师记录一切与他有关的实验。
然而,一个民族解放军提供更多的不仅仅是取代纸质笔记本。它还提供了标准化工作流程的能力。例如,你可以在你的实验提供了一些结构配置模板,最低限度,你有相同的部分填写,包括适当的元数据的条目,每个实验组织内执行。这使得它更容易搜索和相关实验数据中维护民族解放军。
工作流自动化需要你的民族解放军到下一个水平。在化学领域你可以设计实验反应,使用化学绘图工具,如ChemDraw查试剂从企业外部资源,自动获取你的内部程序,和元数据和记录观察结果。在生物学领域你的民族解放军能够支持复杂的大分子如细胞系实验,抗体和蛋白。在这两种情况下仪器接口、样品管理和库存管理扮演了一个重要的角色。
可能使用一个民族解放军的最重要的好处是提高效率,执行数据分析和可视化的能力在捕获的大量的数据和研究人员之间协作的能力。合作变得越来越重要,因为越来越多的公司搬到一个虚拟的世界,而不是具体的研究是由一个单一的组在组织内分布在外部合作伙伴这样横和学术界。
RM:什么是LIMS,使用一个的优点是什么?
GT:LIMS是实验室信息管理系统。传统上,LIMS sample-centric,意义的焦点信息的捕获和管理是关于样品的信息。这是什么意思?这意味着你通过示例跟踪样品信息生命周期。组件的示例生命周期包括登录、收据、测试任务,结果条目,计算和样品处理。
元数据捕获LIMS的样品进展通过其生命周期。此元数据可以包括样本位置等细节;用于测试的设备及其校准状态;测试执行的分析师的资格;标准、试剂和解决方案,连同他们的过期状态,用于测试,等等。
林氏企业管理调度的测试,监测仪器校准和预防性维护,库存的管理,包括标准和试剂,等。LIMS也用于自动检查的结果对存储规范。LIMS可以处理审查、批准和报告执行的测试的结果和分布对样本。
LIMS可以很容易的界面的最标准的实验室仪器和ERP等与其他系统进行集成。接口和集成的能力让我们不需要手动抄写的信息,因此消除人为错误的可能性。
LIMS的主要好处是提高生产力和效率,改善遵从性和数据完整性和样本信息的集中存储。在生产环境中质量结果存储在LIMS可以追溯到生产过程本身。
RM: cd的角色是什么?
GT:在一个高水平的角色色谱数据系统(CDS)是管理工具,系统适用性测试,采集和处理的色谱与色谱法测试,执行GC和LC,在您的实验室。
cd往往与其他实验室信息系统集成如LIMS, LES或民族解放军。当集成LIMS,样本集运行,结合样品测试和标准在LIMS中创建和发送到cd进行处理。一旦色谱在cd收购和加工,从cd LIMS检索适当的结果数据,执行任何额外的计算和规范检查之前在LIMS数据库中存储数据。
cd变得非常复杂的过去30年左右,并执行他们的明确的目的非常好。LIMS厂商特别是发展强大的接口主要CDS产品使两个系统之间的无缝传递的信息。
RM:莱斯呢?
GT:苹果是一个实验室执行系统。苹果是一个专业的变体ELN系统制造/质量控制环境。在这个环境中你通常一遍又一遍地重复相同的测试。执行这些测试通常是根据论文基于标准操作程序标准作业程式或工作指令。QC环境中最重要的事情是确保一致性的方式执行测试和证明。这正是苹果为你。
苹果执行程序执行测试过程中。sop或工作指令封装的软件,使每一步测试过程记录,最重要的是,阻止分析师移动到下一个步骤,直到当前步骤已经完成。检查标准,试剂或实时的解决方案可以作为样本正在准备和测试。偏差,如过期试剂的潜在用途,可以被识别的时候使用,因此是可以预防的。
所以,从LIMS LES如何不同?LIMS不能轻松地执行任务的顺序表现和有困难的时间记录相关步骤没有结果以外的步骤完成。
RM:所有这些不同的系统可用,有过努力创造一个更加统一,总体解决方案吗?
GT:这正是LIMS,民族解放军和莱斯供应商要做的,一个平台,包括所有实验室操作从研发到制造。你可以看到它在他们的营销材料最主要的供应商有朗朗上口的名字统一平台。扮演小角色的例外是cd在实验室操作和最有可能一直会是这样。
LIMS供应商来构建自己的产品的功能包括ELN-lite和莱斯功能。ELN供应商包括LIMS像功能,如库存管理、样品管理等。
所以我们是民族解放军厂商推出的研究一方面向制造结束在LIMS供应商在莱斯和推动向研究一方面与真正的民族解放军的承诺的能力。
RM:提供一个系统的运动,一切,我想有一个风险,如果你有一个系统做的一切,它将更难以整合从另一家公司——这是一个问题吗?
GT:当谈到与仪器和仪表系统这已经是一个挑战。仪器厂商专有格式存储的数据,报告的结果等。
交换了一个仪器从一个供应商到另一个需要修改仪器接口。
的同素异形体的基础是解决这一挑战通过创建一个框架,用于分析的数据,如果采用仪器供应商,将提供一个标准的数据格式包括结构化元数据标准和接口库。采用这些标准将提供即插即用功能实验室信息系统和工具。同素异形体基金会的终极目标是开发一个框架中数据、方法和硬件可以在不同的平台之间共享。
当涉及到实验室信息系统风险总是存在在把所有的鸡蛋放在一个篮子里,另一方面;集成是从来没有的你会喜欢。技术变化在以不断增加的速度。你今天选择的系统可能不是最好的系统,你的目的在几年的时间。此外,在我看来,目前没有一个平台,擅长从研发到生产支持实验室操作。你需要权衡商业利益的最好的一代解决方案与系统集成的技术挑战。
在我看来,从技术的角度来看,虽然我们(CSols)已经成功地集成各种不同的实验室信息系统,它是明智的避免重大系统集成其他的地方,可能少全功能可供选择,满足业务需求。主要的系统集成是很困难的。一直都是,在可预见的未来很可能永远都是。