基因-环境相互作用研究提供新的见解饮酒和结肠直肠癌的风险

大的多中心,跨国研究协作由弗雷德哈钦森癌症研究中心(华盛顿、美国)和国家人类基因组研究所(美国马里兰州)使用大型数据集的全基因组进行交互分析结肠癌家庭登记处(CCFR)和结肠直肠癌的遗传学和流行病学协会(GECCO)来识别候选snp,然后用基因表达的研究随访发现基因在正常和癌变组织。

结直肠癌是男人的第三大常见的癌症,第二个全球女性最常见的癌症。自2007年以来,全基因组关联研究(GWAS)发现只有一小部分的变异占CRC继承;人员如锣,Hutter和其他贡献者转向研究基因之间的相互作用和环境危险因素的分析(全基因组交互分析)找到额外的CRC风险变异。

与之前的研究一致,团队观察到逆与CRC少量或适量饮酒者的风险但积极的酗酒者而非协会/偶尔饮酒者。使用传统的逻辑回归,研究小组发现全基因组重要11之间的相互作用在9 q22.32 / HIATL1 snp位点和少量或适量饮酒。最重要的SNP是rs9409565位于HIATL1的下游基因间区28 kb。所有其他10个全基因组重要的单核苷酸多态性与rs9409565强大的连锁不平衡和一些位于HIATL1。

HIATL1基因表达分析表明,单核苷酸多态性确定影响HIATL1表达式,HIATL1参与的信号通路相关的CRC, HIATL1表情正常和肿瘤CR组织之间的不同,HIATL1表达式在结肠癌组织中不同饮酒。

需要进一步的复制和功能性的研究来证实发现和理解生物相互作用的影响,并可能进一步洞察CRC病因,确定潜在的易感人群。