高含量映像的siRNA屏幕识别重要的激酶止血法
行我们血管的内皮细胞扮演着重要的角色在维持和调节血液流动,导致了自然过程被称为止血法。他们也参与凝血级联的血管受损时启动。一个机制,内皮细胞执行他们的角色是由分泌因素帮助招募的血液中凝血因子和伤口愈合的细胞。
令人惊讶的是,血液凝固缺陷是人类最常见的疾病之一。事实上,至少有1%的世界人口被认为患有这些疾病的最常见,血管性血友病。这种疾病是由突变引起血管性血友病因子的编码基因,血液蛋白质,就像一个血小板胶水粘在一起,治愈伤口。
阅读更多关于血管性血友病因子研究://www.dile1000.com/tn/news/engineered -凝血蛋白-停止-出血最常见的-遗传-出血障碍- 193423
高含量的成像
研究Janos Kriston-Vizi组MRC的分子细胞生物学实验室在伦敦大学学院,伦敦,使用新方法来理解哪些基因调节的功能,从内皮细胞释放等因素。Janos解释说,“我们使用了一种新颖的高含量检测方法来可视化内皮细胞和他们释放的关键因素之一,有助于止血,血管性血友病因子,通过显微镜。”
团队通过开发一个工作流实现高吞吐量的大小和长度测量Weibel-Palade身体,包含血管性血友病因子的分泌小泡,在初级人类脐静脉内皮细胞(HUVEC)。
图像分析工作流用于标签和测量Weibel-Palade身体大小和长度。
他们独特的工作流使他们破坏超过800个基因的表型效应和分析这些中断冯Willibrand因素从内皮细胞释放。
800年的主要候选基因编码的蛋白激酶被认为调节血管性血友病因子的形成。该团队使用电穿孔将siRNA脐静脉内皮细胞可拆卸的激酶表达,并观察对血管性血友病因子释放的影响。实验生成的10560张图片和使用珀金埃尔默歌剧系统进行。使用免费软件图像数据进行了分析。他们的实验方法测量超过1000万Weibel-Palade尸体。
自动测量Weibel-Palade的身体,包含血管性血友病因子。
开源
“这些图像包含大量的数据,不仅将有助于研究人员血管性血友病特别感兴趣,但也更广泛的研究更广泛的社区。”Janos解释说,之前添加”,共享的大型图像数据量是具有挑战性的,然而,由于传统的科学期刊印刷格式。”
要克服的问题分享这个大型数据集以一种有意义的方式,组织了大型图像集可以在哈佛Dataverse库。他们还描述了他们的研究成果和开源图像分析工作流在他们最新的论文,发表在功能基因组学杂志上的集合,科学数据(Ketteleret al。2017)。
参考:
Ketteler, R。弗里曼,J。费拉罗,F。巴塔,N。卡特勒,d . Kriston-Vizi, j . (2017)。基于图像的siRNA屏幕识别激酶调节Weibel-Palade体型控制使用电穿孔。科学数据4 p.170022。
