2016年激酶分析趋势
蛋白激酶已被证明是一个主要的药物目标20多激酶抑制剂批准用于治疗癌症和炎症性疾病在过去的20年中。人类激酶组包括518种已知的蛋白激酶和大约20脂质激酶。细胞生活的几乎所有方面都是由可逆磷酸化蛋白介导的蛋白激酶和磷酸化异常是许多疾病的原因或结果。因此许多制药公司和生物技术公司继续进行初级筛选针对激酶目标认为是临床上重要的。优化的重要一步激酶铅的测定比较这些导致对其他激酶酶的选择性。这种所谓的激酶概要文件通常是对一组执行激酶的酶。这种方法的发展促进了与增强的力量对选中的激酶抑制剂(s)的目标。此外,它可能会导致可能的新型选择性的识别与意想不到的激酶的目标。直到几年前典型的激酶面板可能是来自密切相关激酶超级家族成员与其他家庭偶尔表示。然而,当前的趋势是走向更广泛的分析对更全面的激酶面板中,在某些情况下利用所有可用的激酶。 This has led to competition among fee-for-service providers as to who can offer the broadest panel, with new kinases being added to their panel at almost weekly intervals. The ability to profile against the widest possible panel of kinases in house involves considerable expense and resources which few organizations can afford today. As a consequence outsourcing of kinase profiling is now the accepted practice, particularly if a broad kinome profile is wanted. As more pharma companies focus on the screening of related target families in parallel across therapeutic area boundaries, greater importance is being given to the early determination of selectivity profiling. This has contributed to the increasing number of companies that now offer outsourced kinase profiling on a fee-for-service basis.
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拥有超过15年的经验,DiscoverX KINOMEscan®平台采用专有的活动定点竞争结合试验定量测量测试化合物之间的相互作用和激酶480多个化验,最多可用。最快的周转时间和广泛的动态范围,KINOMEscan®服务使加快特区分析。
“Kinome-wide广泛的分析与KINOMEscan®允许广泛的化合物与注释准确、可复制的数据以利用现有的化工资产引进新发现程序”
丹尼尔Treiber博士,首席技术官,药物发现服务,DiscoverX公司
更多的信息2016年5月HTStec激酶上进行了一次市场调查分析主要在制药公司的研究实验室中,生物技术和学术界。这项调查是由HTStec生命科学市场的跟踪和更新HTStec之前的激酶分析趋势报告(2013年5月出版)。目标是全面的文档在激酶分析当前实践和偏好,和了解未来用户需求,特别是对成本和外包服务的使用。目的是要编译一个参考文档激酶分析指标,可以直接相对于HTStec相比之前的2013年的报告。本文包含从HTStec市场选择的结果的报告,激酶分析趋势2016年。它的目的是为读者提供一个简短的了解最近的市场趋势。它涵盖了只有11 30原始问题详细的完整的报告。在这个“选择的结果”,我们专注于外包激酶分析我们的讨论,尽管它是基于市场报告分析也检查房子。完整的发表的报告应该咨询查看整个数据集,分解反应的每一个细节问题,其分割和对未来的估计。请点击这里为更多的信息。
主要使用外包激酶分析化验:
图1: 今天治疗领域使用激酶化验
约2/3rd的激酶分析今天的活动外包。主要治疗领域利用这些外包激酶分析化验的结果在图1中给出。这表明,大多数(80%)的受访者使用激酶化验在肿瘤治疗领域(TA)。其次是44%炎性疾病/自身免疫性助教;26%的神经病学助教;19%代谢分析;11%心血管和抗感染的助教;和9%的其他助教。
首选外包激酶面板分析化验格式:
图2:首选外包激酶面板分析化验的格式
首选外包激酶面板分析化验格式提出了如图2所示。这表明,首选第一选择外包激酶面板分析化验格式通缉绝大多数(68%)是活性测定(如反应基于生物学的热点放射性标记的活动的激酶检测)。其次是结合化验(23%),然后细胞化验(8%)。首选的第二选择外包激酶面板分析化验格式希望大多数也同样分为基于手机化验(37%)和绑定化验(35%),然后基于活动的化验(27%)。
典型的使用激酶面板分析外包服务:
图3:井总数的映衬下激酶电池板每年在外包提供商
井总数的映衬下激酶电池板每年在外包供应商详细的图3中。这表明中值单一井总数/年测试外包激酶面板分析提供者是500 - 5 - k井/ 2016年。
图42016年:分解激酶分析井外包
激酶的分解分析井2016年外包报告如图4所示。这表明,大多数(33%)外包激酶分析井被复制或复制点(%)抑制测试(n > 1)。其次是单点响应曲线(IC50s或Kds)测试(n = 1) (27%);重复或复制点响应曲线(IC50s或Kds)测试(n > 1) (22%);然后单点(%)抑制试验(n = 1) (18%)。
选择一个激酶分析面板:
图5:今天典型的外包激酶面板使用(2016)
外包激酶面板的大小在2016年用于SAR在铅优化或在最终决策阶段(前候选人选择)在图5。这表明,中等大小的激酶面板SAR先导物优化外包是50 - 100激酶,与100 - 150年激酶在最终决定阶段。
图6:激酶分析面板大小的受访者更愿意外包提供商
激酶分析面板大小的受访者更愿意外包提供商提供了在图6所示。这表明中值首选大小激酶面板外包提供商提供的是200 - 300激酶。尽管受访者的比例最高(36%)希望> 400激酶即尽可能多的激酶组表示为是可能的。
图7:数量的Disease-Relevant突变激酶希望在一个外包面板
的数量disease-relevant突变激酶受访者希望看到在一个外包提供商的激酶小组在图7中有详细描述。这表明中值1-50 disease-relevant突变激酶在一个外包小组希望。
图8:当受访者会选择做一个广泛的激酶组概要文件
当受访者会选择做一个广泛的激酶组剖面的选择性和非目标交互报告如图8所示。这表明,大多数(55%)会选择做一个广泛的激酶组在铅优化概要文件。另外35%会在最终候选人的选择,6%不会选择它,4%会在最终候选人的选择。
选择激酶分析面板供应商:
图9:首选外包激酶分析收费服务提供者
受访者被要求选择他们最喜欢的外包提供商激酶面板分析。首选项记录为所有供应商选择的比例分享总结在图9所示。这表明,反应生物学是最首选的外包激酶面板分析收费服务提供者选择31%的份额。其次是DiscoverRx(16%)、欧陆坊(11%)和热费希尔科学(10%)。所有其他供应商5%或更少的选择。请注意:这不是一个真正的市场份额根据实际采购的服务,而是一种求和偏好受访者的数量为一个特定的服务提供者。
图10:选择激酶分析收费服务提供者的关键标准
时被评为最重要的决策标准选择一个外包激酶服务提供者在图10中列出。这表明,高质量的可再生的数据被评为最高73%的被调查者选择。其次是成本分析(66%)、周转时间(62%),宽度的激酶(即面板大小)(47%),然后分析格式(即功能/绑定;荧光/ radiolabel) (44%)。最重要的标准选择一个激酶外包服务提供商能力时购买产品/技术中使用的服务,和信息学和创新的数据可视化工具。
图11:激酶服务提供商应该优先考虑他们的努力前进
受访者认为激酶服务提供商应该集中他们的努力是详细的在图11。这表明,大多数(46%)希望看到细胞分析基于内生激酶表达(更多生理相关)。其次是降低价格(44%)、细胞分析基于中激酶(27%);增加激酶的数量提供(24%),然后改善数据质量(24%)。认为至少要在跨物种分析开发和提供更好的客户支持。
结论:
上面的选择报告的结果显示,肿瘤的主要治疗区域利用这些外包激酶分析化验的结果。活性测定是首选外包激酶面板分析化验的格式。平均每年500 - 5000单试验井是外包给激酶面板分析提供者。大多数这些外包井被复制或复制点(%)抑制测试(n > 1)。SAR的中等大小的激酶板外包铅优化是50 - 100激酶,与100 - 150年激酶在最终决定阶段。中位数首选大小激酶面板提供的外包提供商是200 - 300激酶。的中位数1-50 disease-relevant突变激酶在一个外包小组希望。大多数人会选择做一个广泛的激酶组在铅优化概要文件。生物学反应是最首选的外包激酶面板分析收费服务提供者。高质量的可再生的数据被评为最重要的决策标准在选择外包服务提供者激酶。 Cell-based assays based on endogenous kinase expression (more physiological relevant) are where respondents think kinase service providers should focus their efforts going forward.
最大化分析表示整个激酶组包括野生型、突变、非典型、脂质和病原体激酶已成为近年来几乎所有收费服务提供商的主要目标。激酶用于外包分析现在的总数超过600在某个提供者。许多提供商也大大提高了他们的数据交付时间在某些情况下只有几天。此外,一些供应商现在提供新的细胞分析格式验证肿瘤激酶抑制剂如3 d球体化验;软琼脂/单独分析;细胞酪氨酸激酶化验;直接量化的特定激酶磷酸化在人类细胞中活动;等等。与大量的供应商竞争业务分析服务定价从来没有渴望。然而,客户的需求从来都不是100%匹配和最终用户总是可以找到未满足的需求,这里只是一些一些报告给我们:1)更大的灵活性的能力来定制面板没有成本急剧上升; 2) assays to be available in the same format (there is currently no accepted universal detection method); 3) better analysis of the kinase relationships across the entire kinome; 4) more cell-based panels at a reasonable cost; 5) consistent naming of enzyme/protein and information provided by the different suppliers; 6) a platform to evaluate inactive kinases; 7) binding kinetics data e.g. koff rates, and 8) greater clarity over the activation-state of the kinase being profiled. Despite these shortcomings the case for outsourcing kinase profiling versus in house testing has never been better served.
董事总经理约翰Comley HTStec有限。
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