分子Physiome大脑区域标识使用自上而下的蛋白质组学和MALDI成像质谱
谱技术成像质谱(MALDI-IMS)是使用matrix-assisted激光解吸电离质谱分析成像技术。它使分析大量的分子内组织不会引起组织破坏。
一群来自里尔大学结合MALDI-IMS与自上而下的蛋白质组学特征的分子physiome老鼠的大脑区域。
由米歇尔Salzet和伊莎贝尔Fournie,团队开发新策略结合MALDI-IMS和在自上而下的蛋白质组学研究蛋白表达在细胞水平上的差异。
首先,使用MALDI-IMS分子进行组织学和空间分割区分感兴趣的区域(roi)在一个组织。这些roi接受了蛋白质微萃取和分析。
对组织在蛋白质组学提供了一个直接的手段研究细胞蛋白质组水平的波动响应组织微环境的变化。这种技术结合MALDI-IMS,地图分子的分布,使蛋白质在微尺度空间量化的水平。使强迫的相关性定量蛋白质组学和蛋白质表达变化和细胞生理学。
组调查3大脑区域,胼胝体,海马体和延髓,导致123年的描述参考蛋白质。此外,他们发现了8替代蛋白质产生替代开放阅读框架(AltORF)。他们还发现,某些蛋白质显示特定翻译修饰概要或截断大脑区域和它们的功能有关。
系统生物学分析进行蛋白质组中确定每个区域允许科学家们将子网与生理功能的大脑区域。
作为一个例子,映射矩阵的分布metallopeptidase 3-cleavedα-synuclein c端片段的95 - 140 (aa)确定其具体分布在海马齿状回。
综上所述,该集团建立的分子physiome 3鼠大脑区域通过引用和隐藏的蛋白质组特征。
集团说,这部小说组合可以用来寻找生物标志物,检测转录后的修改和确定新的蛋白质表达从替代开放阅读框架。
参考:
Delcourt, V。弗兰克,J。Quanico, J。希梅诺,j . P。Wisztorski, M。Raffo-Romero,。,……&弗尔涅i (2018)。在自上而下的蛋白质组学架桥MALDI女士成像揭示了分子Physiome大脑区域。分子和细胞蛋白质组学,17 (2),357 - 372。
