蛋白质组学的发展——米哈伊尔•Savitski博士

米哈伊尔·Savitski博士团队领导和负责人蛋白质组学的核心设施在欧洲分子生物学实验室海德堡。

的Savitski实验室使用和发展稳定蛋白质组学为理解聚合和崩溃的现象,细胞表现型和检测蛋白质相互作用的药物,代谢物,DNA和RNA。

Savitski蛋白质组学领域做出了一些令人印象深刻的贡献,包括热的发展蛋白质组分析(TPP);识别的技术,使药物靶点蛋白质组宽范围内原位,在药物发现的世界产生重大影响。

最近一次是在2019年出版纸TPP Savitski实验室用来显示,ATP的高亲和作用的变构调制器作为衬底和广泛影响蛋白复合物。

莫莉·坎贝尔(MC):在您看来,什么有一些最激动人心的突破在蛋白质组学研究领域迄今为止吗?

米哈伊尔·Savitski(女士):对我来说,这无疑是Orbitrap的发展亚历山大·马卡洛夫。这有一个巨大的对蛋白质组学领域的影响。开发的多路复用定量质谱(MS)也在我看来有巨大影响的生物女士现在可以解决的问题。

主持人:你的研究着眼于protein-drug protein-metabolite和蛋白质在生物过程的背景下的交互。为什么它是重要的学习这些交互?他们能告诉我们什么?

女士:Protein-drug互动是至关重要的破译为了取得进展在所有类型的疾病治疗。同时蛋白质和protein-metabolite交互方面的基础生物学,加深我们对这些交互在健康和患病的状态将导致疾病治疗新策略在未来,一般将提高我们理解细胞是如何工作的。

主持人:你发达TPP的蛋白质组学方法。请您能告诉我们关于这个方法的创建,它是如何工作的,及其应用领域的药物发现?

女士:当我还在Cellzome跨太平洋合作开发。我们的重点是破译小分子抑制剂的作用方式。在2013年发表的一篇论文出来的卡罗林斯卡研究所扩展的使用热转变分析检测与重组蛋白药物相互作用的细胞环境。我们意识到,我们可以把这种细胞热转移的原则与多路复用和女士这样开发第一个无偏技术检测整个蛋白质组的活细胞内的蛋白质药物的相互作用。

我们非常兴奋当安装工作,第一个实验已经为日常活动的药物提供了新的见解。与此同时我们也大大改善这项技术和应用它对细菌以及研究真核细胞周期等基本的生物过程。TPP不断越来越广泛使用的其他团体和制药公司寻找目标和非目标的药物。

主持人:研究人员面临的挑战是什么小说发展的工作流女士吗?

女士:我认为最主要的挑战是拥有正确的思想!越来越跨学科领域。我的实验室由生物学家、化学家、生物化学家,bioinformaticians。通常人们没有背景的蛋白质组学在加入我们之前,但是他们都是很好的,经常想出了令人兴奋的新想法。简而言之,我的答案是围绕自己有才华的,不同的人,创造最好的工作环境,那么伟大的思想会!

主持人:你能给一个完全意想不到的发现你最近偶然发现了你的研究?

女士:我们最近的工作集中在交互ATP-the最常见的代谢产物在细胞蛋白质组。值得一提的是我们发现除了已知的ATP规范角色,它也变成了调节溶解度的四分之一的溶解度过渡proteome-proteins可以从可溶性过渡到不溶性在生理条件下生理代谢产物的浓度。一项研究表明,ATP可能防止某些重组蛋白的聚合,我们非常兴奋地看到这些广泛影响proteome-wide水平。

主持人:技术和蛋白质组学的方法近年来发展迅速。你预计什么进一步的进步发生在未来10年吗?

女士:我认为我们将看到一个巨大的进步在功能蛋白质组学在未来十年。我的意思是,字段将超越仅仅测量蛋白质的表达变化,而是使用定量蛋白质组学结合创新生化检测和计算方法来评估功能的蛋白质以不同的方式。这种情况正在发生,但是我期望我们将会看到更多的未来。

米哈伊尔·Savitski与莫莉坎贝尔说,科普作家、技术网络。188金宝搏备用