谈话在代谢组学中的“最新最好的”
先进的高通量技术的帮助下,代谢组学研究领域近年来已获得重大进展。每天大量的文学出版研究探索代谢物的影响人类健康和疾病,并很难跟上塑造该领域的最新进展。
188金宝搏备用技术网络最近采访了Baljit Ubhi博士,全球商业铅、代谢组学和Lipidomics市场SCIEX。在这次采访中,Ubhi提供她的洞察力在代谢组学的最新进展,解决日益关注微生物代谢疾病,以及它如何影响的研究,探讨了未来的发展方向,如“精密营养”。
莫莉·坎贝尔(MC)是一些最激动人心的代谢组学研究领域的发展在2019年迄今为止?
Baljit Ubhi (BU):毫无疑问你是知,我们有大量的微生物组成。细菌(微生物)的集合可以保护我们免受细菌,分解食物释放能量,产生维生素。我认为了解代谢性疾病的微生物影响的增加,甚至gut-derived代谢物和他们的责任在许多生物过程,意味着审讯功能层面上真正把镜头和重视metabolomics-based方法。
此外,微生物组有显著影响人类疾病的诊断和治疗。具体来说,微生物与肥胖、糖尿病和某些癌症和自身免疫性疾病。代谢组学是一个强大的研究工具的系统性分析的所有外部因素可以影响表型和代谢表型出现提供了一个系统性的个人或一群人读出,不仅可以评估当前的生理状态,也开发一个特定的疾病或评估风险响应特定的治疗。这些信息可以应用于精密医学和公共卫生保健措施
MC:洞察力代谢通量分析能提供传统的代谢组学分析?
部:代谢组学提供了一个即时快照的生物学定时;然而,代谢是一个动态的过程。代谢通量描述代谢物转换的速度通过一个通路,并允许通过稳定同位素标记实验如实证估计利率。6C13葡萄糖。传统的代谢组学分析只捕捉一个快照,当样本收集。然而,使用代谢通量的研究,介绍了示踪剂在一系列时间点,允许捕获的更深层次的信息。
最简单的理解是认为自己开车时失去了回家的路上。有三种路线。他们都可以带你回家。这是一个未标记的或传统的代谢组学实验有能力告诉你。它无法告诉您如果有交通堵塞/块可能的途径之一。这是你可以获得的信息从一个“标签”的实验(流量)。此外,您可以确定交通有多快的速度移动路线选择供你选择。
知识的代谢通量(动力学)必须解开网站和代谢调节机制,从而增强新陈代谢是如何嵌入的理解细胞的决定。代谢通量,描述代谢物转换的速度通过一个通路,为识别选择性铺平了道路和新的治疗目标。
MC:一些尖端的代谢组学和lipidomics应用生命科学和临床研究?
部:现在,有一个需要分析大量的样品和在最短的时间内获得最多的信息有限的样品制备。这被称为高通量(HT)代谢组学。
然而,一些实验室做这个,而通常运行非常快的方法(90 -秒或更少)。最近访问实验室,实验室运行一个60秒的方法筛选样本得到一个完整的代谢轮廓,然后使用这些数据来推断他们的多反应监测(mrm)有针对性的分析与敏感性最高,对少数选择目标获得定量数据。这是“跳蛙式”的传统,没有针对性代谢组学工作流,实验室将收购10-15-minute方法然后花几周,如果不是几个月,深陷峰鉴别。
MS-based MC:代谢物分析的代谢组学帮助药物开发过程?
部:我上面提到的代谢组学和特别贴上“通量”分析可以帮助识别选择性和新颖的治疗目标。但使用代谢组学在这个阶段之前在“发现”阶段,基础生物研究进行识别新颖的生物标志物,和理解的作用机制。结合目标识别,代谢组学用于推断导致识别引导优化过程在早期药物发现。
一旦领先候选人,生物学团队进入“临床”阶段。代谢组学用于临床前基础研究,所以动物实验进行前和铅化合物。进行安全性研究,代谢组学已经被用于理解和探索多余的铅化合物的毒性副作用。所有这些数据用于文件(试验性新药应用程序)。
搬到“发展”阶段,临床试验开始和项目团队负责交付的大量的数据提交新药申请(NDA)开始。这里,代谢组学可用于患者分层和确定哪些患者会/应该应对治疗的问题。最近,代谢组学正在使用“制造”阶段的过程开发和扩大的过程以及质量检测包括QA / QC和lot-to-lot评估成品。
在生物制药公司,细胞培养基的优化是一个关键的步骤在biotherapeutic生产的发展和扩大。监控在过程开发的关键质量属性是通过监测小分子(代谢组学)。确保细胞培养媒体的平衡细胞生长所需营养的治疗性蛋白是至关重要的生产过程中产量和最终产品的质量。
主持人:代谢组学的研究人员还面临技术挑战研究空间?SCIEX寻求如何克服这些挑战?
部:挑战对代谢物鉴定和缺乏液体色谱-光谱法(质/ MS)对代谢物数据库确认仍然是一个巨大的瓶颈。研究人员不能推进他们的工作流可操作的结果,他们可以使生物的决定。改善代谢物鉴定和定量的诸多代谢组学在复杂样品,SCIEX合作与IROA技术。
其次,这些研究人员很难有效地处理所有的代谢组学数据从各种各样的工作流。我们的共同开拓市场关系EluciData,将允许科学家们解释这些结果在生物环境中进一步推进领域的目标识别和验证,以及潜在的生物学特征。
主持人:你想象在代谢组学研究领域将是下一个突破?
部:“精密营养”是一个术语现在社区漂浮。精密医学的目标是如何得到正确的治疗,病人的权利。然而,精密营养的目标是控制饮食而不需要任何医疗干预。的微生物及其对消化和gut-derived代谢物的影响是极其重要的。
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