加速科学研究与可伸缩的单细胞测序

单细胞测序越来越广泛采用各种领域的研究人员。然而,随着一系列的技术现在可用,很难确定哪种方法最适合解决生理问题的兴趣。此前,单细胞测序解决方案要求研究人员开始投资于昂贵的实验设备。现在,解析生物科学的使命是为研究人员提供一个端到端的单细胞测序技术只使用基本的实验室设备。

188金宝搏备用最近采访了亚历克斯·罗森博格联合创始人兼首席执行官解析生物科学更多地了解该公司及其单细胞测序的新方法。

劳拉·兰斯顿(LL):单细胞测序的出现,影响了科学研究?

亚历克斯·罗森博格(AR):单细胞测序已经改变了研究人员研究生物学。能够真正研究生物单细胞决议,有爆炸的见解和发现在每一个领域,包括免疫学、肿瘤学、神经科学和发育生物学。

要理解为什么是这种情况,值得回顾的单细胞测序之前怎么做。你使用一个复杂的样品,例如,大脑切片,然后被迫磨起来,采取单一度量值,平均在所有在场的异质细胞类型。这就意味着你会错过任何限制的生物现象单细胞类型。事实证明,大量的生物效应,甚至疾病实际上是由一个或几个不同的细胞类型。

现在,随着单细胞测序,研究人员可以精确定位到特定的细胞类型发生变化,复杂的组织。这是变革的理解疾病进展背后的关键机制,扩大我们对基础生物学的理解。

凯特·罗宾逊(KR):你的转录组技术如何工作和如何帮助进行单细胞实验?

基于“增大化现实”技术:我们的单细胞测序的方法从根本上不同于其他,因为我们使用一种叫做组合条码。所有其他解决方案隔离单个细胞成隔间,通常需要复杂的微流体。相比之下,我们能够独特标签每个细胞内的分子而不必实际分离单个细胞。

我们的方法本质上是可扩展的,允许用户使用它没有任何定制的工具。与我们的单细胞全转录组包,您可以序列100000细胞和48样本,更比其他任何产品。没有自定义工具这一事实也意味着储蓄的资本成本,并允许用户立即开始。

我们包的另一个优点是它们提供的灵活性。对于很多应用程序,你可能会收集生物样品的几个星期。与现有的解决方案,您需要运行一个单独的单细胞实验每次收集新的样本。与我们的包,你可以迅速修复和存储你的样本集合,然后运行一个并行实验与所有这些样本在稍后的时间。

同样值得指出我们最初展示了这种方法科学在2018年,但从那以后我们把巨大的改进到我们整个转录组套件。工作流已经精简和灵敏度显著提高。我们整个转录组的用户设备看到一个巨大的基因检测到每个细胞的数量增加。

基米-雷克南:你能详细说明,该工具允许单细胞实验没有昂贵的实验设备?

基于“增大化现实”技术:我已经暗示了这一点,但是通过利用split-pool组合条码,我们允许研究人员分析单细胞转录组没有微流控工具。通过分配一个特定的条形码每个加载到细胞,细胞本身的我们可以利用自己的隔间。我们重复一个细胞分裂的过程到井,增加细胞内记录,well-specific条形码然后repooling细胞,最终与一个独一无二的结合条形码标签每一个细胞。其他单细胞方法需要特殊的设备,利用先进的微流体进行单细胞分区和条码。

基米-雷克南:如何从设备生产的数据生成使用流式细胞术有何不同?

基于“增大化现实”技术:流式细胞术的一大限制是你有限的测量几每个细胞的基因。这可以工作好了,当你知道你正在寻找什么,但是你总是会错过大多数的生物学样本。的伟大之处做单细胞测序与我们的包是可以测量所有基因表达以公正的方式。这种程度的决议允许您检测细胞之间的微妙差异,你会错过与流式细胞术。我们包的可伸缩性,你仍然可以大量的细胞样本,就像与流式细胞术。我希望在未来的几年中大部分的流式细胞仪市场将切换到单细胞测序。

噢,你想象什么应用程序工具包使在未来?

基于“增大化现实”技术:研究人员在几个不同的领域,已经通过我们的早期访问计划利用我们的工具。实验运行范围——从免疫学、肿瘤学、神经科学、发育生物学。

我将与你分享一个有趣的例子。一些研究人员一直在使用我们的工具来研究神经科学在不同的物种。过去,比较基因组学使研究者了解神经系统的发展,但很多可用的工具已经限制理解物种之间的基因差异在DNA水平。我们看到的是,研究人员使用我们的工具可以了解神经系统在细胞水平上发展。这是至关重要的神经回路和了解一些物种可能已经适应了他们的特定的环境。

我们看到每天单细胞测序的新应用程序。真的,我们现在才经历单细胞测序采用的第一波。未来5年,我认为它是安全的说,我们将看到一个巨大的繁荣应用程序和发表的研究利用这一技术。

亚历克斯·罗森博格与劳拉·伊丽莎白·兰斯顿说话,主编和凯特·罗宾逊,助理编辑技术网络。188金宝搏备用