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合作推动核磁共振结构生物学研究


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Domainex而且ZoBio宣布与FORMA Therapeutics合作,为FORMA药物靶点的大量面板提供基于nmr的结构生物学服务。

我们采访了Domainex业务发展主管Joanne McCudden博士,了解更多关于该公司以及他们在药物研发项目中的参与情况。

AB:你能详细介绍Domainex和你们提供的服务吗?

乔安妮·麦卡登(JM):Domainex是一家英国生物技术公司,采用混合商业模式。这意味着它提供药物研发服务和技术,以推进客户的项目并产生收入;所产生的收入使其能够开发自己的治疗管道,所需的额外投资最少。

Domainex的服务业务不仅包括其专有的组合域搜索技术,用于识别蛋白质药物靶点的可表达域,而且还包括完成靶点到候选药物发现计划所必需的全套功能。

这包括:

-用于结构研究和/或检测开发的蛋白质生产。对于某些项目,产生的蛋白质将被送到ZoBio进行基于nmr的分析;这将为药物发现项目和化合物设计决策提供关键的结构信息。

-化合物筛选的生化分析开发

定制的细胞分析开发,以实现二级化合物筛选和生物途径的探测

-使用虚拟手段或基于碎片的方法进行命中识别

-药物化学

-计算化学

- DMPK测试

AB:你能告诉我Domainex在FORMA Therapeutics的药物研发项目中的更多情况吗?

JM:Domainex和ZoBio正在密切合作,帮助FORMA的一些癌症药物研发项目取得进展。FORMA有一个非常令人兴奋和雄心勃勃的药物发现研究方法,即并行探索广泛的药物靶标类别。在Forma成立的前五年里,他们在肿瘤代谢、表观遗传学、蛋白质稳态和其他必需蛋白质-蛋白质相互作用的核心重点领域探索了110多个靶点。当然,FORMA调查的一些目标比其他目标更具挑战性。这就是ZoBio和Domainex进入的地方,因为我们能够利用我们的专有技术和专有知识来降低早期药物发现步骤的限制。更具体地说,这意味着:

对于在大肠杆菌中表达不是关键挑战的蛋白质,ZoBio将生产用于结构研究所需的蛋白质。

如果表达是一个特别的挑战,Domainex将利用其组合域搜索(CDH)技术(http://www.domainex.co.uk/proteinexpression.asp)鉴定蛋白目标的结构域结构,该结构域可以在大肠杆菌中可溶性部分表达,纯化后表现出天然折叠。传统的分子生物学方法可以一次评估10-100个蛋白质结构。Domainex的CDH技术可以一次筛选20,000-120,000种不同结构的目标蛋白,以获得最佳特性!通常情况下,最好的5个蛋白结构将被纯化并进行结构研究。

产生的蛋白质然后被ZoBio用于核磁共振研究。ZoBio是世界领先的蛋白质核磁共振(NMR)专家,可用于阐明复合目标相互作用的分子基础,补充x射线晶体学方法。核磁共振是目前唯一的替代晶体学能够阐明原子分辨率,三维结构信息。因此,它是靶向更具挑战性的药物靶点的关键。

AB:在项目期间,你将如何密切地与ZoBio合作?

JM:Domainex和ZoBio将密切合作,因为两家公司在项目中拥有不同的技能和能力。两党之间已经有了思想的交叉交流,这是非常令人兴奋的。在这次合作中,整体肯定大于部分的总和。

AB:你们与ZoBio的合作是如何加强两家公司的产品?

JM:ZoBio是世界上使用NMR进行药物发现的领导者。当晶体学不能使用时,核磁共振是3D结构信息的唯一选择,它对于新颖和具有挑战性的药物靶标是非常强大的。Domainex和ZoBio在FORMA Therapeutics药物发现项目上合作良好,并希望在不久的将来继续与其他客户合作。

AB:你认为在项目期间最大的挑战是什么?

JM:我认为我们已经克服了最大的挑战,那就是在任何问题出现时都要诚实和开放。为了挽回面子,你很容易把问题埋藏起来,试图自己解决问题。然而,在ZoBio、Domainex和FORMA之间,我们共同努力克服了问题。我们都有不同的专业知识和能力,以及不同的看待事物的方式。科学地分享想法会更好,但这样做也会让工作关系更愉快!

Joanne McCudden博士接受了技术网络执行编辑Ashley Board的采访。188金宝搏备用

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