防治农作物感染
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从甜菜糖产量占世界20%的供应量。白粉菌属betae,甜菜白粉病可以导致糖产量损失高达20%。目前,减少大肠betae所带来的影响,主要的方法是真菌的治疗和一系列部分抗性品种。然而,尽管年度调查e . betae流行对疾病的多样性,其感染源和菌株后再次感染真菌的治疗。
为了提高我们理解这种真菌感染植物和微生物基因组学小组TGAC已经被英国授予£100 k甜菜研究组织。更详细地讨论这一融资和白粉菌属betae我们采访了劳伦斯Percival-Alwyn博士在TGAC在植物和微生物基因组学研究助理。
JR: TGAC最近获得£100 k对识别感染和再感染的来源的甜菜作物在英国。有哪些主要的疾病感染甜菜在英国,目前他们是如何处理?
LP:甜菜是容易受到大量的病原体对生产力和质量造成严重的约束。病原体导致英国与甜菜生产主要问题分为三类:
真菌:尾孢属beticola,白粉菌属betae, Uromyces beticola和Ramularia beticola,导致尾孢属叶斑病,白粉病,甜菜防锈、Ramularia叶斑病,分别。甜菜的叶面真菌疾病通常由种植抗性品种、轮作、或通过杀菌剂的应用程序。我们的项目是研究大肠betae和一定程度上的beticola。
病毒:病毒黄色一群aphid-transmitted病毒性疾病包括甜菜黄化病毒,甜菜轻微泛黄病毒和甜菜萎黄病病毒,导致树叶变成黄色和增厚。这种疾病是由钻井控制种子与杀虫治疗与良好的农场卫生实践减少蚜虫向量。Rhizomania根”“疯狂的甜菜是一种严重的疾病,造成甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)传播的oomycete Polymyxa betae。这种疾病是通过部分抗性品种的管理。
线虫线虫:甜菜囊肿(BCN)是一个全球甜菜的主要害虫。它侵入根部,阻碍经济增长。BCN宽容的品种是可用的,阻力已经从野生物种繁殖到现代的甜菜。
JR: TGAC最近获得£100 k对识别感染和再感染的来源的甜菜作物在英国。有哪些主要的疾病感染甜菜在英国,目前他们是如何处理?
LP:甜菜是容易受到大量的病原体对生产力和质量造成严重的约束。病原体导致英国与甜菜生产主要问题分为三类:
真菌:尾孢属beticola,白粉菌属betae, Uromyces beticola和Ramularia beticola,导致尾孢属叶斑病,白粉病,甜菜防锈、Ramularia叶斑病,分别。甜菜的叶面真菌疾病通常由种植抗性品种、轮作、或通过杀菌剂的应用程序。我们的项目是研究大肠betae和一定程度上的beticola。
病毒:病毒黄色一群aphid-transmitted病毒性疾病包括甜菜黄化病毒,甜菜轻微泛黄病毒和甜菜萎黄病病毒,导致树叶变成黄色和增厚。这种疾病是由钻井控制种子与杀虫治疗与良好的农场卫生实践减少蚜虫向量。Rhizomania根”“疯狂的甜菜是一种严重的疾病,造成甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)传播的oomycete Polymyxa betae。这种疾病是通过部分抗性品种的管理。
线虫线虫:甜菜囊肿(BCN)是一个全球甜菜的主要害虫。它侵入根部,阻碍经济增长。BCN宽容的品种是可用的,阻力已经从野生物种繁殖到现代的甜菜。
JR:你的研究的一个主要目标是设计一个快速检测测试e . betae白粉病,甜菜产量减少20%。e . betae和流行情况如何如何测试帮助减少疾病的影响?
LP:大肠betae的患病率是依赖于冬天的严重性,作为温和的冬季大大增加病原体在接下来的这个夏天的发病率。由于冷却器2014/2015冬季,今年的预测预测,只有22%的作物是危险而风险是在前一年的56%。
目前,我们了解真菌的治疗和作物品种都不影响不同的大肠betae种族的成功。这是特别重要的,一些使用triazole-strobilurin杀菌剂进行审查,由于担心其对______的负面影响人的内分泌系统。
通过研究大肠betae感染在农业环境的多样性前后杀菌剂治疗,我们将提高我们的理解病原体治疗后再次感染甜菜的种族。识别的大肠betae污渍与杀菌剂抵抗/公差将改善疾病预测和通知真菌的治疗和品种的选择。快速dna检测协议将基于基因组变异信息而设计的。这将使早期检测和鉴定大肠betae菌株。这个检测系统,结合的理解病原体毒力种群动态和演化,将使病预测模型的改进。,反过来可以用来影响决策在杀菌剂的应用程序。
JR: TGAC还计划生成另一个甜菜病原体的基因组组装,草案Uromyces beticola。什么是已知的致病剂,你希望通过研究发现其基因组?
LP:尽管美国beticola感染的症状描述,对这个物种的基因组。锈真菌中最复杂的生命周期的真菌。生锈可以有多达五种不同类型的孢子在复杂的生命周期,可以涉及到越来越多的在不同的时间在不同的主机上。一个复杂的生命周期结合预留biotrophic生活方式使得基础研究在生锈的困难。
通过生成一个草案基因组组装的beticola我们希望为进一步努力加强我们的理解主机/病原体相互作用的分子机制。其中一个方法是使用比较基因组学和效应器矿业识别候选病原体效应物,用于抑制宿主免疫反应。
LP:大肠betae的患病率是依赖于冬天的严重性,作为温和的冬季大大增加病原体在接下来的这个夏天的发病率。由于冷却器2014/2015冬季,今年的预测预测,只有22%的作物是危险而风险是在前一年的56%。
目前,我们了解真菌的治疗和作物品种都不影响不同的大肠betae种族的成功。这是特别重要的,一些使用triazole-strobilurin杀菌剂进行审查,由于担心其对______的负面影响人的内分泌系统。
通过研究大肠betae感染在农业环境的多样性前后杀菌剂治疗,我们将提高我们的理解病原体治疗后再次感染甜菜的种族。识别的大肠betae污渍与杀菌剂抵抗/公差将改善疾病预测和通知真菌的治疗和品种的选择。快速dna检测协议将基于基因组变异信息而设计的。这将使早期检测和鉴定大肠betae菌株。这个检测系统,结合的理解病原体毒力种群动态和演化,将使病预测模型的改进。,反过来可以用来影响决策在杀菌剂的应用程序。
JR: TGAC还计划生成另一个甜菜病原体的基因组组装,草案Uromyces beticola。什么是已知的致病剂,你希望通过研究发现其基因组?
LP:尽管美国beticola感染的症状描述,对这个物种的基因组。锈真菌中最复杂的生命周期的真菌。生锈可以有多达五种不同类型的孢子在复杂的生命周期,可以涉及到越来越多的在不同的时间在不同的主机上。一个复杂的生命周期结合预留biotrophic生活方式使得基础研究在生锈的困难。
通过生成一个草案基因组组装的beticola我们希望为进一步努力加强我们的理解主机/病原体相互作用的分子机制。其中一个方法是使用比较基因组学和效应器矿业识别候选病原体效应物,用于抑制宿主免疫反应。
JR:全基因组测序甜菜最近被释放。你能告诉我们关于揭露小说抗性基因的可能性,一旦大肠betae基因组也被测序吗?
LP:目前尚不清楚如何代表当代白粉病抗性现场试验所使用的培养液行业发现抗性品种。通过了解病菌菌株的多样性我们获得必要的信息来帮助我们改善未来的实地试验发展品种耐到广泛的大肠betae菌株。
大肠betae感染也发现许多野生甜菜主机上(甜菜属(无性系种群。Maritima),βmacrocarpa和β(现在Patellifolia) patellaris)。在野外,病原体和宿主都能够co-adapt。这意味着野生环境可以推动新型病原体的进化种族还寄主植物抗性。一旦有了序列信息可以在野外检测病原体种族之间的联系和那些闯入种植甜菜。我们希望这项研究将支撑未来的研究来确定抗性基因在野生甜菜可以培育成甜菜品种。
劳伦斯博士Percival-Alwyn杰克拉德说,编辑技术网络。188金宝搏备用
LP:目前尚不清楚如何代表当代白粉病抗性现场试验所使用的培养液行业发现抗性品种。通过了解病菌菌株的多样性我们获得必要的信息来帮助我们改善未来的实地试验发展品种耐到广泛的大肠betae菌株。
大肠betae感染也发现许多野生甜菜主机上(甜菜属(无性系种群。Maritima),βmacrocarpa和β(现在Patellifolia) patellaris)。在野外,病原体和宿主都能够co-adapt。这意味着野生环境可以推动新型病原体的进化种族还寄主植物抗性。一旦有了序列信息可以在野外检测病原体种族之间的联系和那些闯入种植甜菜。我们希望这项研究将支撑未来的研究来确定抗性基因在野生甜菜可以培育成甜菜品种。
劳伦斯博士Percival-Alwyn杰克拉德说,编辑技术网络。188金宝搏备用
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