开发新型液体活检肿瘤测试
为了提高癌症和其他疾病的检测和监控,开发创新的液体活检技术的兴趣还在继续增长。通过检测和分析小说生物标记物从体液,如血液,液体活检可以为临床医生提供深刻见解病人的癌症,同时避免与传统诊断方法有关的一些局限性。然而,尽管液体活检可以提供的优势,更广泛地使用这些测试仍然是有限的几个因素。
想要了解更多关于液体活检存在的潜力,以及挑战,限制其广泛的临床应用,188金宝搏备用张向Aiguo(亚当),首席执行官,笔金额。在这次采访中,张还讨论的一些技术,笔在液体活检空间发展,分享了他对于未来的思考可能的领域。
问:你能告诉我们关于笔的起源及其技术?
阿兹:笔是一个分子诊断公司几十年的研究证实在下一代测序(门店),循环DNA (cfDNA)监测、游离和癌症诊断化验。几年来我们团队的科学家一直致力于研究方法等早期癌症检测液体活检诊断传染病和肿瘤疾病的新方法。结合我们的创始成员的专长在诊断空间与他们的创业精神,我们在2011年成立了笔提前诊断使用新颖的测序方法和技术进行各种各样的迹象,包括基因突变检测、癌前病变和癌症诊断,和癌症治疗毒性监测。笔的诊断检测盒是由两个专有平台之一,XNA技术或SuperbDNA™。
问:如何循环肿瘤DNA (ctDNA)被用来检测和管理疾病如癌症吗?它作为生物标志物提供什么福利?
阿兹:个性化医疗-特别是精密肿瘤学现在提供病人的肿瘤的分子特性通过组织活检有助于指导治疗决策。然而,完全实现个性化肿瘤学领域的,需要有一个易于访问和微创方法来确定并遵循肿瘤的分子组成的时刻的检测和治疗的疾病。其中一个方法是通过液体活检,肿瘤的遗传特性可以通过biofluid样本进行评估。术语“液体活检”是指tumor-derived分析物采样从各种生物液体,通常血液,以及其他临床标本如尿液、唾液、腹水和脑脊液。
cfDNA或DNA降解游离DNA片段释放到血液细胞。介绍了几种不同类型的cfDNA血液循环和其他生物液体。ctDNA或循环肿瘤DNA的一小部分cfDNA表明体内肿瘤的存在。绝大多数cfDNA发生,通常被称为野生型DNA。与传统组织活检相比,液体活检的优点简单的可访问性和微创的病人。医生不需要执行一个程序检索从肿瘤组织样本,可能获得生物标记从一个简单的抽血。液体活检是一个日益严重的资源基因组和遗传的分子生物标志物在ctDNA cfDNA。
不断发展的技术和高灵敏度检测cfDNA促进了就业的液体活检在不同临床应用,包括肿瘤学。循环肿瘤DNA从人血浆的循环肿瘤细胞(CTC)可能在多个时间点进行分析疾病的整个过程。液体活检的方法患者分层治疗(称为“同伴诊断”),检查,监测响应所选择的治疗和检测微小残留病(MRD)手术后。
问:什么挑战目前限制使用更多的ctDNA诊断?
阿兹:尽管液体活检测试的流行,许多医生仍然使用老的诊断方法来识别癌或癌前条件和基因突变作为信号的条件。传统上,诊断结直肠癌(CRC),医生开出stool-based测试套件(合适的),可以在家里或在临床设置。粪便样本然后运到实验室,为分析提供了工具,医生和患者接受结果在几周,如果不是几个月。在传统的组织活检,医生进行手术获得从肿瘤组织样本,然后进行分析,以确定样品是否癌变。
新的创新方法blood-based液体活检测试也有各种各样的限制。尽管高特异性检测各种形式的癌症和基因突变,生物标志物的检测灵敏度在液体活检医生也是一个挑战,是一个瓶颈为更广泛地使用这些测试。许多液体活检测试依赖目标放大,这意味着DNA序列变异放大当样品被分析。经常引起目标放大方法信号干扰的绝大多数放大DNA序列是野生型。
病人和医生需要在临床护理病人抽血,而不是使用一个在家自行测试套件。一些blood-based测试不符合标准的实验室设备和需要专门的仪器不广泛使用在大多数实验室。液体活检测试同样经历传统诊断方法的问题,样品被发送到外部实验室进行分析。尽管与多个据点,提供精确的结果目前液体活检方法效率低下的卫生保健提供者的工具和高风险的患者必须等待几周接受结果。
问:笔有两个主要的技术平台,SuperbDNA信号放大技术和XNA分子钳技术。你能描述一下每个技术及其诊断应用程序吗?
阿兹:笔诊断测试和blood-based XNA的分析都是基于两个专有技术平台技术和SuperbDNA信号放大技术。XNA xenonucleic酸,合成核酸分子杂交的寡聚物目标野生型的DNA序列,可以用作分子夹在定量实时聚合酶链反应(qPCR)。XNA是互补的野生型的DNA序列,设计松散结合突变序列,从而抑制野生型序列和变异序列的扩增PCR反应。这允许笔XNA-mediated化验检测低至极限0.1% VAF从一个病人ctDNA使用血液。
笔金额正在开发一些XNA-mediated化验证明高特异性和敏感性检测少量的DNA序列在肿瘤学和超越目标。笔金额QClamp®基因突变检测测试使用XNA技术检测阶段0到4基因突变信号癌前,通过一个简单的抽血癌变条件。大肠癌的ColoScape™突变检测设备标识长被称为良性肿瘤晚期腺瘤或息肉时,信号CRC正在形成,或病人患CRC的风险。
笔还开发了SuperbDNA定量或定性技术来测量目标DNA或RNA的存在,帮助医生确定治疗癌症患者。其他分子诊断方法扩大样本的DNA或RNA的目标,有时会导致交叉污染问题或困难的分析测定。SuperbDNA技术中使用的信号放大检测目标直接DNA或RNA。通过一系列的杂交捕获探针之间的反应和目标探测,SuperbDNA技术放大信号从目标探测,正比于样品,没有任何DNA或RNA提取步骤。
的QuantiDNA™cfDNA测试,由SuperbDNA技术,用于量化的总量cfDNA直接从血浆样本在病人接受癌症化疗或放疗。这些疗法不仅杀死肿瘤细胞,但也正常细胞。当这些疗法导致损伤正常细胞,临床医生称之为“毒性”。笔RadTox™cfDNA液体活检测试可能是专门用于测量在癌症患者放疗毒性,使医生能够直接监测副作用严重程度和肿瘤反应的几天内放射治疗开始。大多数癌症患者血液中的cfDNA类似的基线水平,随着辐射增加cfDNA不同层次不同的个体。通过确定cfDNA水平在癌症患者的血液辐射后,医生可以识别病人的个性化的辐射敏感性和估计辐射毒性的风险最高。RadTox可能允许剂量升级不敏感的肿瘤病人过度治疗和减少风险的高度敏感的患者,给予医生能够确定哪些患者有不利影响的风险或治疗前不同的敏感性。RadTox可能让医生有机会制定护理在治疗一个基线,并相应地调整剂量水平在治疗。
问:如何笔数字PCR技术比较替代技术,如液滴(ddPCR)和门店?
阿兹:第一笔技术优势在ddPCR或门店是成本。笔XNA平台和SuperbDNA年代我gnal放大技术兼容常用桌面热周期计或PCR机器,不需要专门的和昂贵的设备与其他两个。这允许笔平台分析样品在临床或一个标准实验室设置,减少了需要一个大型交通基础设施作为供应链的一部分。此外,笔专用科学平台提供准确和敏感的结果在更少的时间比门店和ddPCR——门店和ddPCR需要3 - 5天交付成果而笔技术交付时间的顺序。我们的技术提供了一个便宜的和时间有效替代当前的点突变检测和标准程序比ddPCR或门店有更高的吞吐能力。此外,他们甚至是有效的在极低的样本大小:XNA-mediatedQClamp®检测基因突变检测测试VAF VAF 0.1%到0.5%有针对性的突变突变DNA野生型的DNA。这种低检测极限允许使用的笔化验早期检测癌前病变和癌肿瘤,而传统技术需要更大的样本量和不太敏感的有针对性的基因突变。
问:笔已经越来越多的同行评议的出版物支持其诊断技术。你能提供更多细节在这些最近的研究吗?
阿兹:笔金额继续研究的临床适用性、敏感性和特异性的诊断测试,和几个同行评议的出版物出版平台和产品。最近发表在《公共科学图书馆•综合》发现ColoScape基因突变检测装备临床特异性为100%和CRC的临床检测的敏感性92.2%,和95%的临床特异性和临床检测癌前病变的敏感性为62.5%。本研究验证ColoScape检测癌前病变的诊断应用,在早期癌症检测结直肠癌和援助。
一项研究发表在自然科学报告表明笔cfDNA生物标记算法可能作为预后的生物标志物和对化疗的疗效预测非小细胞肺癌(NSCLC)患者。使用样本来衡量笔金额QuantiDNA™cfDNA测试中,研究人员发现等离子cfDNA与临床相关的动力学响应和无进展生存根据一个算法在非小细胞肺癌患者接受化疗。
问:笔也在开发肿瘤以外的诊断测试。你能告诉我们更多关于其他疾病领域,目标是笔?
阿兹:笔QuantiVirus™SARS-CoV-2测试依赖XNA-mediated技术来识别已知病毒的变异,包括买卖变体。XNA的能力作为补充野生型序列允许适应SARS-CoV-2测试目标和区分新兴COVID-19变体。
第一代QuantiVirus™SARS-CoV-2测试和第二代QuantiVirus SARS-CoV-2多路检测组件收到紧急使用授权(欧洲大学协会)从美国食品和药物管理局(FDA)在其他几个全球监管机构的批准。2020年9月,美国食品和药物管理局发布性能数据在58个不同分子冠状病毒测试和认可这两笔金额QuantiVirus SARS-CoV-2测试套件和QuantiVirus SARS-CoV-2多路检测组件作为最敏感的两个测试套件授权下欧洲大学协会在美国。我们QuantiVirus以外的美国SARS-CoV-2测试套件已经CE /试管标记和批准在欧盟,北美和亚洲。
我们也在开发和商业化CE / IVD-certified QuantiVirus HPV(人乳头瘤病毒)E6 / E7信使rna测试帮助临床医生识别个体最持续感染的风险。人乳头状瘤病毒显示发展的一个主要危险因素侵袭前或浸润性癌,和其他检测方法不区分持久和短暂的感染。我们的研究得出结论:人乳头状瘤病毒E6 / E7信使rna检测在宫颈脱落细胞可能是一个潜在的妇女患有乳腺癌的分类选择最有可能患宫颈癌的风险。
笔是另一个新发展的兴趣追求伴侣的罕见疾病诊断之前被忽视。
问:我们能期待的未来液体活检和笔吗?
阿兹:液体活检将继续扩大,医疗服务提供者地址需要准确的早期癌症检测和治疗毒性监测。液体活检开发者还必须商业化液体活检测试,所以他们随处可见,很容易实现卫生保健专业人士。笔金额继续发展其诊断技术通过发起更多在活的有机体内研究和收集更多的证据表明,其测试不仅是临床适用,但也为每个条件和特定的高度敏感。我们还设想我们的技术扩展到其他迹象除了癌症和COVID-19诊断。因为XNA被设计成100%补充野生型的DNA序列,这种技术可能会适应在各种迹象显示和诊断。笔金额识别和XNA的潜力SuperbDNA技术检测和监测其他疾病通过针对特定RNA和DNA序列,我们期待推动液体活检技术在其他诊断应用程序。
Aiguo张晓强安娜·麦克唐纳,科普作家技术网络。188金宝搏备用
