从有限样本中富集突变

去年介绍的，来自EKF Diagnostics的PointMan™DNA富集技术，已被证明足够灵敏，可以使用血液样本来评估癌症患者的突变状态。最近的研究表明，PointMan的敏感性远远大于现有的PCR技术，很明显，这项技术前景广阔。

为了了解更多关于PointMan，与斯旺西大学的合作以及未来的发展，我们采访了EKF分子诊断公司的产品经理Gary Dowthwaite博士和该公司的首席执行官Andrew Webb。

AB:您能介绍一下EKF分子诊断和PointMan DNA富集技术吗?

Gary Dowthwaite (GD): EKF Molecular与医疗保健行业合作，提供卓越的分子诊断技术，以支持个性化医疗。EKF Molecular拥有快速增长的PointMan DNA富集试剂盒组合，用于检测临床可操作靶基因的突变，如KRAS, BRAF, EGFR, NRAS, JAK2和ESR1。利用超灵敏和特异的PointMan技术，富集试剂盒是理想的研究工具或体外诊断工具，用于了解生物标志物和药物反应之间的关系。

PointMan DNA富集试剂盒是一种高度敏感和选择性的工具，能够从有限的固体组织样本和液体活检中富集突变序列。PointMan DNA富集试剂盒的工作原理是使用简单的试剂集(见图1和图2)与标准DNA提取物结合，并在实时热循环平台上运行，增强点突变序列的DNA样本。富集的PointMan产物可以与标准的下游检测方法结合使用，如PCR、焦磷酸测序和Sanger测序。

图1和图2

AB:与等位基因特异性PCR等其他技术相比，PointMan有什么优势?

GD:与等位基因特异性PCR不同，PointMan DNA富集不需要对任何给定密码子中的每个突变进行单独的引物/探针。例如，在EGFR基因的密码子19中有超过20个突变，这些突变是通过单一的PointMan反应而富集的。这减少了检测这些突变的反应数量和成本。此外，PointMan富集引物有效地阻断了野生型扩增，从而避免了与等位基因特异性PCR相关的潜在引物缺失。

AB:您最近与斯旺西大学生命科学研究所合作的结果表明，有可能对癌症进行简单的血液检测，您能详细介绍一下这项研究和下一步的工作吗?

GD:利用威尔士癌症银行的样本，斯旺西ILS的Ricardo Abascal博士团队使用PointMan DNA富集技术检测来自FFPE(福尔马林固定和石蜡包埋)组织和同一黑色素瘤患者血液的实体肿瘤DNA中的BRAF和KRAS突变。此外，Abascal博士的研究小组还利用PointMan富集技术在子宫内膜癌患者的组织样本和血液中检测BRAF突变。目前，这些数据显示血液和组织样本之间的一致性，证明了与两种癌症类型相关的突变都有可能在血液中检测到。EKF分子和ILS，斯旺西正在共同努力，以增加样品数量，并确定DNA提取和富集的标准操作程序。

AB:在这项技术进入临床之前，需要采取哪些步骤?

安德鲁·韦伯:迄今为止积累的数据是证明使用PointMan DNA富集的基于血液分析的临床用途的第一步。虽然癌症的初步诊断仍将在病理学家的领域内，但预计在治疗期间甚至缓解期间的疾病监测将由PointMan技术促进。正因如此，我们正在寻求合作伙伴启动临床试验，以确定PointMan在监测下一代靶向治疗有效性方面的临床效用。

AB:目前PointMan用于肿瘤生物标志物的研究。未来是否有关注其他疾病领域的计划?

GD:制药公司越来越多地利用基因数据开发肿瘤学以外的靶向疗法。因此，EKF分子诊断正在研究利用PointMan DNA富集在其他疾病领域的诊断、预后和治疗监测中，检测罕见序列的能力将比现有技术更有优势，并提供更好的患者预后。

Gary Dowthwaite和Andrew Webb接受了技术网络执行主编Ashley Board的采访。188金宝搏备用你可以找到阿什利谷歌+并关注科技网络188金宝搏备用推特．