自动化如何帮助避免下一代测序错误在“伟大的辞职”

担忧手工测序和再现性的挑战出现在科学和大众媒体。有许多因素和影响在科学学科,但是需要关键的注意是减少人为错误是获得高质量的一个因素下一代测序(上天)研究数据。

总会在图书馆准备创建编码DNA片段的过程从一个样本进行测序——是劳动密集型的,且易于出错当手动执行,更不用说潜在的实验室人员的倦怠。的复杂性和严格的性质准备挥动库强调了资源致力于质量控制:每隔几个步骤,看起来,你检查核酸浓度,产量、片段大小和纯洁。

自动化有助于克服的错误是什么?

能够手动处理液体在图书馆准备上下文的一致性需要练习和耐心。即使这样,不容易画和准确地提供小型液体体积不同的粘度,混合detergent-containing缓冲区没有泡沫,洗微观珠子多次但与其说他们洗掉。

我永远不会忘记我第一次图书馆准备的经验。我的上司做ChIP-Seq实验和要求我的帮助。自从我做了数以百计的PCR和克隆实验中,我的能力有信心追随自己的协议,然而我的上司想让我们准备一组并行:终极考验!尽管我的经验,我仍然可以听到她喘息洗珠球有点太积极。她开始仔细的看着我,指出各种缺点——从我俯身在试剂,非常昂贵,我吸管弹出提示的方式,这可能会污染整个三楼!最后,我们检查我们的进展生物分析仪仪器。我总尴尬,我一半的样本完全消失,余下的则充满了可疑的大小的碎片。这是一个快速的教训在自动化的价值!

即使那些最有经验的准备与图书馆、大量的预备步骤,乘以预备在一周完成的数量,相当于一个统计保证错误。我的老板也不例外。

自动化图书馆准备简单,易于使用的方式,然而,不仅仅是关于液体处理。它需要空间规划以及战略,以帮助消除另一个常见的错误:交叉污染。看经验丰富的技师执行图书馆准备和你会发现首先他们安排实验室的器具和试剂在其工作空间来减少污染的机会。然后看着他们小心地操作移液管技巧,在工作区以防止任何意外滴污染清洁管子。

我们设计了Biomek NGeniuS下一代图书馆准备系统*这种认真的工作空间管理。我们开发了一个精心布置了甲板,连同一个光学分析系统称为动态DeckOptix。加上抬头显示器背面的内侧壁仪器,该系统为用户提供了实时反馈在实验室的器具的位置设置一个批处理运行。

总会在图书馆准备如何保持足够灵活,可以很好地处理不同的图书馆准备工具和仍然是可靠的吗?

之前我们介绍了Biomek NGeniuS系统,很难找到上天的自动化“甜蜜点”研究图书馆准备。对于那些愿意牺牲协议的灵活性,有NGS-specific自动化工具可用,但他们往往把您锁定到一个特定的化学或图书馆准备的方法。如果你想要保持灵活地使用不同的图书馆准备化学和方法,你必须牺牲易用性来创建一个定制的自动化工作流使用通用自动化液体处理系统,需要广泛的专业知识。

除了实验室的器具的位置验证DeckOptix系统提供其它护栏,以帮助确保成功的预备。例如检查盖子,确保实验室的器具库存需要执行的证明方法,并自动选择合适的提示音量。然而,我最喜欢万无一失的特性是其阅读试剂标签的能力,包括大多数手写标签。用户只需加载试剂旋转木马,让系统识别它们。每一批试剂验证以匹配所选的协议和自动保持在适当的温度。正是这种特性,给出了Biomek NGeniuS系统的灵活性与大多数商业图书馆准备工具和方法。

这个特性还有助于猜测的故障排除。如果你曾经不得不排除失败的准备,不知道如果你使用了错误的酶,或如果你的样品被由于储存不当引起的,这可能是你最喜欢的特性。

自动化图书馆准备如何帮助我们在伟大的辞职和提高实验室的士气?

各种规模的实验室和学科都在努力维持生产率在大流行期间。社会距离要求和设施关闭迫使实验室工作人员,他们用于工作挤在一块儿,胳膊碰胳膊了,采取轮班和做任何方面的工作他们可以在家。毫无疑问大流行开远程自动化很感兴趣。

的Biomek NGeniuS系统是专为远程操作的一个或多个设备同时加载一次。与温度一夜之间占有试剂存储,这个系统可以运行。它还包括一个集成thermocycler帮助延长离开那些需要它的预备协议的时候了。

科学家和技术人员对改善全球健康和幸福,充满热情和动机是研究个性化医疗的承诺兑现。虽然有很多感谢自动化的能力大大减少图书馆准备错误,也许更大的升值是多余的时间让他们专注于研究,设计新方法,或者开发新的生物标志物面板。

将自动化引入实验室,做很多手工图书馆准备可以创建一个积极提高士气和留住员工,让他们关注研究,而不是研究工作流。

* Biomek NGeniuS下一代图书馆准备系统不能或验证用于疾病的诊断或其他条件。在发展。性能特征没有被验证。

每个应用程序模板用于Biomek NGeniuS下一代图书馆准备系统已经证明但尚未验证贝克曼库尔特。贝克曼库尔特没有任何类型的保证,表示或暗示,对应用程序模板,包括,但不限于,保证健身为特定目的的适销性或应用程序模板的嫌疑。保证都是明确否认。你使用任何应用程序模板,你将承担所有的风险,无追索权贝克曼库尔特。

产品和演示应用程序不能或用于诊断程序进行验证。

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