体外完整性:最大化Plate-Based化验数据的价值

体外筛选化验使用各种各样的工具,在不同的格式输出数据。最大化的价值数据,更标准化的分析是必要的。Genedata过滤网的软件,更新版本15今年早些时候,旨在简化数据工作流和简化分析。我们赶上了奥利弗博士利文湖头Genedata过滤网欧洲业务,讨论的问题难于集成数据和研究如何使数据更加标准化,可访问和可共享的同时不影响安全性和完整性。

Ruairi Mackenzie (RM):非标准,难于集成数据破坏研究?

奥利弗·利文湖(OL):在回答这个问题,我想我们所说的数据集成定义为两种类型的集成挑战常常困惑:技术集成和语义集成。技术集成仅仅意味着我可以访问和结合数据而语义集成意味着我能够理解和处理的综合数据。例如,让我们来比较一下两个Word文档,一个律师写的,另一个医学研究人员。虽然文件可以很容易地交换和组合通过技术如电子邮件或文件共享服务,他们是由不同的主题专家有不同的视角和使用不同的语言。因此,文档的深度和意义可能不会完全理解各自的另一方。在某些情况下,根据上下文,同一个词甚至可能有完全不同的含义。

Genedata,技术集成是一个小问题,我们会把我们的精力集中于简化的语义集成。我们确保所有的实体由软件有一个明确的意义,隐式或通过注释在一个受控制的方式。完整的跟踪记录的结果和他们的注释和底层数据处理方法,用户输入文档语义上下文。这实际上是一个大问题——它可能会很容易将结果从一个系统转移到另一个,但是如果你失去了上下文信息和源代码,你也可能失去结果的意义和价值。所以,难于集成的数据可以破坏的研究计划,因为不能总体的结论。这就是为什么Genedata重点是帮助研究人员顺利集成数据语义。

RM:研究人员能做什么来规范他们的数据,使它更容易吗?

OL:标准化有助于使数据容易。标准化的数据格式和语义使科学家能够容易识别和提取相关信息。标准化的方法使科学家们更好地理解他人所产生的结果。因此,个别科学家应该确保他们一起发表他们的研究成果被用于生成的方法,完整的元数据和访问底层原始数据。这可以通过使用一个系统的所有数据分析,使标准化结果生成和共享。我们Genedata过滤网平台给科学家一个系统,提出标准化的数据语义跨组织一个研发和实践。简化所有检测数据分析,筛选器为每个类型的分析为研究人员提供了标准化的工作流程,使结果和下游企业数据仓库元数据访问。这种方式,结果是完全类似的和方便的研究人员和决策者的组织。

RM:过滤网15如何使异构,plate-based试验数据更容易集成?

OL:过滤网过程plate-data从任何乐器,包括底层原始数据(动态跟踪、细胞的人口数据,等等),并允许科学家从最终结果返回到原始数据,根据需要,例如检查它,如果需要,修改过程获得改善的结果。虽然过滤网15扩展仪器的数量随时可以运行,过滤网的api允许任何工具生成plate-based数据的集成。

RM:你最近发布了一些新的更新15过滤网,尤其是Mechanism-of-analysis(农业部)研究。你为什么关注恐鸟和过滤网15如何研究人员在这个领域中获益呢?

OL:我们认识到早期的机械是现代药物发现项目的关键信息。动态信息特别是增加高质量的领导候选人的产生更好的候选人选择和加速传播灌输更高的信心,他们的潜力。Genedata过滤网机械的分析提供了这个信息,因为它使可伸缩处理生物物理和机械的分析在高吞吐量。过滤网从仪器和分析进口原始运动数据绑定曲线在一个工作流。数据加载和过程在几秒钟内。很令人兴奋的,这个系统可以分析500种化合物在相同的时间之前需要5个化合物。我们有效地消除电子表格和手动分析,我们相信可以节省多达80%的科学家目前的这些实验数据处理和常规分析时间。这使得研究人员重点转向提高实验发现过程和决策。

RM:数据完整性和安全性将是至关重要的,特别是如果数据变得更加可共享和访问。研究人员如何轻松地驾驭自己的数据管理?

OL:防止数据损坏或破坏和禁止未经授权的人访问数据是确保数据完整性和安全的基本原则。Genedata筛选平台支持这些基本原则与严格的数据完整性和安全管理。Genedata筛选器将数据存储在一个高度结构化的数据库,研究数据存储和与他们的元数据,信息来源和方法,消除了破碎的关系问题。数据集是完全版本,这样一个完整的审计跟踪和恢复在用户错误。科学家可以掌握他们的研究的所有数据都存储在一个中央位置源数据和分析设置很容易查看。

Genedata过滤网有多层数据访问管理,提供授权的个人和团体项目中。根据授权和访问的角色,研究人员可以归档数据或报告结果对公司仓库。过滤网也给选择安全的数据交换与外部科学家、严格控制的访问权限,因此标准化程序和简化工作流可以扩展到外部协作。

奥利弗·利文湖Ruairi J Mackenzie说,科学技术网络作家188金宝搏备用