COVID-19大流行已经强调了重要的作用聚合酶链反应
(PCR)可以在分子诊断。pcr检测迅速成为主要的方法用于识别受感染的个人和阻止传播链。然而,传统的PCR技术依赖于RNA或DNA提取前PCR检测,这增加了工作流的时间和成本。
188金宝搏备用向乔治·黄博士,首席财务官Entopsis学习如何使用直接PCR技术这些步骤可以省略。在这次采访中,黄博士还讨论了这种方法的优点,为什么迄今为止没有更大的吸收及下一代直接PCR试剂之间的区别。
安娜·麦克唐纳(AM):什么是直接PCR,它如何与传统PCR有何不同?
乔治·黄(GH):直接PCR / extraction-free PCR /直接放大指PCR进行直接从样本,事先没有隔离或净化RNA或DNA。相比之下,RNA或DNA是孤立的一系列步骤和仅用于核酸纯化PCR在传统PCR。因此,直接PCR不需要列或珠子约束力的RNA或DNA,也不需要一系列的试剂溶解病毒和细胞,洗和淋洗核酸。这些额外的测试组件添加成本,浪费时间,需要专门的设备,自动化和开门的多个测试瓶颈,在大流行期间。
问:这种方法的优点是什么,应用程序是最适合对吗?
“大酒店”:直接PCR提供了许多优势PCR利用传统的RNA / DNA提取。下面是三大类别。
1。
成本和规则。一些实验室可以节省与直接PCR和> 50%可能会测试一个额外的一批样品在同一轮班,导致更高的利润和/或更快的周转时间。这些储蓄超出的成本直接PCR试剂盒,包括节省耗材,昂贵的设备和额外的人员来扩大测试。
2。
不需要专门的设备和耗材。直接PCR实验室不依赖于特定于供应商的平台和有义务购买昂贵的耗材。此外,实验室的影响最小,当这些厂商消费品短缺导致测试瓶颈,被认为在COVID-19大流行。
3所示。
没有偏见微概要文件。越来越多的文献表明,传统的RNA提取方法,使用“捕捉和释放”的技术(例如,硅列,磁珠等)偏见微概要文件。直接PCR,因为它保持样本的完整性,预计不会有这个问题。
问:鉴于好处为什么吸收不是更大吗?
“大酒店”:有很多理性的原因直接PCR已经采用了速度慢于预期,由于它提供了许多好处。几十年来,传统的RNA和DNA提取前PCR测试,这是作为一个必要的步骤,因为有很少或根本没有选择。因此,许多生命科学公司建立企业在传统的RNA和DNA提取。他们创造了核酸绑定列和磁珠,各种适配器,专用设备及相关耗材,让消费者依赖于他们的平台。
在某种程度上,晚期采用者阻碍了直接PCR技术的采用。我们遇到临床实验室不愿意更新他们的技术,尽管许多优势。这个问题的部分原因是缺乏熟悉新技术和有限的记录与新产品。
另一个关键的障碍直接PCR技术的广泛应用是表现不佳而RNA / DNA提取和PCR检测包的要求改变。坦率地说,传统的直接PCR技术常常导致高Ct值为各种应用程序或没有Ct值。此外,许多这些产品力实验室qPCR / RT-qPCR主添加额外的组件,可能影响历史的结果,迫使实验室广泛re-validate商业测试。理想的直接PCR产品是提供结果与RNA / DNA提取和允许您使用PCR检测试剂盒,在不改变测试套件。
尽管如此,直接PCR是越来越多地采用在美国,拉丁美洲和其他地区推出PCRopsis™下一代克服问题的直接PCR产品与传统(第一代)直接PCR技术。我们认为这与越来越多的商业PCR测试将直接PCR方法纳入他们的工具。我们正在采取时间和教育选择、尖端实验室如何最好地使用PCRopsis™技术比实验室使用传统的RNA / DNA提取和关注成本/时间储蓄和性能。我认为新技术的市场力量是最好的动力,将支持技术,节省时间,提高利润,同时提供竞争力的性能。
问:你最近发布了,Entopsis PCRopsis™试剂表现优于其他直接PCR试剂,这是如何做到的呢?
“大酒店”:在其核心,Entopsis是一个研究和发展公司,以独特而有效的方式解决行业无关的问题。Entopsis的内部开发平台是一个基于纳米技术、机器学习驱动的筛查方法,允许快速鉴定材料所需的属性。这个平台已经被用于癌症诊断的发展,在线去除有毒成分的胰岛素泵,之中选择血液细胞沉淀,之中临床样本的浓度,改善等温PCR测试等等。
我们的团队,包括一个多样化的投资者基础,感到惊讶和愤怒当COVID-19测试无法进行大规模测试供应瓶颈,即病毒RNA隔离板。这是当我们决定大力投资在解决这个危险的PCR检测行业的缺点。我们的特制内部技术和使用不同的技术来开发直接PCR试剂克服局限性发现在市场上直接PCR产品并提供结果与传统的RNA和DNA隔离。我们行PCRopsis™下一代直接PCR试剂同时执行五个任务,完成这个目标的一个试剂:1)溶解病毒或细胞2)干扰核酸结构3)分离核酸结合蛋白4)稳定5)隔离PCR抑制剂。
PCRopsis™下一代直接PCR试剂提供独特的优势相比传统直接PCR试剂盒:
1)在室温下稳定,提供储蓄在运输和处理成本和方便。
2)产品PCRopsis™RVD-E和PCRopsis™颊,允许您直接从棉签提取RNA和DNA,从而否定了对传输媒介的需要,这也提出了一个瓶颈在大流行期间。
3)强大的性能,结果与RNA和DNA提取。
4)简单的协议,它不需要改变你的聚合酶链反应混合物(只是孵化样本PCRopsis™试剂,直接使用生成的样本成你想要的PCR混合物)。
问:如何Entopsis”PCRopsis™试剂适用于COVID测试?
“大酒店”:Entopsis”PCRopsis™试剂作为替代RNA和DNA提取所需的基因PCR扩增的目标,特别是对于COVID-19测试。下面是一个列表的下一代面向直接PCR技术扩增SARS-CoV-2和其他病毒。
1。
试剂测量系统和测量系统增强剂:直接PCR介导不同传输媒介,唾液和尿液。也可以用来放大无数细菌物种。
2。
试剂SRVD:协调直接PCR唾液样本,甚至纯粹的唾液样本。
3所示。
试剂测量系统-E:从干棉签直接PCR介导,而不需要传输媒介
4所示。
试剂测量系统- - - - - -RT:在室温下直接PCR介导从样本在不同传输媒介,没有任何加热步骤。
黄乔治安娜·麦克唐纳说,科学技术网络作家。188金宝搏备用
