马克斯NRGene正在农业研究

NRGene最近宣布启动DeNovoMAX,一个增强版的旗舰产品DeNovoMAGIC,全基因组的组装。作为重新组装产品套件的一部分,DeNovoMAX旨在进一步推动农业研究通过赋予育种和农业产量最大化。与它的前身DeNovoMAGIC,DeNovoMAX最大化效率通过精简图书馆设置。设计它是为了满足专业育种者的需求,将提供最流行的纯合子物种如小麦、烟草、番茄、胡椒、棉花、玉米、大豆、向日葵和更多。

我们采访了加Ramot,营销总监NRGene有限公司了解DeNovoMAX的应用以及它如何建立裂纹最基因组的“复杂”。

莫莉·坎贝尔(MC):你能告诉我们关于这部小说DeNovoMAX技术以及它是如何发展的?

加Ramot (GR):NRGene长期以来一直因其能组装各种基因组在一个非常高的标准。DeNovoMAGIC,其旗舰产品是引用超过15次在过去的两年里在科学文献(即同行评议期刊如自然、科学)由于它生成高质量的结果。DeNovoMAX,精简版本的遗留DeNovoMAGIC出生的测序成本大幅降价(由于Illumina公司NovaSeq机)和NRGene成熟的算法和经验在流行的物种。

DeNovoMAGIC依赖高覆盖率提供全方位服务的所有生物体基因组组装在最高标准的结果(无论复杂性),而DeNovoMAX最大化效率通过精简图书馆设置以最小的质量妥协。DeNovoMax旨在满足应用基因组学专业育种者的需求,将提供最受欢迎的物种如小麦、烟草、番茄、胡椒、棉花、玉米、大豆、向日葵和更多。

NRGene使育种者提供了一个新的产品重新组合。DeNovoMAX是一个精简版的遗留DeNovoMAGIC平台,已多次引用科学文献由于它生成高质量的结果。两个装配产品互补。DeNovoMAGIC依赖高覆盖率提供全方位服务的所有生物体基因组组装在最高标准的结果(无论复杂性),而DeNovoMAX最大化效率通过精简图书馆设置以最小的质量妥协。视频由NRGene。


主持人:DeNovoMAX的潜在应用是什么?

格:基因组大会将一切到上下文中。它允许精度,迅速转化为效率,所以你可以做事情更快和更准确。在过去,你将需要一个大的财团序列新的基因组,与多个合作伙伴共享的高成本。然而,随着NRGene新DeNovoMAX等产品,可以在更低的价位,我们希望看到更多的研究设施组装它们的基因组。

例如,使用DenovoMAGIC, NRGene设法成功地组装,在参考质量水平,16 GB-sized共同小麦的基因组(也称为面包小麦)在不到一半的成本前小麦组装项目。另一个例子是最新组装的硬质小麦(用于面食)。硬质项目,通过基因组测序,其中一个发现是,有一个特征在某些硬质小麦品种,使高浓度的镉积累(有毒金属)。通过分析种质,人员能够发现功能等位基因消除了这一特点。这些知识将帮助我们带来更好的品种。

与新DeNovoMAX,科学家可以进行相同类型的研究。小麦具体地说,研究人员可以享受大幅降价,您可以使用DeNovoMAX组装三个基因组之前使用DeNovoMAGIC组装成本。这也允许更大的灵活性和更大的变化,最终导致更多的见解,转化为实际应用。

主持人:从DeNovoMAGIC DeNovoMAX如何不同?可以用于补充彼此吗?

格:如前所述,DeNovoMAGIC是完整的解决方案,能够破解最复杂的基因组。主要针对非常具有挑战性的基因组像草莓,大麻,甚至桉树——这些基因组杂合子。直到现在,NRGene DeNovoMAGIC组装所有的基因组,但由于新DenovoMAX,纯合子基因组有一个解决方案在一个更合理的价格现在,许多物种如小麦、番茄、胡椒、向日葵、大豆、玉米和许多更多。

主持人:技术的如何?

格:降价将超过50%,相比当前DeNovoMAGIC价格点。

主持人:当使用DeNovoMAX研究者面临什么挑战?