与BD AbSeq测定单个细胞分析

新工具让研究人员探索以前所未有的清晰,允许单个细胞RNA和蛋白质表达水平可以同时分析。在这个博客,Brian Lilhanand全球平台的领导者,单细胞Multiomics,在BD,讨论了双相障碍的新AbSeq试验如何提供有针对性的分析和免疫学研究中受益。

Ruairi Mackenzie (RM):分析工作流是比以往任何时候都更关注单细胞水平——进步让我们探索的细胞?

布莱恩Lilhanand(提单):成本更低的新一代测序技术的出现使得更多研究者加入单细胞基因组学工具如BD Rhapsody单细胞分析系统实验室。

这些工具使单细胞分析更容易;BD Rhapsody系统包括试剂、仪器、软件,和有针对性的基因面板和提供额外的单细胞与BD AbSeq化验分析能力。这可以帮助研究人员开发一个更完整的基因和蛋白质在生物系统中扮演的角色。

RM:蛋白质和RNA表达水平并不总是匹配。这是为什么,为什么它是研究人员面临的挑战?

提单:高通量测序技术允许研究人员检查到成千上万的RNA目标和大大促进我们理解复杂的生物系统。然而,了解基因调控和单细胞异质性往往需要RNA和蛋白表达的信息。很少有技术允许并发检查这两种类型的分子在一个实验用一个读出。

由于几个细胞调控通路,RNA和蛋白质水平的水平并不总是相关的。t细胞的一个典型的例子是,标记PD1,这已成为一个重要的免疫疗法的目标。PD1, t细胞的RNA表达几乎检测不到。然而,根据亚型的免疫细胞,蛋白表达差别很大。

使用Rhapsody基因表达与BD AbSeq板试验,研究人员可以识别高——和low-expressors蛋白质与RNA表达水平,即使基因表达较低。PD1等化验,细胞表面分子靶向药物输送、识别和研究细胞的能力基于蛋白表达理解药物反应至关重要。

RM: BD AbSeq分析汇集了RNA和蛋白质表达数据——为什么是特别重要的免疫学家?

提单:通过结合的特点,高质量的抗体与寡核苷酸BD Pharmingen组合条形码,AbSeq试验使研究人员能够同时分析RNA和蛋白质在成千上万的单个细胞免疫学。

先进的蛋白质分析方法,如BD AbSeq试验,开发了适应更多的参数,在规模与单细胞RNA-seq,代表免疫学和其他领域的重要一步。同时分析在单个细胞可以帮助研究人员更好地了解负责打开和关闭基因的调控机制,发现一个更完整的描述基因表达形状的细胞表型。

这对免疫学家很重要,因为试验使更深层次和更精确的理解,每一个细胞在免疫系统中的作用,并与超过100个人类antibody-oligonucleotides的不同组合,和更多的发展,研究人员能够促进他们对复杂疾病的理解,而不需要运行多个实验。

RM: BD AbSeq分析接下来的步骤;可以整合更多的组学吗?

提单:单细胞分析是一个明显的起点BD生物科学成就的企业目的——促进健康的世界。我们想继续开车单细胞分析到新的研究领域,如免疫学和扩大我们的产品在这些领域与其他人类和小鼠antibody-oligonucleotide组合在未来数月乃至数年。

与添加FlowJo SeqGeq信息学组合包,BD正在努力更好地整合组学从信息学的角度来看,当今研究的一个重大的挑战。的能力都收集、分析和解释单个细胞流,RNAseq和AbSeq数据在一起将是一个强大的功能,使新发现。

我们的目标是使单细胞基因组学可访问所有研究人员更好地理解细胞由于其巨大的潜力,推动疾病。

布莱恩Lilhanand Ruairi J Mackenzie说,科学技术网络作家。188金宝搏备用