扭曲了双链DNA探针在第一个外显子组测序
最近我们赶上了艾米丽Leproust博士,扭转生物科学的CEO,讨论公司的创新产品在基因组生物学的最新进展和技术会议(AGBT)在奥兰多。
捻近日发明了一套产品,旨在提高下一代测序。这些包括人类核心外显子组设备、图书馆准备和目标浓缩设备,和自定义面板,可以单个请求。
Ruairi Mackenzie (RM):外显子组和定位浓缩设备的探头使用双链DNA,这在业内是独一无二的。这种方法的优点是什么?
艾米丽Leproust博士(EL):传统上,在双链探针形式被认为相互结合,形成竞争target-probe混合动力车和事实上,所有其他的外显子组和自定义工具在市场今天使用单链DNA或RNA。我们已经开发了一个专有的方法,使双链探针在不影响目标捕获。这一创新显著区别我们提供通过使特定捕获目标的两条链,导致数量的增加独特的分子测序和允许脱氨基作用等strand-specific突变检测的样品或FFPE古代事件。能够梳理出真实和罕见突变核苷酸变化由于处理或退化尤其是癌症测序是至关重要的。
RM:外显子组的其他创新和目标在AGBT浓缩方案宣布吗?
埃尔:除了双链探针,我们增加了优化放大和门店QC的探针,导致极端丰富目标的一致性与无与伦比的特异性。重要的是,我们相信我们捕获的一致性意味着你不再在序列样本,提供未来节约成本的增加样品的数量你可以运行,增加了深度报道或减少总成本。
浓缩的平台,我们提供卓越的质量和性能通过最大化捕获效率能够定制的附加值浓缩溶液从面板设计到设备配置。这种灵活性允许最终用户真正裁缝浓缩的能力解决他们的应用程序没有妥协。此外,与我们的快速定制设计管道,可以优化目标板快,允许用户以最小的时间尺度。
RM:你能谈谈我们的一些应用程序定制DNA捕捉面板吗?
埃尔:几个我们的客户将会呈现在基因组生物学和技术的进步已经使用我们的自定义面板:基础医学,这是一个癌症研究公司;USAMRIID,使用我们的探针对病毒疫情研究和与我们工作与Illumina公司合作开发一个定制的panviral面板。
概括地说,我们卖给客户进行遗传和基因组研究感兴趣。尤其是自定义面板,我们预计它将在很大程度上被使用的癌症研究人员感兴趣的特定段(s)基因序列;然而,随着基因研究升级成倍增长,我们预计,它可用于更广泛的研究——从抗生素抗体病毒和细菌。
例如,制药公司做药物研发可能只是感兴趣的激酶,或医生看着突变驱动癌症患者可能只是感兴趣的100年或1000年基因与特定癌症相关联,或研究人员18号染色体可能只是感兴趣。因此,对于那些只对一小部分感兴趣的基因组,我们提供一个解决方案,满足他们的需求。
RM:你的最新公告表示转折的首次涉足挥动的解决方案?如果是这样,我想问是什么促使你进入这个领域,以及你认为上天是要下吗?
埃尔:这确实是我们的第一个进军挥动的解决方案。我们的研发团队发现了一个专有的方法浓缩外显子组和自定义目标市场杠杆的力量合成DNA的平台。我们相信这是一个非常好的方法进入相邻市场,建立在我们的核心竞争力在合成DNA。
是一个非常令人兴奋的市场——最初,外显子组测序很兴奋因为测序的成本显著降低。全基因组测序的成本已经大幅下降,更多的组织正在WGS模型。扭曲的引入解决方案,我们相信我们将能够带回外显子组测序和自定义的流行,鉴于我们的均匀性探针和未来测序的成本节约,因为一致性。我们对未来感到非常兴奋,相信通过门店,我们作为一个社会朝着个性化和精密的医学。我们期待着参加革命通过外显子组和定制的解决方案。
艾米丽博士Leproust Ruairi Mackenzie说,科学技术网络作家。188金宝搏备用