编目细胞以查明乳腺癌的起源
如果你能预测哪些细胞会癌变呢?在女性的一生中,乳房组织会发生巨大的变化,因此寻找可能导致癌症的突然变化的标记尤其困难。冷泉港实验室(CSHL)副教授Camila dos Santos和她的团队识别并编目了数千种正常的人类和小鼠乳腺细胞类型。新的目录重新定义了健康的乳房组织,这样当出现问题时,科学家就可以确定它的来源。
任何乳腺细胞都可能癌变。多斯桑托斯说:
“要了解乳腺癌的风险,你必须首先了解正常的乳腺细胞,所以当我们考虑预防甚至靶向治疗时,你会阻止正确的细胞类型发展成癌细胞。”
对细胞进行分类的传统方法是追踪与细胞功能相关的几个特征基因。为了更广泛地对细胞进行分类,多斯桑托斯的团队采用了单细胞RNA测序技术。他们追踪了小鼠和人类乳腺组织中超过15000个细胞中几种基因的活性。石溪大学(Stony Brook University)多斯桑托斯实验室的常驻研究生萨曼莎·亨利(Samantha Henry)说:
“我们确实为每个细胞群创建了许多基因的完整目录,以便更好地定义它们。当我说有很多基因时,确实有很多基因,花了很长时间才完成。”
一组细胞包括雌激素受体阳性细胞,通常易于治疗。但多斯桑托斯的团队发现,这个群体可以被分成几个亚群,每个亚群可能对治疗有不同的反应。
该团队与计算生物学家CSHL教授亚当·西佩尔及其团队合作,了解到小鼠和人类乳腺细胞具有相似的基因图谱,这证明了为什么小鼠研究可能与人类相关。dos Santos实验室的计算科学开发人员Marygrace Trousdell说:
“我们总是发现自己在努力对某些细胞类型进行明确的分类。有时我觉得我已经看到了所有的基因,然后又会有别的基因冒出来。”
目前,该实验室正试图将正常的基因转移与癌症相关的基因转移区分开来。多斯桑托斯希望她的乳腺细胞类型目录将指出需要监测的细胞类型,并为研究人员指明未来的治疗方案。
参考:Henry S, Trousdell MC, Cyrill SL,等。发育中的乳腺细胞异质性基因表达特征的鉴定。J乳腺生物瘤变.2021.doi:10.1007 / s10911 - 021 - 09486 - 3
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