从培养细胞qPCR分析一个完整的工作流程

Cells-to-CT产品,包括4瓶,2缓冲瓶,工具盒

在基因表达分析技术,主要表达载体Cells-to-CT包测量相对基因表达实时聚合酶链反应也被称为定量PCR或放大之前qPCR-without RNA净化。可用TaqMan和SYBR绿色检测化学反应,Cells-to-CT包提供一个完整的工作流qPCR分析直接从培养细胞,为您提供优秀的性能,可靠性和世界级的支持。

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Cells-to-C的好处T

  • 非凡的缓解和速度-96样品RT-qPCR在不到10分钟
  • 跳过RNA净化-不列,加热或离心
  • 特殊的性能联合一致的准确性、重现性、灵敏度1 - 100000细胞
  • 分析验证工作流推进套试剂预先优化工作效率的盒子

选择导游:Cells-to-CT工具是正确的吗?

检测化学可用 时间结果(从细胞裂解qPCR结果) 工作范围 基因表达的敏感性
Cells-to-CT两步包 SYBR绿色*和TaqMan* *格式 2小时 10 - 100000个细胞 中等到高水平的定量
Cells-to-CT互译工具 SYBR绿色*和TaqMan* *格式 35 - 85分钟 10 - 100000个细胞 中等水平的定量
快速先进Cells-to-CT两步包 SYBR绿色*和TaqMan* *格式 80 - 95分钟 10 - 100000个细胞 中等到高水平的定量
CellsDirect工具包 TaqMan* *格式只 奖金的最小值 1 - 10000细胞 高水平的定量
单一Cell-to-CT工具包 TaqMan* *格式只 3人力资源 1 - 10细胞 高水平的定量
* SYBR Green-based检测使用SYBR绿色染料(dsDNA-binding染料)积累在PCR检测PCR产物。SYBR Green-based化验需要和验证,以确保设计特异性引物。特异性和再现性依赖于模板和引物的设计和优化质量。
* * TaqMan-based检测使用fluorogenic调查特定目标基因在PCR检测目标的积累。TaqMan-based检测灵敏度通常比SYBR Green-based检测。


互译和两步Cells-to-CT

如果你选择互译:

  • 有很多样品与一个或几个目标吗
  • 不存储cDNA
  • 使用液体处理机器人

如果你选择一个两步工具包:

  • 有互补的多个目标量化
  • 需要更高的灵敏度为罕见的成绩单
  • 归档的互补
  • 使用液体处理机器人

TaqMan格式与SYBR绿色格式

选择TaqMan格式:

  • 时间效率
  • 更高的特异性和敏感性
  • 对多路复用

选择SYBR绿色格式:

  • 成本效率
  • 当使用自定义的引物

CellsDirect vs FastAdvanced Cells-to-CT工具与传统Cells-to-CT

CellsDirect:实时qPCR结果直接从细胞

  • 增加灵敏度,没有RNA隔离措施,避免样品损失和PCR抑制;使用SSIII广泛的敏感性下降到一个细胞/反应
  • 重要的储蓄,少的时间和更低的成本比RNA净化设备
  • 健壮的qPCR结果-实时检测的目标从一个细胞到10000个细胞
  • 多功能性-兼容多种细胞系和样本激光捕获显微解剖(LCM)

CellsDirect qPCR工具包提供高度敏感的和具体的,实时qPCR结果直接从细胞,而不需要一个RNA净化一步测试时每反应至不到10000个细胞一个细胞。CellsDirect技术是专为最大灵敏度小样本(图1)。

图1所示。CellsDirect qPCR工具包提供敏感检测单个细胞。海拉细胞细胞溶解和resuspended CellsDirect协议。十倍系列稀释的细胞溶解产物是由10000个细胞一个细胞。RRKCA,低丰度的目标是发现使用TaqMan探针与CellsDirect互译qPCR与火箭在7700年ABI棱镜仪器装备。效率来衡量的标准曲线(图中未显示)R²= 0.998 97%。

CellsDirect互译qPCR包结合灵敏度和最高水平的便利和吞吐量。与CellsDirect互译包,把你的细胞溶解产物直接qPCR反应混合物,把它放在你的实时仪器,走了。这些包是理想的基因表达分析的样本收集使用LCM (图2)。

图2。CellsDirect互译qPCR工具包提供敏感模块样品的结果。CellsDirect RNA LCM显示样品的净化互译工具足够敏感的捕捉数据不到100个细胞。

快速先进Cells-to-CT包:实时qPCR结果直接从细胞

跳过RNA净化完全与快速先进Cells-to-CTKits-going直接从培养细胞样本测量相对基因表达与实时rt - pcr (RT-qPCR)。以一种独特的方法溶解培养细胞,去除基因组DNA (gDNA)和保留RNA的完整性,套件包含逆转录(RT)互补脱氧核糖核酸合成试剂和TaqMan或SYBR绿色主混合实时PCR分析。

快速先进Cells-to-CT两步包是更快和更方便的使用比传统的RNA净化灵敏度的前提下(图3)。由于工作流lysate-based,没有失去与Cells-to-C RNAT板。在传统的RNA净化,少量的RNA总是输给了不完全洗脱的过滤器或磁珠。因此,能够在低输入细胞样品中检测出罕见的rna(10 - 1000)与Cells-to-C样品处理时高T包比较结果与样本使用RNA净化工作流(图4)。这一点,加上停止解决方案的好处,给Cells-to-CT工作流的敏感性比竞争对手包检测丰富和低成绩单副本。

图3。灵敏度的先进Cells-to-C TaqMan快T装备比其他包。104细胞细胞溶解后每个设备的协议。的最大溶解产物被添加到每个工具包的Cells-to-C RT (45%T和快速先进Cells-to-CT包;其他供应商)为10%。然后加入一定量25%的RT qPCR TaqMan数组的磷酸二酯酶的反应,使用每个工具的qPCR掌握混合。快速先进Cells-to-CT装备进行平均0.5摄氏度T比原Cells-to-CT装备和3.6摄氏度T比另一个供应商的工具包(11 x比其他供应商更敏感)。

酒吧图表HepG2细胞基因表达的使用快速先进Cells-to-CT工具包相比传统Cells-to-CT工具包和供应商竞争

图4。检测的比较。104HepG2细胞细胞溶解后每个设备的协议。的最大溶解产物被添加到每个工具包的Cells-to-C RT (45%T和快速先进Cells-to-CT包;其他供应商)为10%。25%加入一定量的RT qPCR反应为其他供应商的设备;30%是添加到先进Cells-to-C qPCR反应的快T装备,45%添加到权力SYBR工具包。化验10个不同的基因。大多数的基因没有发现在这个细胞系。的基因检测,快速先进Cells-to-CT装备有较低的CT值比其他工具对于大多数基因。

Cells-to-CT包:实时qPCR结果直接从细胞

Cells-to-CT包提供一个完整的工作流实时RT-qPCR分析直接从培养细胞RNA净化。以一种独特的方法溶解培养细胞,去除基因组DNA (gDNA)和保留RNA的完整性,套件包含逆转录(RT)互补脱氧核糖核酸合成试剂,要么probe-based (TaqMan探针)或dye-based (SYBR绿色染料)主混合实时PCR分析。

Cells-to-C的所有组件T已经优化了一致的和可靠的性能。这有助于减少猜测参与装配不同的样品制备和实时rt - pcr掌握混合。

为了增加质量保证,Cells-to-CT互译TaqMan装备与TaqMan基因表达分析,验证和Cells-to-CT互译电力SYBR绿色装备与一组验证引物常见基因的目标。显示性能相当于与纯化获得RNA (图5)。

图5。灵敏度和检测使用Cells-to-C有限的目标序列T。(A)的敏感性与溶菌产物与纯化RNA基因表达分析。海拉细胞(10 - 100000)加工使用Cells-to-C一式三份T互译TaqMan装备,或RNA是使用一个RNA旋转列方法纯化。每组样品分析了实时rt - PCR对7900年ht实时PCR体系,为韩国帝王和ACTB Cells-to-CT控制设备。(B)检测有限的目标序列。越来越多的NIH3T3细胞(鼠标)被添加到10000海拉细胞。这些细胞被加工使用TaqMan基因表达Cells-to-C一式三份T工具包(两步过程)或纯化试剂与RNA旋转列方法。所有样品都是反向转录mouse-specific (B2M)和人类基因(TKT)一式三份的反应在7900 ht快速实时PCR系统。

TaqMan基因表达Cells-to-C的性能T装备是比其他商用裂解工具包和纯化RNA。输入100 - 100000细胞/裂解反应进行。的敏感性TaqMan Cells-to-CT设备协议相当于得到纯化RNA,它超越了其他供应商(图6)。

图6。良好的灵敏度得到TaqMan基因表达分析与使用Cells-to-C溶解产物生成T工具包。海拉细胞(100 - 100000)是准备使用传统的RNA净化,Cells-to-C TaqMan基因表达T装备,或其他溶解产物的方法从供应商Q和美国反转录反应是由最大推荐示例输入对于每一个设备,和实时PCR进行了一式三份使用PPIA TaqMan基因表达分析。

CellsDirect:实时qPCR结果直接从细胞

  • 增加灵敏度,没有RNA隔离措施,避免样品损失和PCR抑制;使用SSIII广泛的敏感性下降到一个细胞/反应
  • 重要的储蓄,少的时间和更低的成本比RNA净化设备
  • 健壮的qPCR结果-实时检测的目标从一个细胞到10000个细胞
  • 多功能性-兼容多种细胞系和样本激光捕获显微解剖(LCM)

CellsDirect qPCR工具包提供高度敏感的和具体的,实时qPCR结果直接从细胞,而不需要一个RNA净化一步测试时每反应至不到10000个细胞一个细胞。CellsDirect技术是专为最大灵敏度小样本(图1)。

图1所示。CellsDirect qPCR工具包提供敏感检测单个细胞。海拉细胞细胞溶解和resuspended CellsDirect协议。十倍系列稀释的细胞溶解产物是由10000个细胞一个细胞。RRKCA,低丰度的目标是发现使用TaqMan探针与CellsDirect互译qPCR与火箭在7700年ABI棱镜仪器装备。效率来衡量的标准曲线(图中未显示)R²= 0.998 97%。

CellsDirect互译qPCR包结合灵敏度和最高水平的便利和吞吐量。与CellsDirect互译包,把你的细胞溶解产物直接qPCR反应混合物,把它放在你的实时仪器,走了。这些包是理想的基因表达分析的样本收集使用LCM (图2)。

图2。CellsDirect互译qPCR工具包提供敏感模块样品的结果。CellsDirect RNA LCM显示样品的净化互译工具足够敏感的捕捉数据不到100个细胞。

快速先进Cells-to-CT包:实时qPCR结果直接从细胞

跳过RNA净化完全与快速先进Cells-to-CTKits-going直接从培养细胞样本测量相对基因表达与实时rt - pcr (RT-qPCR)。以一种独特的方法溶解培养细胞,去除基因组DNA (gDNA)和保留RNA的完整性,套件包含逆转录(RT)互补脱氧核糖核酸合成试剂和TaqMan或SYBR绿色主混合实时PCR分析。

快速先进Cells-to-CT两步包是更快和更方便的使用比传统的RNA净化灵敏度的前提下(图3)。由于工作流lysate-based,没有失去与Cells-to-C RNAT板。在传统的RNA净化,少量的RNA总是输给了不完全洗脱的过滤器或磁珠。因此,能够在低输入细胞样品中检测出罕见的rna(10 - 1000)与Cells-to-C样品处理时高T包比较结果与样本使用RNA净化工作流(图4)。这一点,加上停止解决方案的好处,给Cells-to-CT工作流的敏感性比竞争对手包检测丰富和低成绩单副本。

图3。灵敏度的先进Cells-to-C TaqMan快T装备比其他包。104细胞细胞溶解后每个设备的协议。的最大溶解产物被添加到每个工具包的Cells-to-C RT (45%T和快速先进Cells-to-CT包;其他供应商)为10%。然后加入一定量25%的RT qPCR TaqMan数组的磷酸二酯酶的反应,使用每个工具的qPCR掌握混合。快速先进Cells-to-CT装备进行平均0.5摄氏度T比原Cells-to-CT装备和3.6摄氏度T比另一个供应商的工具包(11 x比其他供应商更敏感)。

酒吧图表HepG2细胞基因表达的使用快速先进Cells-to-CT工具包相比传统Cells-to-CT工具包和供应商竞争

图4。检测的比较。104HepG2细胞细胞溶解后每个设备的协议。的最大溶解产物被添加到每个工具包的Cells-to-C RT (45%T和快速先进Cells-to-CT包;其他供应商)为10%。25%加入一定量的RT qPCR反应为其他供应商的设备;30%是添加到先进Cells-to-C qPCR反应的快T装备,45%添加到权力SYBR工具包。化验10个不同的基因。大多数的基因没有发现在这个细胞系。的基因检测,快速先进Cells-to-CT装备有较低的CT值比其他工具对于大多数基因。

Cells-to-CT包:实时qPCR结果直接从细胞

Cells-to-CT包提供一个完整的工作流实时RT-qPCR分析直接从培养细胞RNA净化。以一种独特的方法溶解培养细胞,去除基因组DNA (gDNA)和保留RNA的完整性,套件包含逆转录(RT)互补脱氧核糖核酸合成试剂,要么probe-based (TaqMan探针)或dye-based (SYBR绿色染料)主混合实时PCR分析。

Cells-to-C的所有组件T已经优化了一致的和可靠的性能。这有助于减少猜测参与装配不同的样品制备和实时rt - pcr掌握混合。

为了增加质量保证,Cells-to-CT互译TaqMan装备与TaqMan基因表达分析,验证和Cells-to-CT互译电力SYBR绿色装备与一组验证引物常见基因的目标。显示性能相当于与纯化获得RNA (图5)。

图5。灵敏度和检测使用Cells-to-C有限的目标序列T。(A)的敏感性与溶菌产物与纯化RNA基因表达分析。海拉细胞(10 - 100000)加工使用Cells-to-C一式三份T互译TaqMan装备,或RNA是使用一个RNA旋转列方法纯化。每组样品分析了实时rt - PCR对7900年ht实时PCR体系,为韩国帝王和ACTB Cells-to-CT控制设备。(B)检测有限的目标序列。越来越多的NIH3T3细胞(鼠标)被添加到10000海拉细胞。这些细胞被加工使用TaqMan基因表达Cells-to-C一式三份T工具包(两步过程)或纯化试剂与RNA旋转列方法。所有样品都是反向转录mouse-specific (B2M)和人类基因(TKT)一式三份的反应在7900 ht快速实时PCR系统。

TaqMan基因表达Cells-to-C的性能T装备是比其他商用裂解工具包和纯化RNA。输入100 - 100000细胞/裂解反应进行。的敏感性TaqMan Cells-to-CT设备协议相当于得到纯化RNA,它超越了其他供应商(图6)。

图6。良好的灵敏度得到TaqMan基因表达分析与使用Cells-to-C溶解产物生成T工具包。海拉细胞(100 - 100000)是准备使用传统的RNA净化,Cells-to-C TaqMan基因表达T装备,或其他溶解产物的方法从供应商Q和美国反转录反应是由最大推荐示例输入对于每一个设备,和实时PCR进行了一式三份使用PPIA TaqMan基因表达分析。

单一Cell-to-CT

单细胞分析的关键应用,如候选药物筛选、细胞分化和干细胞研究,测量单个细胞对特定刺激的反应。因为组织组成的异构混合物的细胞,基因表达测量基于均质人口不占小但重要的改变发生在单个细胞。

这个工具提供了一个验证工作流用于基因表达分析和提供了一个标准化的单个细胞的研究平台。

单细胞基因表达应用程序

罕见的细胞或事件

  • 循环转移性细胞
  • 胎儿母体血液中的细胞
  • 事件在一个图书馆

稀缺的、珍贵的样本

  • 档案组织
  • 临床样本(新鲜肿瘤)
  • 生物标志物的发现

人群中单细胞精度

  • 的候选药物研究
  • 细胞分化(如干细胞)
  • 随机对刺激的反应

实时PCR应用完整的实验工作流程解决方案

我们已经开发出强大的试验设计算法,优化大师混合,直观的数据分析软件,和灵活的工具来帮助利用qPCR在丰富和多样化的应用程序。

Cells-to-C视频和网络研讨会T

Cells-to-CT:完整的视频

学习如何准备从培养细胞RNA基因表达分析,而不需要RNA净化。快速通道RT-qPCR只有7分钟。

Cells-to-CT:PBS解决方案

洗细胞与PBS和吸入Cells-to-C PBST协议。

Cells-to-CT溶解的解决方案

添加溶菌作用与细胞,解决井上下移液混合,静置5分钟在Cells-to-C室温T协议。

Cells-to-CT停止解决方案

停止解决方案添加到细胞裂解的解决方案,并等待两分钟在Cells-to-C室温T协议。

Cells-to-CTRT大师混合

看准备的RT大师在Cells-to-C混合T协议。

Cells-to-CT包:快速杀死你的细胞进行基因表达分析

这个演示展示了如何Cells-to-C ASCBT由qPCR工具包允许您测量相对基因表达而无需放大之前去除RNA。

如何分析从培养细胞基因表达吗

学习如何准备从培养细胞RNA基因表达分析在七分钟。

更少的时间与Cells-to-C实时PCRT

你得到实时PCR结果与Cells-to-C用更少的时间T板。他们是快速,简单,健壮。更少的处理步骤确保协议时间短,提高一致性,最小的样品损失,降低污染风险。

常见问题(faq) Cells-to-CT

Cells-to-CT设备常见问题

Cells-to-CT包提供一个完整的工作流实时存在分析直接从培养细胞RNA净化。逆转录和qPCR是表现在一个好。包使用逆转录(RT)试剂与dye-based互补脱氧核糖核酸合成和可用(SYBR绿色染料)或probe-based (TaqMan探针)主混合实时PCR分析。

互译的互译和两步包不同包逆转录和实时PCR结合成一个单一的步骤,降低总体协议的时间。

基于下面的十个实验样本,Cells-to-CT装备生产6.6 g的塑料垃圾和0毫升:危险废物在七分钟相比,140克塑料垃圾和18毫升危险废物与标准RNA与RNeasy净化。

RNeasy
35分钟
140克塑料垃圾
18毫升危险废物
RNeasy减少废物和有害物质 Cells-to-CT
7分钟
6.6 g塑料垃圾
0毫升危险废物
  1. 确保所有媒体从井中删除
  2. 用同等体积的室温1 x PBS媒体后删除
  3. 确保反应发生在室温下(裂解反应可能不会达到室温如果板是在冰上,很快搬到板凳上,或冷裂解解决方案添加)
  4. 热裂解解决室温之前增加细胞
  5. 允许裂解反应进行8分钟
  6. 在25°C执行裂解反应8分钟

是的。C细胞T包是兼容多路qPCR化验。如果许多目标正在测试,我们建议使用TaqMan格式。

Cells-to-CT技术功能独特的溶解方法培养细胞,去除基因组DNA (gDNA)和保留RNA的完整性。因此,按照协议中的溶解/ DNase治疗步骤,gDNA污染将为qPCR不是一个问题。

单一Cell-to-CT包常见问题

是的,这将是足够的材料进行微阵列分析。前置放大器步骤后的样品的体积是26.5µL稀释530µL 1:20的总量,这比足够大量的TaqMan qPCR化验,TLDA卡片或使用QuantStudio开放数组。

虽然我们没有尝试这个内部,有理由相信这应该工作。然而,在RT协议的优化步骤可能需要,作为FFPE样品有很多RNA交联从而影响RT酶的效率。加热10分钟的样品在80°C添加RT为了得到好的互补转换应该提高逆转录。

细胞系与Cells-to-C兼容T

细胞系 经济增长类型 源物种 组织来源
A549 附着 智人 肺癌
BJ 附着 智人 包皮
CHO-K1 附着 c将(仓鼠) 卵巢
COS-7 附着 c . aethiops(猴子) 肾脏
du - 145 附着 智人 前列腺癌
hek - 293 附着 智人 肾脏
海拉 附着 智人 宫颈腺癌
HepG2 附着 智人 肝细胞癌
Huh-7 附着 智人
Jurkat 悬架 智人 急性淋巴细胞白血病
K562 悬架 智人 骨髓
我- 180 附着 智人 宫颈表皮样癌
NCI-H460 附着 智人
2神经 附着 m .骶 大脑
NIH / 3 t3 附着 m .骶(老鼠) 胚胎成纤维细胞
PC-12 附着 r形(老鼠) 肾上腺嗜铬细胞瘤
PT-K75 附着 美国scrofa(猪) 鼻鼻甲粘膜
Raji 悬架 智人 B淋巴细胞
SK-N-AS 附着 智人 大脑成神经细胞
SK-N-SH 附着 智人 大脑纤维母细胞
u - 2操作系统 附着 智人
u - 87毫克 附着 智人 脑胶质母细胞瘤

请注意:由于不同细胞的大小和构成,细胞每裂解反应的最大数量为不同的细胞系可能略有不同。抑制试验和最小样本输入使用TaqMan Cells-to-CT控制设备。

Cells-to-CT设备订购信息
资源

仅供研究使用。不用于诊断程序。