力量ProteoScape™
直接结果!
实时搜索结果=效率
突出了
实时搜索结果通知您当前的仪器和样品状态
特性
4 d-proteomics™和智能采集的实时搜索结果
打破瓶颈分析的数据集成提供的实时数据库搜索和智能采集力量ProteoScape™。
普遍可用的
4 d-proteomics™
- CCS-enabled数据丰富,即便如此实时数据库搜索功能是一个现实的力量ProteoScape™包括多功能天车磷酸化
大规模并行处理与GPU的力量
- 力量ProteoScape™是显卡驱动,在成千上万的CUDA核心提供了巨大的计算能力
力量ProteoScape™数据审查
- 视图的错综复杂的细节你的高水平实验的数据信息到一个特定的碎片离子谱上集成的观众的兴趣与信心的力量ProteoScape™盒子
智慧
- 力量ProteoScape™是聪明的,一个用户定义的资格蛋白质或多肽的样本采集决定样本队列的进程,检查适用性,保存珍贵的样本,昂贵的耗材和仪器
好处
受益于时间和节约成本
- 不再担心注入那些珍贵的样本
- 没有仪器浪费时间的更令人担忧
- 不再担心那些昂贵的试剂和样品准备样品,只有注入一个贫穷的执行系统
- 不再等待质检运行来确定系统适用性
- 在方法开发不再等待搜索结果
“创新的软件工具是一个需要与质谱分析解决悬而未决的生物学问题。困离子迁移功能和鲁棒性的timsTOF Pro提供了独特的自底向上的蛋白质组学功能,可以有效地用于研究许多疾病。”
应用程序
TIMScore™——机器学习和CCS开发更好的罗斯福
TIMScore™提供了最大数量的PSM,肽和蛋白质识别通过允许真正的CCS维度4 d-proteomics。
正常的力量ProteoScape™运行搜索算法,结合CCS预测和测量值的比较和计算TIMScore™的前五肽为每个光谱候选人。
的TIMScore™好处是意识到在peptide-validation和错误发现率(罗斯福)估计的步骤。在非CCS-enabled算法,只能利用二维估计罗斯福速率,因此区分线适合1%的误差(面板)区分正向和反向肽的候选人。与TIMScore™,和额外的CCS维度,peptide-candidates可以在三维矢量化(面板B)允许歧视波状外形的飞机用于实现相同的1%的误差。
应用歧视飞机提供更高的准确度和精密度,帮助验证标准两个维度得分psm以前不佳。
个基点Novor——从头测序PASEF的速度
进一步发现在immunopeptidomics宏蛋白质组学和其他应用程序需要从头测序,我们开发了BPS Novor一起快速Novor Inc . .我们的解决方案提供的最快,最准确的从头测序结果timsTOF数据与所有运行的优点和完成。
BPS Novor训练和优化上大于> 1780000光谱timsTOF平台包括各种non-tryptic酶,构建一个通用的评分模型。它能够处理平均> 1000光谱/第二,贷款本身的实时从头测序timsTOF平台。BPS Novor始终优于标准Novor和软件在不同的数据集。
BPS Novor不会显示明显偏见消化特异性或物种和比竞争产品快20倍。
timsTOF平台,结合PASEF技术力量ProteoScape™和BPS Novor提供增强的敏感性实时从头测序包括immunopeptidomics为各种不同的应用程序。
“新创搜索已经在我实验室的一个关键方面的研究多年,能够有一个算法,提供结果准确度和精密度的速度收购意味着我们可以评估immunopeptidomics样本规模和实时。这主要影响我的团队如何快速将研究结果转化为可操作的信息,并将此工作流接近这些分析提供临床的影响前所未有的时间表。”
dia-PASEF®工作流流线型在力量ProteoScape与蒂姆斯DIA-NN™
力量ProteoScape dia-PASEF™能够处理®工作流使用一个定制版本的受欢迎的DIA-NN由神经网络(DIA)软件从Lilley Rasler和Demichev实验室。蒂姆斯DIA-NN使可靠的、健壮的、定量准确的大规模的实验。力量ProteoScape™dia-PASEF利用相同的流机制®工作流,流媒体实时女士和DIA框架从收购电脑力量ProteoScape™盒子。这些dia-PASEF®数据处理和存储在力量ProteoScape™盒子。结束的时候触发采集光谱库搜索,结果记录下来。TIMScore™的DDA搜索结果可以很容易地利用建立光谱库或光谱库可以从其他受欢迎的进口工具。在项目结束的用户可以触发match-between-runs分析查看项目之间的定量资料。这对于PASEF提供用户一个集成的环境®和dia-PASEF®数据分析。
“我们正在进行的合作与力量裁缝DIA-NN流线型dia-PASEF数据处理工具CCS重点都是非常有益的。它可以简化和加速识别和量化甚至成千上万的蛋白质很短的梯度。我们很高兴在我们的密切合作与力量,vendor-integrated版DIA-NN叫做蒂姆DIA-NN现在成为力量的一部分ProteoScape生物信息学平台。”
成熟的数据库搜索不到5 ms
燃烧的搜索速度和搜索结果毋庸置疑。
)蛋白质ID复制银两运行使用力量的人类细胞溶解产物ProteoScape™实时结果和以MaxQuant为基准
B)肽ID复制DDA运行的人类细胞溶解产物使用力量ProteoScape™实时结果和以MaxQuant为基准
C)力量ProteoScape™和MaxQuant识别97%的相同的蛋白质和近90%的相同的多肽。
力量ProteoScape™提供实时搜索的结果一致,与离线搜索相同的数据。从数据库搜索算法在GPU上运行,搜索时间基于CPU的搜索相比可以忽略不计。
除了实时搜索的机会更大空间搜索特定的应用程序,包括peptidome研究,成为现实。力量ProteoScape™以金本位为基准您搜索执行一样好或更好。
可以节省大量的时间与实时辅助LFQ工作流ID
利用实时识别大大减少所需的时间dda-PASEFlabel-free定量(LFQ) match-between-runs (MBR)。
- CCS增强IDs使用TIMScore™
- 通常,把收购时间进行量化
- 节省大量的时间使用力量ProteoScape™
容易识别不良样品,重新获得他们力量上运行&做ProteoScape™开始前定量工作流程的一部分。基于我们的IM过滤XIC定量工作流是由人口普查算法(https://doi.org/10.1002/0471250953.bi1312s29)。
在线研讨会
相关的网络研讨会
视频
奖状
“实时结果交付的力量ProteoScape盒在我们timsTOF Pro已经节约了大量时间。这让我们开发方法在实时通知信用证和仪器性能和整体效率的主要获得。”
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仅供研究使用。不用于临床诊断程序。