概述
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描述
描述
红杉RiboDepletion工具包是一个独立的、post-library损耗工具包,消除碎片来源于细胞质核糖体RNA (rRNA)和线粒体核糖体RNA(太rRNA)序列从RNA-Seq图书馆。丰富的核糖体RNA,构成80 - 90%的总RNA。有效的去除rRNA使成本效益的测序的RNA样品是至关重要的。
损耗的核糖体RNA总RNA在图书馆建设可以导致罕见的损失或low-abundance记录。红杉RiboDepletion工具包图书馆耗尽cDNA片段来自rRNA post-library准备,表现出优越的性能在整个转录组分析,保留和捕获小RNA同时最小化罕见的成绩单和RNA的损失有限或退化的样本。这个独立ribodepletion装备优化与宽输入范围(0.1 -20 ng RNA-Seq库)和兼容大多数图书馆准备包可用。随着技术创新post-library损耗,可以合并多个预先索引库和枯竭的一个反应,消耗最大化效率,节省大量的时间和成本。
简化工作流程可以在2小时内完成。
Post-Library损耗中的一门新技术策略
特性和好处
- 有效地消除核糖体、线粒体RNA片段从一个RNA-Seq图书馆
- 保留罕见的成绩单通常失去了从pre-library RNA消耗策略
- 池编码库成一个消耗反应,节省时间和金钱
包括组件
每个设备都有两个试剂框。盒子包括互补脱氧核糖核酸杂交的试剂,损耗和放大;商店
-20ºC。箱B包括净化珠子;存储在4ºC。
红杉RiboDepletion设备常见问题
红杉RiboDepletion装备技术
什么是图书馆建设后消耗rRNA-derived碎片的好处吗?
为什么图书馆小插入大小有更高比例的读取映射到rRNA吗?
红杉RiboDepletion工具包耗尽细胞质和线粒体核糖体RNA吗?
SEQuia RiboDepletion设备兼容性
兼容红杉RiboDepletion工具包是什么种类的?
我可以用红杉RiboDepletion工具包和其他图书馆准备包?
这是产品兼容退化或分散的RNA吗?
红杉RiboDepletion工具使用
我是总RNA输入应该使用什么呢?
的百分比是什么rRNA耗尽后仍使用红杉RiboDepletion工具包?
使用不同的库库构建准备包可以汇集成一个单一的反应?
多少库可以汇集成一个消耗反应在使用红杉RiboDepletion工具包?
数据分析
剩余rRNA的比例如何计算使用SeqSense挥动数据分析软件?
我怎么计算的比例使用不同的管道处理残余rRNA FASTQ文件?
规范
规范
技术
杂交和捕捉
输入范围
-20年0.1 ng cDNA (RNA-Seq库)
兼容的物种
人类/鼠/鼠标
耗尽rRNA亚型
核糖体rna (5 s、5、8、18、28 s),太rRNA(12和16个年代)
工作流时间
2小时
记录保留
长非编码RNA,信使RNA, microrna的tRNA,核内小RNA等。
保质期
保证12个月从装运正确存储
订购
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项目
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图像
17006487
包裹1,装备24反应,包括880µl红杉Ribodepletion放大结构,110年µl红杉Ribodepletion探针组合,65µl红杉Ribodepletion底漆和2500µl红杉Ribodepletion珠子
配件
配件
图像
TBC0802
包裹20袋12 x 8薄壁聚丙烯管条和12 8-cap条PCR,自然(1920管和1920上限)
文档
文档
需要登录
数量
描述
选项
7460年
红杉RiboDepletion装备产品信息表
3220年
探索了RNA序列的红杉工作流产品信息表
10000132295
红杉RiboDepletion设备协议