纳米孔测序是如何工作的
牛津纳米孔已经开发了新一代的DNA / RNA测序技术。它是唯一的测序技术,提供了实时分析(快速的见解),完全可伸缩的格式从口袋里人口规模,可以分析天然DNA或RNA序列片段的长度来实现超短读的长度。
实时
唯一的测序技术,提供实时分析
完全可伸缩
从口袋里,人口规模的设备
直接DNA / RNA序列
调用基础与核苷酸序列同时修改
超长阅读
提高装配和描述重复和困难地区超长阅读
序列在任何地方
奴才外使用传统的实验室环境,采取分析样本。
纳米孔
所有牛津纳米孔测序设备使用流动细胞包含一个数组的小孔-纳米孔嵌在一个electro-resistant膜。每个纳米孔对应自己的电极连接到一个频道和传感器芯片,衡量电流流经纳米孔。当分子通过纳米孔时,电流中断产生“蠕动”特征。乱涂乱画是然后使用basecalling解码算法实时确定DNA或RNA序列。
你可以把当前的水通过管道流动。当一个对象进入管道,水流中断,就像DNA破坏当前穿过纳米孔。
DNA / RNA序列
一串DNA或RNA是由一系列不同组合的四种核苷酸碱基:A、T RNA(或U), G和c .每个基地穿过纳米孔可以通过特征识别中断它会导致当前实时。这使得纳米孔测序独特,因为它是唯一的测序技术,使直接、实时分析超短片段的DNA / RNA,在完全可伸缩的格式。实时测序的优势包括快速访问时间关键信息(如病原体识别),初代的洞察力和更多的控制测序实验样本。
为什么DNA / RNA ?
DNA和RNA分子存在于所有生物。DNA是生命的遗传密码,建造和运营一个有机体的指令。RNA主要是信使分子,DNA上的指令代码来控制蛋白质的合成,生物的构建块。测序可以回答一系列生物问题,提供病原体的身份信息、遗传疾病风险或有机体是如何进化而来的。
你能想到的测序DNA / RNA喜欢阅读音乐——基地被指出,在正确的顺序时,产生一个公认的这首歌。纳米孔测序用于确定DNA / RNA序列的基地。
你可以把它像试图完成两个锯曲线机相同的照片——一个明显比另一个更大的块。一副拼图,只有9件与900年比1更容易组装。
长阅读的力量
传统方法只能短长度的DNA序列,然后必须重组。因此很难对准确基因组装配序列重复区域没有差距,解决大型结构变化,或亚型区分开来。纳米孔测序是有限的,只有DNA / RNA片段的长度提出了孔隙,因此可以跨整个重复区域,解决结构性变异,区分不同的亚型。天然DNA和RNA序列的能力没有要求放大,消除了PCR的偏见和允许识别的基础上修改,如甲基化,与核苷酸序列。
纳米孔测序是完全可伸缩
纳米孔测序是唯一的测序技术,使实时分析在完全可伸缩的格式。高通量的袖珍奴才,人口规模的PromethION——纳米孔测序规模以适应任何实验的需要。
