位置
国家表型筛查中心(NPSC)
NPSC是一个世界级的表型筛选设备由一个跨学科团队的科学家和工程师协作推进的使用复杂的生物学和驱动创新。
关于
NPSC提供表型筛选服务为生命科学学院和外部的学术和商业伙伴。高吞吐量表型筛选(通常被称为“高内容筛选”或高碳钢)使用定量细胞和组织模型的基于图像的读数测量分子扰动的影响细胞和/或组织模型的生物系统和功能。化验在NPSC运行的例子包括:
- 核易位化验:测量转录监管机构成核
- 活细胞化验:定量分析细胞动力学对药物治疗的反应
- 绘画细胞:细胞细胞器标记揭示的作用机制
- 通路记者:抗体和荧光蛋白质的记者表达目标降解效果的评估方法
细胞和组织模型运行在NPSC的例子:
- 和patient-derived癌症细胞系中被永久地传颂
- 来自人体的角化细胞和生殖细胞
- 人类诱导多能干细胞
NPSC设施包括所有必要的细胞和组织文化、自动化液体和复合处理、板处理和数据采集运行大规模筛选化验。先进的计算资源(计算集群,完全备份数据存储、OMERO +数据管理、CellProfiler和R工作流,Jupyter中心服务器)可用于数据简化和分析。
我们有一个学者的记录证明在邓迪大学的其他大学在英国和欧盟和世界各地的生物技术和制药公司。
设备
显微镜
- 日本横河CV7000
- 通用电气InCell2200
- 分子设备IXM XLS
功能
- 1双旋转盘共焦,液体处理和综合环境控制
- 2荧光宽视野与温度控制系统——5通道并行
- DIC,相差和brightfield成像
- 2 d / 3 d / 4 d成像,延长注意力和反褶积
- 延时成像
- 快速采集(> 100 fps)
- 幻灯片和6 - 1536孔板兼容
- 4 x-60x放大客观的镜头
- 为宏观集成软件编程和在线细胞计数
- 整个好记录
- Transwell成像
- 硬件和软件自动对焦
- 板映射,ID在图像元数据
流式细胞术
- NovoCyte Advanteon
- 缝匠肌神游
功能
- 流式细胞仪管、24、48、96和384孔板兼容
- 3激发激光、14荧光检测通道
- 高动态范围(> 107年的强度水平)
- 检出率100000个事件/秒
板的读者
- Tecan M1000职业
- PerkinElmer EnSpire
功能
- 多模快速收购——发光、荧光和吸收
- 灵活的波长和带宽的选择
- 时间分辨荧光(扶轮基金会,TR-FRET)
- 荧光偏振
- 温度控制42°C
- 轨道振动与注入模块
- 6 - 1536孔板
- 液体喷射器
液体处理程序
- 安捷伦布拉沃
- Labcyte Echo550/555
- Formulatrix风暴
- Formulatrix螳螂
- 多分结合
- Biotek 405 ls
功能
- 机器人液体处理平台基于探针传输(96 -和384 -吸管头)
- 高精度、低体积声(tip-free)液体转移与无与伦比的准确性和重现性
- 试剂分配器12个试剂,高度精确到1μL(风暴)或0.1μL(螳螂)
- 细胞或试剂分发器
- 档板快速,整个盘子洗(分配和吸入,≥50μL /)
自动化
- 6-star(日本电装)
- 9-star(史陶比尔)
功能
- 可互换的模块
- 生物安全二级兼容(9-star)
资助机构
- 比尔和梅林达•盖茨基金会
- 欧盟-创新药物计划2合营企业根据授权协议没有806948
人
出版物
格鲁伯FS,约翰斯顿佐诺NR,乔治奥我,威尔逊C,读KD,吉尔伯特IH, Swedlow JR,马丁斯da Silva年代,Barratt CLR。化合物增强人类精子运动性使用高通量鉴定表型筛选平台。哼天线转换开关。2022年3月1;37 (3):466 - 475。doi: 10.1093 / humrep / deac007。PMID: 35048946;PMCID: PMC8888995。
约翰斯顿佐格鲁伯FS,布朗SG Norcross NR, Swedlow J,吉尔伯特IH Barratt CLR。高通量表型筛选人类精子。繁殖。2021年12月27日,163 (1):R1-R9。doi: 10.1530 /代表- 21 - 0372。PMID: 34882578。
约翰斯顿佐格鲁伯FS, Barratt CL,安德鲁斯PD。表型筛选平台利用人类精子识别化合物与避孕活动。Elife。2020年1月28日,9:e51739。doi: 10.7554 / eLife.51739。PMID: 31987071;PMCID: PMC7046468。
