研究人员计算发现海里捞针治疗罕见疾病



03/13/2018
化疗vandetanib

化疗vandetanib绑定到它的主要目标,蛋白质酪氨酸激酶6日或PTK6,紫色,参与许多癌症包括胃肠道肿瘤和卵巢癌。通过建模vandetanib和PTK6复杂,路易斯安那州立大学的研究人员发现喀斯特蛋白质还含有类似drug-binding网站,因此是一个很好的匹配相同的药物。喀斯特的电脑模型在黄金vandetanib描绘了预测的相互作用。图片来源:Misagh Naderi,路易斯安那州立大学。

巴吞鲁日——一个在10人在美国是一种罕见的疾病,或者一个障碍影响不到200000人。虽然有超过7000个罕见疾病共同影响全世界超过3.5亿人,是不盈利的制药行业开发新疗法治疗少数人患有罕见的疾病。研究人员路易斯安那州立大学计算系统生物学已经开发出一种复杂和系统的方式来识别现有药物可以治疗一种罕见的疾病或状况重新定位。他们调整计算机辅助药物重新定位的过程,可以节省时间和金钱在帮助这些患者得到有效的治疗。

“罕见疾病有时影响这么小的人口,发现治疗不会在经济上是可行的,除非通过人道主义和政府激励。这些条件有时不及时治疗标上“孤儿疾病。我们开发了一种方法来计算发现罕见的疾病蛋白质结构和功能之间匹配和现有药物的相互作用,可以帮助治疗一些孤儿疾病,”说Misagh Naderi论文的主要作者之一,和一个在路易斯安那州立大学生物科学系的博士生。

这项研究将发表在本周npj系统生物学和应用杂志,自然出版集团出版的系统生物学研究所合作。

“在过去,大多数使用药物是偶然发现的。例如,药物金刚烷胺是治疗呼吸道感染。然而,几年后,帕金森氏症患者经历了戏剧性的改善在服用这种药物时,她的疾病症状治疗流感。这个观察引发了进一步的研究。金刚烷胺是食品药品监督管理局批准的抗病毒和抗帕金森病的药物。但是,我们不仅可以依靠机会找到治疗一个孤儿疾病,”米甲Brylinski博士说,计算系统生物学的头组和生物科学系的副教授和计算中心&技术在路易斯安那州立大学。

合著者系统化药物再利用,Naderi拉吉夫·甘地Govindaraj和同事eMatchSite相结合,软件与虚拟筛选由同一组匹配FDA批准的药物和蛋白质参与罕见疾病。路易斯安那州立大学超级计算机允许他们测试数以百万计的可能性将花费数十亿美元在实验室里测试。这项工作得到了医学科学研究所的美国国立卫生研究院(R35GM119524)。

额外的链接:

大规模计算药物重新定位找到治疗罕见疾病,npj系统生物学和应用程序:https://www.nature.com/articles/s41540 - 018 - 0050 - 7

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