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一个新的计算模型使研究人员能够识别新的治疗靶点,可以攻击癌细胞通过降低细胞内的pH值。
这项研究是合作的结果IRB巴塞罗那,莫菲特癌症中心和马里兰大学,已经发表在自然通讯。
众所周知,癌症细胞酸化环境,因此,细胞自身的内部是碱金属。原则上,这种放松管制应该阻碍这些细胞的发展和扩散。然而,恰恰相反在癌症发生。计算研究由计算化学家Miquel Duran-Frigola,生物医学研究所的巴塞罗那(IRB),证明癌细胞增殖少和健壮的方式当他们内部pH值降低,也就是说它变得酸性更强。这一发现从而揭示新的治疗方法来解决疾病的机会。
从以前的生化检测,使用成千上万的数据和数据库对癌细胞的基因表达,研究人员开发出了一种计算模型,分析了pH值的变化如何影响近2000代谢酶的活性。“我们是一个计算实验室,我们致力于系统生物学。我们想解决大规模问题,”Miquel Duran-Frigola说,副研究员结构生物信息学和生物实验室网络,由Patrick Aloy ICREA研究员。“理解代谢途径之间的联系,更好地工作在不同的小灵通可以给我们一个想法关于癌症生存所使用的机制基本的pH值,“Duran-Frigola解释道。
酸化作为目标
研究人员已经证实他们最初制定的假设。根据这一假说,如果癌细胞增殖容易在碱性环境中,那么他们将在酸性条件下更加脆弱。这个铺平了道路,考虑肿瘤细胞本身的酸化,再加上更传统的疗法,作为一名优秀的治疗策略。
新的治疗靶点
此外,研究人员确定了代谢酶,与细胞内的酸性癌症发展的协同工作,从而揭示这些分子治疗靶点。事实上,五个潜在目标已经在实验室测试使用乳腺癌细胞系,并取得了不错的效果。
“这项工作仍然很学术,但我们相信,一些目标确定准备在动物身上进行测试,从而允许我们进入更高级的临床前试验阶段,“Miquel Duran-Frigola说。这项研究已经完成与莫菲特癌症中心和马里兰大学,都在美国,已经发表在自然通讯。
这项研究已经完成马里兰大学的合作和MOFFIT所。
参考文章:
Erez Persi, Miquel Duran-Frigola Mehdi Damaghi威廉·r·Roush Patrick Aloy约翰·l·克利夫兰(Robert j . Gillies & Eytan Ruppin
系统分析癌症治疗的细胞内的pH值的漏洞
自然通讯(2018):DOI 10.1038 / s41467 - 018 - 05261 - x
关于IRB巴塞罗那
巴塞罗那生物医学研究所(IRB)追求自由的社会疾病。为此,它进行了卓越的多学科研究提供开创性的解决未解决的医疗需求在癌症和其他疾病与衰老有关。它建立了技术转让协议与制药业和主要医院使研究结果更接近社会和组织一系列的科学推广活动与公众在一个开放的对话。IRB巴塞罗那是一个国际中心,拥有400员工和30多个民族。认为是维罗奥乔亚卓越中心自2011年以来,IRB巴塞罗那是一个CERCA中心和巴塞罗那科技研究所的成员(阿拉伯学者)。