4,云正在改变研究方法

基于云计算的信息解决方案已经成为研究的一个组成部分。云无处不在的这些天,每一个新的信息工具似乎有一些云特性或功能。但实际上这对研究者来说意味着什么?用这个方便的列表,你会发现答案是“很多”,当我们探索四个关键云已经改变了研究的方法。

云的定义

在我们开始之前,重要的是要制定云计算究竟是什么意思。云计算使各种IT服务和可用资源点播用户无需这些资源被用户直接管理或托管。云计算资源通常定义为他们提供的资源的巨大规模,利用规模经济,这个平台的弹性(可以根据用户的需要增长或减少),和资源的共享和灵活性。

云计算通常分为三种类型的服务。软件即服务(SaaS)模型在现收现付制的基础上提供应用程序和软件。平台即服务(PaaS)提供了必要的开发工具来设计定制应用程序在云基础设施,同时“基础架构即服务”(IaaS)允许用户利用高性能计算通过云的力量。发现更多的信息关于如何设计基于云计算的信息,下载我们的信息,可用在这里。现在,让我们深入研究四种云变化的研究方法。

增加访问应用程序

云技术开始SaaS,过去五年间,这些软件模型变得司空见惯,就像预测的云专家组在欧洲委员会2012年。SaaS为实验室消除了经济负担昂贵的许可并取代它与现收现付模式是便宜得多,并允许研究人员使用他们需要的工具——这任务的任务,他们需要它。PaaS模型提供了研究人员必要的工具来设计他们自己的应用程序使用的基础设施云提供商(我们将涉及的好处,下面的基础设施)。通过云应用程序提供在现收现付模式现在远远超出了基本的文字处理和电子邮件客户端。研究人员现在可以使用基于云的实验室信息管理系统、电子实验室笔记本和色谱数据系统由供应商提供,PaaS解决方案的灵活性,可以利用专业的云应用程序。因此云可以提供应用程序有益的生物医学科学的全部。你的名字,都有一个基于云的工具:医学成像来电生理学来质谱分析。

超级计算机为每个人

IaaS的云应用程序可能是最广泛的吸引力,而不是提供专门的应用程序,IaaS使高性能计算资源可用于任何可能需要它们的科学家。这有两个主要的影响研究。首先,打开门大数据项目,这是越来越重要的科学。组学爆炸了巨大的数据集变得更为常见;一个全基因组序列填满100字节的数据,和时间分析文件的大小会对即使是最令人心烦意乱的病人使用经典的计算方法的研究。相反,像CloudAligner和云端的工具CloudBurst让研究团队从自己的基础设施和分裂的负载努力跨后端服务器。这使得研究人员可以利用数据集原本过于笨拙。组学革命只有并发繁荣成为可能的云技术。

第二个主要的影响IaaS平台是一个巨大的科学民主化。这些大数据项目不再仅仅是储备的主要研究机构,尽管他们仍然能够获得很强大的内部技术;“蓝脑计划”的,一个神经模拟倡议的瑞士洛桑联邦理工最近近1800万美元新的超级计算机,蓝脑5。与云计算,如果你的预算并不完全覆盖打几次,你不需要限制进行实验。云平台的一个很好的例子,使Broad研究所FireCloud一个可扩展的开放平台数据分析,任何人员都可以访问谷歌账户。Firecloud的弹性性质意味着研究人员可以使用尽可能多或尽可能少的权力。Broad研究所也使他们的最佳实践工作流提供给用户。

数据库对所有您的需求

一开始玩之前云分析应用程序和利用基于云的超级计算机,研究人员需要访问数据,云是在提供访问发挥着越来越重要的作用。数据从大规模基因组学等项目1000人基因组可通过云提供商亚马逊网络服务(AWS)。你会发现即使云计算开放科学,提供云服务仍然是一个寡头垄断的行业,与亚马逊、谷歌和微软拥有一半的市场他们之间的云基础设施。美国国立卫生研究院决定开放基因数据库云存储2015年只有帮助加速云数据库的增长。当研究人员参与了锅癌症全基因组分析详细的在最近的一次自然评论一块,如果研究人员想下载国际癌症基因组协会的数据集,在两个pb -相当于重将近七年的全高清视频录制,然后一个典型的大学网络连接会让他们等待超过15个月。云技术是最好的方法来存储和下载文件的大数据的新时代。

分享可以成为现实

建立大量的结果,坐在他们像龙的数据不做任何多好。有效地共享数据和有效是至关重要的在现代研究中,和云使这一过程变得容易多了。云创新是美国国立卫生研究院的一个关键部分BD2K倡议,旨在使生物医学科学的数字的潜力,同时最大化欧洲科学开放的云(EOSC)是一个欧洲范围内的项目创建一个数据共享的科学家。同时EOSC,开放数据项云是一个隐喻,云技术至关重要的项目的目标数据,数据和所需的资源分析,整个非洲大陆访问。