454生命科学和马克斯·普朗克尼安德特人基因组序列

454生命科学公司,公司持有多数股权的一家子公司CuraGen公司与科学家的合作马克斯普朗克进化人类学研究所德国莱比锡,宣布启动一个项目,完整的尼安德特人基因组序列。

项目预计需要两年,由454测序成为可能™技术和马普协会的资助。

“马克斯普朗克研究所和454生命科学正在共同努力,尼安德特人的基因组序列,“Svante Paabo解释说,博士,主任在马克斯·普朗克进化人类学研究所。

“我们的专长与古代DNA和穴居人,加上454测序,下一代测序技术与无与伦比的吞吐量,使这个理想的合作。”

“454测序的出现使我们推进项目,以前被认为是不可能的。”

穴居人居住的欧洲和近东直到大约在30000年前消失后,他的继任者,智人,迁移到欧洲。

今年是150周年的发现第一个穴居人化石在德国杜塞尔多夫附近的尼安德特山谷。

Paabo博士从穴居人DNA测序化石在1997年慕尼黑大学。

“我们是兴奋与尼安德特人基因组序列的马克斯普朗克研究所,因为它将产生更多的洞察人类生物学比任何个人的测序人类,”克里斯托弗·麦克劳德说,总裁兼首席执行官454生命科学。

“这雄心勃勃的项目进一步验证454测序技术,表明我们可以任何基因组序列,甚至一个高度退化的样本。”

从化石中提取、识别和古DNA测序技术上是一个具有挑战性的任务。

生物体死后,其组织被细菌和真菌。DNA是摧毁,剩下的少量是分解成短篇和它的化学修饰在长时期的化石的形成。

这意味着当科学家我微小的古老的骨骼进行DNA样本,获得的DNA实际上是来自细菌等污染物,真菌,甚至科学家们以前处理的骨头。

在过去的二十年,Paabo博士的研究小组已经开发了方法展示古代DNA结果的真实性,以及技术解决方案使用短的问题,化学修饰DNA片段。

一起454生命科学,他们将把这些方法与高通量DNA测序。

“与人类基因组计划,穴居人的样本非常稀缺和被污染的微生物DNA成千上万年。因此,这个项目才可能有454测序技术,”埃霍尔姆迈克尔说,博士,副总裁,分子生物学,454生命科学。

由于这样的样本污染,对尼安德特人基因组测序的任务是更广泛的比人类基因组的测序的任务。

454生命科学的基因组定序器系统的目的是使这一努力可行的通过允许大约四分之一的一百万个DNA链从少量的骨测序在一台机器上只有大约五个小时。

DNA序列由基因组定序器系统100——200个碱基对长度,整齐一致的古代DNA片段的长度。

在未来两年内,穴居人的测序团队将重建的草案30亿基地,尼安德特人的基因组。

为他们的工作,他们将使用几个穴居人的个体样本,包括尼安德特山谷发现1856年的样本,从克罗地亚一个特别保存完好的穴居人。

马克斯·普朗克协会基金项目的决定是基于一个大约一百万个碱基对的核穴居人DNA的分析从45000岁的克罗地亚化石,测序454生命科学。

的尼安德特人被认为是相当复杂的,形成人员和埋葬死;然而,尼安德特人被认为是缺乏现代人类的更高的推理功能。

大约99%的人类基因组与黑猩猩的基因组,我们最亲近的亲属。

据估计,尼安德特人与智人共享96%的1%的差异。剩余4%的穴居人的股票与黑猩猩的区别。

“的分析估计有4%的基因组变异,尼安德特人与黑猩猩分享将帮助我们理解特点具体到智人的进化,甚至方面的认知功能,“Paabo博士补充说。

“下一个飞跃在穴居人的研究也将识别这些基因变化使现代人离开非洲,并迅速传播到世界各地。”

“当我构思454测序技术,我想象的个人基因组测序与个人医疗帮助,”Jonathan Rothberg说,454生命科学的创始人兼董事长。

“这是美妙的朝着这个目标前进的道路上,测序的尼安德特人肯定会是一个伟大的里程碑,对洞察它给我们人类作为一个物种的起源,以及是什么让人类特殊的。”