454生命科学为基因组测序仪FLX推出新产品和软件系统

454生命科学宣布推出新产品和软件的超高吞吐量基因组定序器FLX系统(GS FLX)。新增加扩大人员定制他们的能力测序项目实现科学有意义的结果在竞争非常激烈的价格点,该公司表示。

新3 k -长标签(3 k-lt)配对结束协议使研究人员能够从每个3000年底的100个碱基序列基础跨在一个顺序阅读。双端数据长标签可以提高复杂基因组的新创组件和可用于确定结构在高分辨率的变化,包括插入,删除,倒置,拷贝数变化。

添加3 k-lt配对结束读以前可用的猎枪读允许研究人员选择的阅读类型提供最适当的数据的应用程序。准确的结果实现第一次,减少误解和昂贵的跟踪实验。

“454测序技术使我们能够有效地识别超过1000 (sv)在两个个体结构变化。我们的研究表明,大量的SV存在于人类人口和SV扮演着更重要的角色比snp遗传多样性。这将是至关重要的人类基因组测序将SV检测项目。“Michael Snyder说,博士学位。刘易斯·b·卡尔教授的分子、细胞和发育生物学在耶鲁大学。

斯奈德,早期合作者的访问,使用Long-Tag配对结束阅读一篇论文名为“Paired-End映射显示广泛的人类基因组结构变异,”出现在10月19日,2007年版的科学。

新连接多路复用标识符(中期)设备减少了每个样本的成本,增加多路复用,简化了处理多个样本。使用结扎MIDs在454年提供的工具包,多达12个标记样品可以一起通过放大和测序。样品标记有一个独特的中期使用标准钝端结扎协议。

每个12结扎中期适配器包含一个独特的10个基本序列所公认的测序分析软件,允许MID-containing读取的自动排序。与以前使用时可用垫圈(身体测序运行划分为单独的区域),每运行192样本可以测序。

增强提供的软件包括:自动检测的样本与MIDs标记;提高新创基因组组装使用3 k-lt配对读取;对突变检测改进算法,尤其是大型50碱基插入或删除;和一个新的Phred-like质量评分系统,结合Broad研究所开发的。