454测序甜瓜研究在西班牙

一项新的研究计划在峭壁,农业基因组学研究中心在巴塞罗那,西班牙,是专注于麝香瓜的从头测序(Cucumis melo)。

峭壁最近买了一个基因组定序器FLX从454年生命科学,罗氏应用科学的卓越中心,用于这个项目和支持其他正在进行的研究项目。

研究所之间的一个财团CSIC(西班牙国家研究委员会),IRTA(食品与农业研究和技术研究所)和阿拉巴马大学(巴塞罗那自治大学的);几个主要的农业种子公司作为赞助商。

研究所将与50名科学家开始工作,总共有200人工作在工厂和农场动物基因组学及其在育种应用程序。岩将由2009年中期准备全面运作的新建筑在建Bellaterra阿拉巴马大学的校园,在巴塞罗那附近。

基因组测序仪在峭壁FLX系统将用于甜瓜测序项目和其他正在进行的研究项目的支持。主要的应用程序将使用全基因组BAC测序,小RNA分析和转录组测序。

一个重要的应用领域是真核植物基因组的从头测序。研究所计划开始的甜瓜基因组测序是相似的在水稻基因组大小450 Mb到2008年底。

试点阶段已经开始,项目的目标是理解发展的基本过程和甜瓜和病原体耐药性为育种家提供工具来增强抗病原体的繁殖栽培品种,促进水果字符如香味,形状和成熟。

“瓜测序项目是西班牙的战略重要性,因为西瓜是第二大生产蔬菜作物,番茄后,“乔迪Garcia-Mas说的标记辅助育种农业研究所的研究和技术。

“我们选择基因组定序器FLX系统的解释力有限的解决方案,因为它长读长,吞吐量,和应用程序的灵活性。大量的高价值的出版物使用454年的测序技术是决定的主要原因。”

“其他项目的仪器也将是重要的在我们的中心如基因调控模型和作物在转录水平和小分子rna或SNP在农作物和家畜”发现Pere Puigdomenech说,主任峭壁。