454测序研究否定了基因组的复杂性隐藏巨大的撼动

一项研究发表在《基因组研究》杂志提供了令人惊讶的新线索到巨大的mimi病毒基因组的复杂性,世界上已知最大的病毒。之前的研究表明,与大多数病毒,米米病毒基因比许多细菌和执行功能,通常只出现在细胞生物。

最近的研究结果,由一个团队的结构和地中海基因信息实验室微生物学研究所的马赛,法国,表明米米病毒甚至比此前认为的更加复杂。

使用基因组测序仪FLX系统从454年生命科学,罗氏公司,研究人员首次执行病毒转录组的分析深度测序rna表达的阿米巴原虫感染整个米米病毒复制周期(1)。

出人意料地,75年分析发现新基因,包括26生产非编码rna。的存在,和迄今为止未知函数,这些额外的已经过多的mimi病毒基因组的基因可能从根本上改变当前对大型病毒的运作方式的理解。

自2004年的发现和破译基因组,巨人米米病毒已经模糊病毒和细胞有机体之间的传统界限,刺激和病毒学家之间进化生物学家的争论。为了充分描述米米病毒转录组和获得新的见解的基因和蛋白质功能,研究人员转向基因组定序器FLX系统。

“不仅我们能够证实先前预测的910个蛋白编码基因,但我们也发现75年的小说《mimi病毒基因,”解释Jean-Michele Claverie尚塔尔做烤鸡,这项研究的资深作者。“长读GS FLX系统生成的关键装配完整的成绩单,多顺反子mRNA的识别和发现的短的成绩单,自从5’和3’标记被包含在一个单一的阅读。”

序列映射还允许大多数的精确划定启动子区域和序列的识别主题管理mimi病毒的早期和晚期表现。激动人心的是,这项研究揭示了一个新的子元素关联与晚期基因表达,也是著名的人造卫星,最近描述米米病毒“virophage。”

前进,研究者计划执行类似的病毒转录组分析的存在和缺乏各种抑制剂,与其他变形虫mimi病毒株有不同的敏感性。自最近的宏基因组研究表明,米米病毒可能是原型的众多海洋浮游微生物感染各种病毒,一个特定的程序是专门寻找“海洋亲戚正在进行的国际TARA-Oceans探险。

“我们很高兴看到继续广泛采用454测序系统在病毒学的研究中,“乌尔里希Schwoerer说,全球营销主管454生命科学。“这个特殊的研究表明,第一次技术的独特功能全面的病毒基因组的转录组分析。我们兴奋地跟着团队继续从事这个领域的工作。”