准确地检测单核苷酸的单个细胞的变化

SingulOmics宣布出版的数据验证公司的核心使命产生一个新的、高质量的放大方法和计算管道单细胞测序。数据证明公司的新系统——AccuSomatic放大单细胞测序,使体细胞的准确检测单核苷酸变异(SNVs)在单个细胞不可能与任何先前的方法。论文中给出的数据,”准确的识别在全基因组单核苷酸变异放大单个细胞,”在线发表在3月20日,2017年的自然方法(doi: 10.1038 / nmeth.4227)。

AccuSomatic放大为单细胞测序,结果年的爱因斯坦医学院的研究,纽约,使真正的体细胞SNVs单个细胞的发现之前,不能准确地探测到任何方法。单细胞测序时拥有更大的潜力为研究癌症的遗传异质性和正常组织,现有方法受到来自多个源的工件,可以导致20000多假体SNV调用每个细胞和> 90%的假阳性结果。根据研究数据,AccuSomatic放大消除> 99%的体细胞SNV调用错误,同时保持相同的检测灵敏度。

“这真是一个改变游戏规则的研究。我们感兴趣研究低,生理水平的体细胞SNVs和其他单个细胞的突变,但这些只是淹没在高背景我们经验丰富的出版协议或商用系统,”Jan Vijg,博士,椅子,遗传学,爱因斯坦医学院的投资者和SingulOmics创始人之一。“我们正在进入一个单细胞基因组学时代随着人类基因组测序成本的下降。这种新方法可以让研究者去解锁全部潜能的单细胞测序在癌症、药物开发、老化研究,极大地扩展了功能的研究探索体细胞突变的景观在人类和其他生物的放大技术。”

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参考

咚,X。张,L。,Milholland B。李,M。,马斯洛夫,a . Y。王,T。& Vijg j . (2017)。单核苷酸变异在whole-genome-amplified单一细胞的准确识别。自然的方法。doi: 10.1038 / nmeth.4227