进步在废水检测病毒

研究人员抗菌素耐药性(AMR)跨学科研究组织(IRG)会研究和技术联盟(智能),麻省理工学院的研究企业在新加坡,与南洋理工大学的研究人员合作(南大),新加坡国立大学(NUS),麻省理工学院(MIT),新加坡环境生命科学工程中心(SCELSE)和史Zooprofilattico Sperimentale德拉伦巴蒂大区e戴尔'Emilia大区(IZSLER)在意大利,在病毒检测取得了进步在废水的发展一个新的定量RT-qPCR试验能检测οSARS-CoV-2的变体。这样的测试使废水监测准确跟踪动态变体在任何给定的社区或人群,和支持并告知适当的公共卫生措施的实施定制的根据一个特定的病毒病原体的具体特征。在另一篇论文中,聪明的人员和合作者也综述了废水监测的未来,概述了挑战和机遇和映射其潜在社会未来的病毒爆发做准备。

废水监测中出现COVID-19流行作为一个有效的和非侵入性的方法来追踪病毒爆发,和技术的进步使得研究人员不仅识别,而且量化存在的特殊变体的担忧(挥发性有机化合物的仪器)废水样品。这种能力计算和评估特定的挥发性有机化合物的仪器是独一无二的智能的开源化验,并允许研究人员精确地确定位移趋势在一个社区。因此,这种分析可以揭示了比例SARS-CoV-2病毒在社区传播属于一个特定的变体。这是特别重要的,因为不同的SARS-CoV-2挥发性有机化合物的仪器——α,三角洲,ο及其分支——出现在大流行的不同地方,每个引起新一波的人口更容易感染。

智能研究了新闻去年7月的第一个突破,拥有发达的定量测定αSARS-CoV-2变体的废水,同时也致力于类似三角洲变异分析。以前,传统废水检测方法只能检测SARS-CoV-2病毒材料样本的存在,没有识别病毒的变体。

δ3周内接管ο在意大利学习

聪明的科学家开发出了一种类似定量测定ο变体,一个allele-specific RT-qPCR试验同时目标突变的拉伸Q493R Q498R,使定量检测废水的买卖。这是在他们的论文中所描述的,”快速位移οδSARS-CoV-2变体的揭示了allele-specific PCR在废水研究”,发表于水。

在他们的研究中,智能发现助推器疫苗人口覆盖率的增加在意大利同意完成位移οδ变体的变体的废水样品从Torbole获得Casaglia污水处理厂,排水规模为62722人。不到3周,快速的位移可以归因于ο感染优势以前占主导地位的δ接种疫苗的个体,这可能源于οvaccination-induced免疫力的更有效的逃避。

“COVID-19流行的世界中,有机废水通过监控监测是一种有效的工具来跟踪在社区传播的变异,并将扮演越来越重要的角色在指导公共卫生的回应,”资深博士后论文的合著者智能AMR Federica阿马斯。“这项工作表明,废水监测可用于快速、定量微量挥发性有机化合物的仪器在一个社区。”

废水监测未来疫情反应至关重要

随着全球人口变得越来越接种疫苗和暴露于感染之前,国家已经开始转变对SARS-CoV-2的分类作为一个地方病,回滚向分散的抗原快速积极的临床监测测试,从而减少患者样本的测序。然而,SARS-CoV-2小说已被证明产生挥发性有机化合物的仪器,可以迅速出现并在人群中迅速传播,取代以前占主导地位的病毒的变异。这是观察到当δ取代α全球前2020年12月在印度的崛起之后,又一次当流离失所οδ在以更快的速度被发现后的2021年11月在南非。小说的持续出现挥发因此需要继续保持警惕的监测循环SARS-CoV-2变体在社区。bet188真人

在一个单独的审查纸废水监测题为“SARS-CoV-2波澜:废水监测的一个流行的未来”发表在《水资源研究、智能人员和合作者发现污水监测的实用程序在不久的将来可能包括1)监测病毒载量的趋势在废水量化估计病毒在社区传播;2)取样废水的来源——例如把样品从特定地区或建筑——确定感染在社区和建筑水平;3)整合废水和临床监测的人口监测;和4)基因组测序废水样品跟踪和新兴变体在人群中传播。

SARS-CoV-2“我们的经验显示,临床试验往往只能描述一个有限的或大流行爆发的真实程度。COVID-19成为普遍的和预期的出现进一步变异问题,定性和定量数据从废水监测将不可分割的一部分——成本和资源节约型公共卫生监测项目,授权当局做出更明智的决策,”加通讯作者詹妮尔汤普森SCELSE副教授和南大。“我们的审查提供了一个路线图的广泛部署废水监测、机遇和挑战,如果解决,不仅将使我们能够更好地管理COVID-19,但也不会过时的社会其它病毒性病原体和未来的大流行。”

此外,研究建议未来的废水应该遵守一套标准化的废水处理方法来减少废水中不一致数据对改进流行病学推理。方法的环境中开发SARS-CoV-2及其分析可能是无价的对未来的废水监测工作发现新兴人畜共患病原菌——可以从动物传播到人类的病原体,为早期发现未来的大流行。

此外,远非限于SARS-CoV-2废水监测已经适应用于打击其它病毒性病原体。另一篇论文从2021年9月一个描述推进发展的有效的登革热、废水监测Zika病毒,黄热病病毒,与智能研究人员成功地测量这些医学上重要的虫媒病毒污水的衰减率。其次是另一个评论纸通过智能发表在2022年7月,探索当前进展和未来的挑战和机遇在废水监测虫媒病毒。这些发展是一个重要的第一步建立虫媒病毒污水监测,从而帮助决策者在新加坡和更好地了解和更有针对性的公共卫生措施在控制虫媒病毒暴发登革热等,这是一个重大公共卫生问题在新加坡。

“我们学习使用废水监测作为一个关键的工具COVID-19将是至关重要的在帮助研究者开发类似的方法来监控和解决其它病毒性病原体和未来的大流行,”李魏林说,聪明的论文的第一作者引用在本新闻稿,在智能AMR研究科学家。“废水监测已经显示有前途的工具在帮助对抗其它病毒性病原体,包括一些世界上最普遍的蚊子传播的疾病,还有巨大的潜力的技术用于对其他传染性病毒性疾病。”

参考:把李王,阿马斯F,出的F, et al .快速位移οδSARS-CoV-2变体的揭示了allele-specific PCR在废水。水物。2022;221:118809。doi:10.1016 / j.watres.2022.118809

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