推进技术有助于了解胃旁路手术效果

一组研究人员的一项研究在马萨诸塞州综合医院医学工程中心(MGH-CEM)和后来儿童医院做出了技术进步对加速药物靶点的发现肥胖、二型糖尿病和其他代谢疾病。小说实验和计算工作流包括第一次使用啮齿动物胃分流模型,先进的质谱和生物信息学工具数组开始解开如何胃旁路手术导致减肥和2型糖尿病的一项决议。他们的报告对手术的影响肝脏代谢出现上个月在《技术。

“胃旁路手术的治疗效果给我们希望我们可以发现小说肥胖和糖尿病药物“尼玛Saeidi说博士MGH-CEM,对项目首席研究员。“我们的目标是逆向工程的减肥和分辨率血糖控制无需执行这样一个侵入性程序。为了达到这个目标,我们必须首先能够捕获代谢器官,如肝脏、肌肉、脂肪组织甚至小肠重组自己重新引发的减肥和逆转胰岛素抵抗”。

应对这一挑战,团队已经利用质谱快速进步有效量化成千上万的生物分子,即代谢物和蛋白质,为了获得线索特定组织或整个器官如何应对胃旁路手术。在目前的研究中,他们使用先进的蛋白质组学狭长工作流发现大约100个蛋白在大鼠肝脏、水平是影响roux - en - y胃分流手术(RYGB)。这些包括蛋白质参与铁运输、脂质代谢和胆汁酸结合,其中一些可能drugable代谢性疾病的目标使用RNAi肝脏特异性的基因沉默技术。证明了这个平台的实用程序,该小组计划RYGB的影响展开分析,研究多器官相声通过蛋白质分泌到血液中。

在Vivek曾经博士论文的第一作者说:“我们终于到达了一个阶段的生物医学研究,我们可以询问体内复杂的系统的成本有效地获得大规模的信使rna,蛋白质和代谢物的数据。的挑战仍在这些高维数据的解释提供生物有关组织代谢和信号通路是如何引发的手术。”

在这项研究中,曾经追求的一个基于网络的方法将蛋白质和代谢物数据发现子网或模块的影响手术可能没有直观的基于传统教科书通路。他补充说,“展望未来,开发基于网络的算法处理时间序列数据“组学”将成为解开复杂的因果关系,必须重新血浆激素水平的影响等组织转录重新编程”。

马丁Yarmush,医学博士,主任MGH-CEM和共同通讯作者论文的,强调了多学科性质的工作。“在野外调查人员一直在寻找这种类型的multi-omic啮齿动物胃分流模型分析研究代谢性疾病,但在啮齿动物手术所需的工作技能,multi-omic分析和计算生物学。杰姆,我们使工程科学家来解决复杂的问题在一个世界级的生物医学研究医院与医生合作。这项工作可能会感兴趣的生物技术公司希望建立他们的药物代谢病地区管道。”

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参考
在Vivek曾经马修·达利山德罗Shyam Sundhar贝尔,Vicky巴雨果Gagnon,约翰·m·Asara Korkut Uygun,马丁·l·Yarmush尼玛Saeidi。Multi-omic鼠肝脏代谢的基于网络的审讯后胃分流术片蛋白质组学。技术,2017;05 (03):139 DOI: 10.1142 / S233954781750008X