安捷伦将RNA目标浓缩,精简转录组分析研究,以促进癌症和干细胞研究

安捷伦科技公司,介绍了SureSelect RNA捕获包,第一个商业RNA目标浓缩系统使遗传学家专注于特定基因位点或记录的研究兴趣。RNA捕获工具可以精确测量感兴趣的基因的表达水平和检测allelic-specific表达式,剪接事件和基因融合。

这个开创性的产品是基于所做的功约书亚莱文Broad研究所等人,标志着最新发展摆脱安捷伦正在进行的与研究人员广泛合作。

“安捷伦SureSelect RNA捕捉RNA-seq效率提高了癌症研究和是一个重要的工具寻找小说融合基因从肿瘤cDNA库,“Hiroyuki马诺说,医学博士博士,教授有望医科大学和东京大学。“发现肺癌的针对有eml4 - ALK基因突变导致的发展前景筛选抑制剂。我们相信研究新药如致癌融合有助于促进发展个性化医疗的其他癌症。”

Multi-omics能力
研究人员可以使用新的RNA捕获包结合有针对性的基因组和转录组的数据在一个实验中“综合生物学”洞察的示例。这是通过创建自定义SureSelect设计可以丰富6.8 Mb的DNA和RNA的同一组基因。安捷伦的eArray设计工具允许用户定制工具,其确切的实验需求。

“核糖核酸测序转录组分析正迅速成为一个强大的工具,”弗雷德说p . Ernani博士,安捷伦科技公司营销总监,SureSelect平台。“我们的RNA捕获工具使稀有事件的检测和将提供健壮的和具有成本效益的手段为研究人员有针对性的RNA序列。我们的基因组DNA目标浓缩系统已经非常成功的和有效的基因发现就是明证30多个出版物在高影响力杂志上。我们预计我们的RNA设备产生类似的影响基因的发现。”

激酶组RNA包
除了自定义SureSelect RNA捕捉工具,安捷伦引入了SureSelect RNA目标浓缩人类激酶组包。这些工具促进最全面的分析设置可用激酶和kinase-regulated基因。研究人员可以使用激酶组包的DNA和RNA富集分析基因组转录监管变化的影响。

领先的新一代测序平台的工具进行了优化,包括Illumina公司基因组分析仪和HiSeq以及生命技术的固体。工作流可以很容易地扩大由于多路复用测序样品可以被索引,和所有的试剂都是automation-compatible。交钥匙自动化协议RNA捕获很快就会添加到列表中可用的自动化协议安捷伦的布拉沃自动合成系统。

SureSelect RNA的定制和目录包捕获可以丰富地区从小于200 Kb到6.8 Mb,每个设备和从5到10000年反应。