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人工智能识别关键基因帮助个性化癌症治疗

首字母缩写“人工智能”一个紫色的广场,环绕一个电路板。
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苏塞克斯大学的研究人员正在使用人工智能(AI)技术分析不同类型的癌细胞来理解不同的基因缺陷,以及识别基因对细胞的生存至关重要。苏塞克斯研究人员做过通过开发一个预测算法,是哪些基因在细胞中至关重要,通过分析肿瘤的基因变化。这可以用来确定可行的目标,及时指导肿瘤学家个性化癌症病人治疗


弗朗西斯博士珠儿,生物信息学在生命科学学院的高级讲师苏塞克斯大学的说:“我们的愿景是利用DNA测序成本的减少,利用人工智能理解癌症细胞的差异和他们的意思为个别病人的治疗。通过我们的研究,我们能够识别特异性基因依赖只使用细胞的DNA序列和RNA水平,可以很容易和廉价获得肿瘤活检样本。


“这是一个令人难以置信的步骤在我们的研究中这意味着我们现在可以努力改进技术,以便它可以提供肿瘤学家,帮助病人治疗途径。”

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癌症治疗主要是规定的基础上的位置和类型的癌症。肿瘤的遗传差异可以使癌症治疗无效的标准。使用个性化的方法来指导治疗可以改善预期寿命、生活质量和减少不必要的副作用的癌症患者。


在每一个细胞,大约有20000个基因,包含制造蛋白质所需的信息。大约1000的基因是必不可少的,这意味着它们是细胞生存所必需的。当正常细胞变成癌细胞,致癌基因(也就是说,这些基因可能导致癌症)成为激活和肿瘤抑制基因灭活,导致细胞的重新布线。这将导致细胞变得依赖于一组新的基因生存,这可以被利用来杀死癌细胞。


通过使用这种新技术目标肿瘤特异相关的基因的蛋白质产物,可以杀死癌细胞,使正常细胞不依赖于这些基因相对安然无恙。尽管依赖关系可以确定使用密集的实验室技术,它是昂贵和耗时,并且不会以这种方式可行分析所有肿瘤样品。


参考:Benstead-Hume G、羊毛SK Renaut J, et al。生物网络拓扑特性预测癌症细胞系的基因相关性。Bioinform。阿德。2022;2 (1):vbac084。doi:10.1093 / bioadv / vbac084


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