艾伦细胞Explorer启动
艾伦细胞科学研究所发起了艾伦细胞Explorer:独一无二的门户和动态数字窗口进入人类细胞。网站结合大规模3 d成像数据,深度学习的第一个应用程序创建预测模型的细胞组织,基因编辑人类干细胞系和日益强大的工具套件。艾伦细胞Explorer将成为未来平台为这些和公开的资源创建和共享的艾伦细胞科学研究所。
“细胞是极其复杂的,与成千上万的移动和交互部分共同推动和调节细胞结构和行为,“里克·霍维茨说,博士,艾伦细胞科学研究所的执行主任。“我们除了兴奋发射艾伦细胞Explorer网站和分享我们的细胞,令人难以置信的图像数据,预测模型和与全球科学界。”
“艾伦细胞Explorer视图到惊人的人类细胞的组织”说艾伦•琼斯博士,总裁兼首席执行官艾伦研究所。“这些免费工具的第一部分从艾伦细胞科学研究所遵循我们的遗产,开始与艾伦脑科学研究所和艾伦大脑图集,创造和分享世界各地强大的开放科学工具,推动创新。”
综合细胞模型中,艾伦的一个特色组成部分细胞Explorer启动,是第一个模型应用深度学习技术来预测人类干细胞的组织。为了创建模型,研究人员通过训练成千上万的高质量图像的计算工具人类干细胞学习他们的组件是如何组织的。目前网站展示比较细胞组织的集成单元模型的预测和实际图像数据,展示了令人印象深刻的模型的预测精度。未来的迭代模型也将允许用户生成和探索这些虚拟细胞在三维空间中。
“这是研究者们第一次使用深度学习,试图了解实际的细胞是如何组织的难以捉摸的问题,”霍维茨说。“漫画我们依靠教科书,这是基于一个艺术家的解释数据相对较少的细胞,最终将取代了数据驱动模型的这种非常大量的细胞。”
一个额外的工具在门户,3 d细胞查看器,提供在线访问最大的公开收集人类干细胞在三维可视化。用户可以查看和操纵成千上万的基因编辑细胞和探索其细胞内的惊人变化organization-even细胞中克隆一个直接在web浏览器,桌面或通过下载数据。
艾伦细胞Explorer还包括获取最先进的生物工具。细胞上的目录包含详细的信息和质量控制措施艾伦研究所的人类干细胞基因编辑,这是社区的一部分可用艾伦细胞收集在柯瑞尔细胞库。开门让更多的研究人员利用基因编辑、质粒用于创建行,说明如何使用它们通过Addgene是可用的。
“最让我激动的事情之一的探险家艾伦的细胞是如何利用细胞更与人类生物学相关的培养细胞的现代生物医学研究使用的必要性,”安妮·e·卡彭特说,博士,成像平台主任广泛哈佛和麻省理工学院。
“作为一个整体,这个公开门户将使研究人员能够问重要的新细胞的变化,以及它们如何改变随着他们的成长,区分和对药物的反应,”霍维茨说。“工作作为一个社区,我们可以应用和扩展这些工具在细胞生物学领域的飞跃,对我们的学习有很大的影响人类健康和疾病的。”
