应用生物系统公司扩大Sequencing-based RNA分析解决方案组合

这项技术有望用于限量发行通过早期访问计划,将于2008年11月开始。该产品将扩大公司的RNA表达分析解决方案组合使用的固体™系统,该公司的超高度大规模基因组分析平台。

预计整个固体™转录组表达工具提供研究人员更大的见解生物通路和分子机制,调节细胞命运决定,发展和疾病进展。这个工具包旨在提供细胞的转录组的新观点,如非编码rna的表达、识别可变剪接事件,表达了snp(单核苷酸多态性)或突变,或易位和融合转录本。工具包的应用应该提前治疗复杂的疾病,如糖尿病、心脏病和癌症,加速时间课程研究中分析微分RNA表达提供了洞察水平和特定治疗的作用机制。

约翰•麦克弗森博士,癌症基因组学主任安大略癌症研究所(OICR)编目基因改变,发生在不同类型的癌症可以更有效的进行肿瘤分类和推动疾病的早期识别的重要事件。他一直在探索不同的方法对于识别两种编码和非编码RNA转录的基因变异影响癌症的形成。OICR将成为客户的网站评估整个转录组工具包。

“我们认识到日益增长的重要性理解改变的表达基因变异导致的形成复杂的疾病,如癌症,”麦克弗森博士说。”的各种技术可用于检测特定疾病的遗传变异的表达水平改变表达式提供了洞察,sequencing-based RNA表达分析提供最具体的测量方法,特别是对于检测各种可能发生的变化,这两个编码和非编码RNA转录。我很感兴趣评估这种新技术应用生物系统公司的RNA表达分析应用程序。”

像最近推出了固体小RNA表达工具,整个转录组工具是基于专有Ambion®技术,预计将为研究人员提供一个创新的工作流程,大大减少了时间,成本,和实验可变性与RNA图书馆相关准备。使用这两种工具预计将减少人员需要准备样品的时间为RNA分析了大约50%,而替代方法。多路复用进一步简化了下游工作流申请RNA分析。例如,使用多路复用能力的装备,10 RNA库可以同时测序,从而减少分析每个样本的成本。此外,技术保存strandedness cDNA研究者可以分辨重叠感或反义链rna转录。

固体系统能产生高达2.4亿的序列读取,每运行或标签,RNA表达分析应用程序。这是最高的证明为sequencing-based RNA表达分析应用程序吞吐量。这个吞吐量是必要保证最高的灵敏度和动态范围为这些类型的应用程序。同时,大量的标记使研究人员能够多路复用样品在一个测序反应,进一步降低成本的这种类型的分析。

目前,全球使用最广泛的方法来分析DNA微阵列的基因表达模式。然而,由于微阵列hybridization-based技术,他们无法检测RNA转录表达水平较低,他们不能用于检测RNA转录从重复序列。此外,微阵列提供有限的动态范围检测细微变化目标基因的表达水平,这是至关重要的在理解生物反应刺激或环境变化。通过支持全球hypothesis-neutral基因表达谱的分析,研究人员使用这个工具能够检测所有已知的和小说RNA存在于生物样品,没有偏见的RNA分子称为probe-based阵列技术。

“全球转录组分析成为一个重要的领域调查研究人员努力有更完整的了解人类基因组,”巴基斯坦井说,总统为应用生物系统公司的分子和细胞生物学基因分析部门。“整个转录组装备会在最近推出的固体小RNA表达工具,提供公司的广泛投资组合分析工具的编码和非编码RNA基因组分析平台。基于积极接待我们收到了小RNA工具包,我们加快开发一套全转录组分析基于同一Ambion技术。”

使用固体全转录组表达工具,研究人员首次分离和净化细胞或组织的总RNA或信使RNA样本。因为整个转录组装备不仅限于人类样本,它也可以用来分析模型生物的转录组在农业研究中应用。核糖体RNA从这些样本,其次是一个RNA分裂的步骤。研究人员然后杂交和结扎适配器这些RNA分数,和一个在双链cDNA逆转录反应结果。由于两个适配器绑定定义的方式,的strandedness cDNA产生的图书馆是守恒的。数据分析工具也将用于早期访问参与者,并访问所有人员在固体系统软件社区网站。

通过开发基因组、表观基因组和转录组分析解决方案的基因组分析平台,应用生物系统公司不断进步的科学,展示其领导,帮助科学家更好地理解生物潜在的健康和疾病。