自动加速细胞分析方法

低温电子断层扫描允许研究人员详细研究的细胞内部的微观结构。研究人员通常需要一个星期的努力,解剖一个细胞的三维结构可以在大约一个小时由于新的自动化方法由一组科学家贝勒医学院和新加坡国立大学。新的方法将允许科学家研究大量和各种细胞类型在更少的时间,导致一个更详细的了解细胞过程和疾病。

“低温电子断层扫描是一种强大的可视化技术的体系结构和结构内部细胞更好100倍分辨率比最好的光学显微镜,”博士说通讯作者史蒂文•Ludtke大分子中心联合成像和生物医学研究中心的计算和综合和贝勒医学院的生物化学教授。

低温电子断层扫描提供了细胞过程的信息,目前无法通过其他方法。科学家可以研究变化在正常或病变细胞以及内部微生物。然而,“一人的努力需要手动标注每个单元格内的所有结构和细节的限制了这一技术的广泛使用,“Ludtke说。

希望增加注释的耗时的过程的效率,Ludtke和他的同事们开发了一个自动化的方法,需要较少的人为参与。他们测试了他们的方法使用不同的细胞类型,包括人类血小板和非洲锥虫和蓝细菌等微生物。新方法与传统的相比时,他们发现新方法正确识别细胞内结构与高水平的准确性。

“新方法减少人类努力从一个星期每个细胞每细胞大约一个小时,“Ludtke说。

研究人员感兴趣的应用这个方法将免费在http://EMAN2.org上找到它,连同一个接口,用于培训。

这篇文章被转载材料所提供的贝勒大学医学院。注:材料可能是长度和内容的编辑。为进一步的信息,请联系引用源。

参考:

陈,M。戴,W。,太阳,s . Y。Jonasch D。,他,c . Y。施密德,m F。,。Ludtke, s . j . (2017)。卷积神经网络自动注释的细胞低温电子x线断层照片。自然的方法。doi: 10.1038 / nmeth.4405