细菌-真菌的相互作用比以前想象的要普遍得多

在一项新颖的、广泛的细菌-真菌相互作用评估中，研究人员使用独特的生物信息学发现，真菌具有显著的细菌多样性，使细菌-真菌相互作用比以前所知的更加普遍和多样化。

“到目前为止，细菌-真菌相互作用的例子在数量和多样性上都非常有限，”洛斯阿拉莫斯国家实验室的生物学家亚伦·罗宾逊说，他是一篇新论文的主要作者，该论文在《自然》《通讯生物学》杂志上描述了这项研究。“人们曾认为细菌-真菌的关联可能并不常见。但我们发现了许多不同的细菌，它们似乎与真菌有关，我们经常检测到这些联系。”

这项研究有助于对真菌菌群的新认识，以及真菌宿主内部和与真菌宿主密切相关的细菌的存在，为更密切地研究相互作用并将研究与生态系统功能和气候变化影响等问题联系起来开辟了可能性。

罗宾逊说:“这是在更亲密的水平上研究细菌-真菌相互作用机制的一个起点。”“这项研究对于理解是什么让细菌与真菌相联系，以及如何最好地利用这种洞察力来实现实验室、能源部和整个社会的目标将是有价值的。了解这些生物如何相互作用并对更大的系统做出贡献，在从气候变化等建模到农业或工业利用微生物等社会有益活动等方方面面都非常有价值。”

研究人员从欧洲、北美和南美的四种培养物中筛选出了294种不同的真菌分离物，以寻找潜在的细菌关联。与洛斯阿拉莫斯集成纳米技术中心的合作使研究人员能够使用荧光原位杂交技术直观地检查这些关联。

这些荧光显微镜检查补充了筛选，并证实了在不同的真菌分离株中，甚至在单个真菌宿主的菌丝(真菌组织)中，广泛和不同的细菌关联存在。

除了筛选培养藏品外，研究小组还从mycosm门户网站筛选了408个真菌基因组测序项目，mycosm门户网站是由能源部联合基因组研究所开发和维护的真菌基因组项目储存库。

在被检查的真菌基因组项目中，有79%检测到细菌特征。在多种情况下，作者恢复了这些细菌的完整或接近完整的基因组。这些真菌相关细菌基因组的恢复允许真菌相关细菌和自由生活细菌之间的比较。

在研究小组检查的702株真菌分离株中，发现了88%的细菌伴生物——相对于以前更有限的研究，这是一个意外的检出率。这些结果揭示了真菌生命树中真菌菌群的复杂性和多样性。

该研究对多种真菌-细菌关联的概述和描述为更深入地理解这些关联提供了一条前进的道路。继续分析相互作用将有助于更全面地了解环境微生物组过程，特别是真菌和细菌对养分循环、植物健康和气候建模的贡献。

在气候条件不断变化的背景下，了解细菌-真菌相互作用如何在不同环境和不同条件(如干旱和变暖)下影响植物、动物和一般生态系统功能，也将有助于预测和潜在地操纵这些相互作用的影响。

参考:罗宾逊AJ, House GL，莫拉莱斯DP，等。真菌菌群内广泛的细菌多样性。Commun杂志．4(1): 2021; 1-13。doi:10.1038 / s42003 - 021 - 02693 - y

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