生物信息学讲师招募本科生解决DNA注释的挑战

在本周出版的《公共科学图书馆·生物学》上,一个马赛大学讲师团队由帕斯卡Hingamp描述Annotathon——一个创新的生物信息学教学方法吸引生物学本科学生。

越来越兴趣宏基因组——不仅仅是单一的解码基因组,但是整个微生物生态系统,产生的数据量比生物学家可以跟上。因此,生物信息学,使用计算机技术来处理生物数据——正变得越来越受欢迎。

Annotathon教学体系旨在培养一个学徒bioinformaticians网络,谁能助手在海洋里每天生成的数据。

这种方法要求学生随机挑选和分析未知的宏基因组DNA片段从一个真正的研究序列储备。只使用网络工具,学生的任务是找出从有机体的DNA来自,,它可能有什么生物功能。

以及获得信心和能力在生物信息学中,学生经验的真实研究过程称重参数,建立预测可靠性、构建假设和维护严格的话语。

离开道路的罐头练习是令人不安的教练,但教学结果的努力都是值得的。“我所做的都与我的学生:re-analyzing朊病毒蛋白年复一年,这些完全不可预知的DNA片段,和潜水”Hingamp说Annotathon软件开发。“这是艰苦的工作,但真正的乐趣在于未知。兴奋抓。”

学生,充分意识到自己的探索知识的边缘,没有安全网,不辜负所面临的挑战和生产高质量的工作。事实上,它们的输出证明足够好反馈到日常研究人员使用的公共数据库。