生物学家开发的全基因组地图miRNA-mRNA交互

纽约大学的研究人员比较功能基因组学中心和加州大学伯克利分校使用计算分析预测微rna基因组地图目标在动物模式生物秀丽隐杆线虫(秀丽隐杆线虫)。

小分子核糖核酸信使RNA结合在一个特定的部分,称为3 'utr,众所周知,以便校准机械计时器。

部分预测地图是通过体内的发展方法证实,问3 ' UTR mrna的一部分是驾驶在开发过程中调节在一个活的有机体。他们的研究发表在最近一期当代生物学。

在映射microrna的目标,研究小组研究了秀丽隐杆线虫的基因组的功能。纽约大学开发的一种算法,使用PicTar秀丽隐杆线虫的研究人员预测microrna的功能基因。

研究人员发现,三分之一的秀丽隐杆线虫microrna基因集相关功能的目标。

看来,microrna对照组的基因可以在一个特定的生物过程。至少10%的秀丽隐杆线虫基因预测microrna的目标。

测试计算预测,纽约大学的团队开发了一个体内分析系统比较记者,的表达绿色荧光蛋白(GFP)携带目标3 ' utr与控制,没有携带目标3 'utrs。

实验室结果证实特定的角色3’utr在抑制基因表达比预测的更广泛的计算分析,表明3’utr包含宇宙的未知基因调控。

成千上万的全基因组预测线虫microrna的目标,或蛔虫,人类,和苍蝇可从PicTar网站并与一个图形网络浏览工具开发的纽约大学中心比较功能基因组学。

这是为了允许勘探的microrna的目标预测的各种功能基因组数据资源。